MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 8280

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_016835	GCG	2	6	390722	390727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704281
7003	NC_016835	GCC	2	6	390743	390748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704281
7004	NC_016835	GCA	2	6	390766	390771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704281
7005	NC_016835	ACC	2	6	390834	390839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704281
7006	NC_016835	AAT	2	6	390853	390858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704281
7007	NC_016835	GCA	2	6	390930	390935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704281
7008	NC_016835	CTGA	2	8	390972	390979	25 %	25 %	25 %	25 %	379704281
7009	NC_016835	GGGT	2	8	391017	391024	0 %	25 %	75 %	0 %	379704281
7010	NC_016835	AAT	2	6	391059	391064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704282
7011	NC_016835	TAA	2	6	391126	391131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704282
7012	NC_016835	T	6	6	391136	391141	0 %	100 %	0 %	0 %	379704282
7013	NC_016835	GCC	2	6	391158	391163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704282
7014	NC_016835	TAC	2	6	391168	391173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704282
7015	NC_016835	CCA	2	6	391174	391179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704282
7016	NC_016835	AAAT	2	8	391245	391252	75 %	25 %	0 %	0 %	379704282
7017	NC_016835	GC	3	6	391372	391377	0 %	0 %	50 %	50 %	379704282
7018	NC_016835	GCCAGT	2	12	391380	391391	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379704282
7019	NC_016835	CTG	2	6	391398	391403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704282
7020	NC_016835	AGAA	2	8	391449	391456	75 %	0 %	25 %	0 %	379704282
7021	NC_016835	AT	3	6	391471	391476	50 %	50 %	0 %	0 %	379704282
7022	NC_016835	GGCA	2	8	391487	391494	25 %	0 %	50 %	25 %	379704282
7023	NC_016835	ATG	2	6	391683	391688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704282
7024	NC_016835	CAC	2	6	391748	391753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704282
7025	NC_016835	CATG	2	8	391866	391873	25 %	25 %	25 %	25 %	379704283
7026	NC_016835	CCG	2	6	391934	391939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704283
7027	NC_016835	CACG	2	8	391959	391966	25 %	0 %	25 %	50 %	379704283
7028	NC_016835	GCC	2	6	391976	391981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704283
7029	NC_016835	GGT	2	6	391989	391994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704283
7030	NC_016835	AAGG	2	8	392026	392033	50 %	0 %	50 %	0 %	379704283
7031	NC_016835	GCG	2	6	392037	392042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704283
7032	NC_016835	GC	3	6	392071	392076	0 %	0 %	50 %	50 %	379704283
7033	NC_016835	GGCG	2	8	392131	392138	0 %	0 %	75 %	25 %	379704283
7034	NC_016835	TAA	2	6	392139	392144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704283
7035	NC_016835	CAC	2	6	392166	392171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704283
7036	NC_016835	GCT	2	6	392187	392192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704283
7037	NC_016835	TGA	2	6	392202	392207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704283
7038	NC_016835	CGT	2	6	392299	392304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704283
7039	NC_016835	GCT	2	6	392376	392381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704283
7040	NC_016835	GGA	2	6	392406	392411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379704283
7041	NC_016835	TGGC	2	8	392467	392474	0 %	25 %	50 %	25 %	379704283
7042	NC_016835	GGC	3	9	392472	392480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704283
7043	NC_016835	CATGC	2	10	392542	392551	20 %	20 %	20 %	40 %	379704283
7044	NC_016835	TGT	2	6	392624	392629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704283
7045	NC_016835	CAG	2	6	392675	392680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704283
7046	NC_016835	CCA	2	6	392700	392705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704283
7047	NC_016835	GCTG	2	8	392717	392724	0 %	25 %	50 %	25 %	379704283
7048	NC_016835	CGC	2	6	392782	392787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704284
7049	NC_016835	ACG	2	6	392788	392793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704284
7050	NC_016835	CGC	2	6	392834	392839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704284
7051	NC_016835	CG	3	6	392846	392851	0 %	0 %	50 %	50 %	379704284
7052	NC_016835	ATA	2	6	392901	392906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704284
7053	NC_016835	CAT	2	6	392954	392959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704284
7054	NC_016835	CCAT	2	8	392987	392994	25 %	25 %	0 %	50 %	379704284
7055	NC_016835	ATG	2	6	393055	393060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704284
7056	NC_016835	AAGC	2	8	393072	393079	50 %	0 %	25 %	25 %	379704284
7057	NC_016835	GC	3	6	393082	393087	0 %	0 %	50 %	50 %	379704284
7058	NC_016835	TGGC	2	8	393118	393125	0 %	25 %	50 %	25 %	379704284
7059	NC_016835	CAC	2	6	393144	393149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704284
7060	NC_016835	GGC	2	6	393153	393158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704284
7061	NC_016835	GCG	2	6	393264	393269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704284
7062	NC_016835	CGA	2	6	393417	393422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704284
7063	NC_016835	CG	3	6	393447	393452	0 %	0 %	50 %	50 %	379704284
7064	NC_016835	TGGC	2	8	393473	393480	0 %	25 %	50 %	25 %	379704284
7065	NC_016835	CG	3	6	393527	393532	0 %	0 %	50 %	50 %	379704284
7066	NC_016835	AGC	2	6	393562	393567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704284
7067	NC_016835	GGCA	2	8	393577	393584	25 %	0 %	50 %	25 %	379704284
7068	NC_016835	GA	3	6	393615	393620	50 %	0 %	50 %	0 %	379704284
7069	NC_016835	CATC	2	8	393629	393636	25 %	25 %	0 %	50 %	379704284
7070	NC_016835	TCT	2	6	393694	393699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704284
7071	NC_016835	GAT	2	6	393792	393797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704284
7072	NC_016835	CGCC	2	8	393901	393908	0 %	0 %	25 %	75 %	379704284
7073	NC_016835	CAC	2	6	393912	393917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704284
7074	NC_016835	TGA	2	6	393942	393947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704284
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7079	NC_016835	GGTTCC	2	12	394282	394293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704284
7080	NC_016835	CATC	2	8	394295	394302	25 %	25 %	0 %	50 %	379704284
7081	NC_016835	ACG	2	6	394451	394456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704285
7082	NC_016835	CAT	2	6	394549	394554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704285
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7088	NC_016835	TCA	2	6	394806	394811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704285
7089	NC_016835	GCG	2	6	394848	394853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704285
7090	NC_016835	TGA	2	6	394907	394912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704285
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7092	NC_016835	TGC	2	6	394985	394990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704285
7093	NC_016835	ATG	2	6	395069	395074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704285
7094	NC_016835	TTC	2	6	395075	395080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704285
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7099	NC_016835	GCGCA	2	10	395419	395428	20 %	0 %	40 %	40 %	379704285
7100	NC_016835	TGA	2	6	395481	395486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704285
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7102	NC_016835	CGATA	2	10	395565	395574	40 %	20 %	20 %	20 %	379704285
7103	NC_016835	TTGA	2	8	395635	395642	25 %	50 %	25 %	0 %	379704285
7104	NC_016835	GTAA	2	8	395656	395663	50 %	25 %	25 %	0 %	379704285
7105	NC_016835	CAT	2	6	395667	395672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704285
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7109	NC_016835	CTT	2	6	395865	395870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704286
7110	NC_016835	TG	3	6	395880	395885	0 %	50 %	50 %	0 %	379704286
7111	NC_016835	GGTCA	2	10	396018	396027	20 %	20 %	40 %	20 %	379704286
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7486	NC_016835	TTG	2	6	417542	417547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704304
7487	NC_016835	GAC	2	6	417563	417568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704304
7488	NC_016835	ATT	2	6	417569	417574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704304
7489	NC_016835	TA	3	6	417587	417592	50 %	50 %	0 %	0 %	379704304
7490	NC_016835	TTTC	2	8	417600	417607	0 %	75 %	0 %	25 %	379704304
7491	NC_016835	CTG	2	6	417657	417662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704304
7492	NC_016835	AT	3	6	417665	417670	50 %	50 %	0 %	0 %	379704304
7493	NC_016835	TGCT	2	8	417685	417692	0 %	50 %	25 %	25 %	379704304
7494	NC_016835	CTTTG	2	10	417706	417715	0 %	60 %	20 %	20 %	379704304
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7499	NC_016835	CAT	2	6	417877	417882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704304
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