MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 8280

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016835	CCATG	2	10	310700	310709	20 %	20 %	20 %	40 %	379704208
5502	NC_016835	GTGA	2	8	310785	310792	25 %	25 %	50 %	0 %	379704208
5503	NC_016835	ATC	2	6	310815	310820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704208
5504	NC_016835	GTG	2	6	310857	310862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704208
5505	NC_016835	ACC	2	6	310920	310925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704208
5506	NC_016835	GGC	2	6	310954	310959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704208
5507	NC_016835	CATGC	2	10	310965	310974	20 %	20 %	20 %	40 %	379704208
5508	NC_016835	GCC	2	6	310983	310988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704208
5509	NC_016835	TCAGC	2	10	311033	311042	20 %	20 %	20 %	40 %	379704208
5510	NC_016835	TGC	2	6	311102	311107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704208
5511	NC_016835	CGG	2	6	311200	311205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704208
5512	NC_016835	CGC	2	6	311231	311236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704208
5513	NC_016835	CGC	2	6	311245	311250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704208
5514	NC_016835	GCG	2	6	311318	311323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704209
5515	NC_016835	GGT	3	9	311373	311381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704209
5516	NC_016835	TG	3	6	311470	311475	0 %	50 %	50 %	0 %	379704209
5517	NC_016835	GC	3	6	311488	311493	0 %	0 %	50 %	50 %	379704209
5518	NC_016835	GAT	2	6	311571	311576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704209
5519	NC_016835	T	6	6	311693	311698	0 %	100 %	0 %	0 %	379704209
5520	NC_016835	TTA	2	6	311740	311745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704209
5521	NC_016835	TGG	2	6	311903	311908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704210
5522	NC_016835	GCC	2	6	311947	311952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704210
5523	NC_016835	GCG	2	6	311959	311964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704210
5524	NC_016835	GTCA	2	8	311965	311972	25 %	25 %	25 %	25 %	379704210
5525	NC_016835	GCA	2	6	312035	312040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704210
5526	NC_016835	TCT	2	6	312048	312053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704210
5527	NC_016835	CTG	2	6	312118	312123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704210
5528	NC_016835	TGC	2	6	312203	312208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704210
5529	NC_016835	TCC	2	6	312333	312338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379704210
5530	NC_016835	CCGG	2	8	312342	312349	0 %	0 %	50 %	50 %	379704210
5531	NC_016835	TGA	2	6	312381	312386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704210
5532	NC_016835	CCG	2	6	312402	312407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704210
5533	NC_016835	GCG	2	6	312418	312423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704210
5534	NC_016835	GGAA	2	8	312480	312487	50 %	0 %	50 %	0 %	379704210
5535	NC_016835	TGGTC	2	10	312495	312504	0 %	40 %	40 %	20 %	379704210
5536	NC_016835	TGGC	2	8	312563	312570	0 %	25 %	50 %	25 %	379704210
5537	NC_016835	GCA	2	6	312585	312590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704210
5538	NC_016835	TGA	2	6	312656	312661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704210
5539	NC_016835	TGT	2	6	312701	312706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704210
5540	NC_016835	TGA	2	6	312720	312725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704210
5541	NC_016835	TGC	2	6	312954	312959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704211
5542	NC_016835	CAG	2	6	312980	312985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704211
5543	NC_016835	AGC	2	6	313005	313010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704211
5544	NC_016835	GCC	2	6	313050	313055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704211
5545	NC_016835	TCA	2	6	313059	313064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704211
5546	NC_016835	GAA	2	6	313103	313108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704211
5547	NC_016835	CGT	3	9	313153	313161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704211
5548	NC_016835	TCG	2	6	313201	313206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704211
5549	NC_016835	TAAGCA	2	12	313282	313293	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379704211
5550	NC_016835	CTT	2	6	313321	313326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704211
5551	NC_016835	TGC	2	6	313348	313353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704211
5552	NC_016835	GGATAC	2	12	313503	313514	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379704211
5553	NC_016835	T	6	6	313520	313525	0 %	100 %	0 %	0 %	379704211
5554	NC_016835	GCA	2	6	313603	313608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704211
5555	NC_016835	CCAG	2	8	313656	313663	25 %	0 %	25 %	50 %	379704211
5556	NC_016835	TTGCA	2	10	313664	313673	20 %	40 %	20 %	20 %	379704211
5557	NC_016835	GC	3	6	313685	313690	0 %	0 %	50 %	50 %	379704211
5558	NC_016835	AGT	2	6	313860	313865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704212
5559	NC_016835	GGC	2	6	313896	313901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704212
5560	NC_016835	GC	3	6	313900	313905	0 %	0 %	50 %	50 %	379704212
5561	NC_016835	GCA	2	6	313913	313918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704212
5562	NC_016835	CG	3	6	313948	313953	0 %	0 %	50 %	50 %	379704212
5563	NC_016835	AAC	3	9	313955	313963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704212
5564	NC_016835	CG	3	6	313991	313996	0 %	0 %	50 %	50 %	379704212
5565	NC_016835	GTG	2	6	313999	314004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704212
5566	NC_016835	GGGCA	2	10	314016	314025	20 %	0 %	60 %	20 %	379704212
5567	NC_016835	ATGA	2	8	314050	314057	50 %	25 %	25 %	0 %	379704212
5568	NC_016835	TGG	2	6	314291	314296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704212
5569	NC_016835	GCG	2	6	314335	314340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704212
5570	NC_016835	GCC	2	6	314366	314371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704212
5571	NC_016835	ACA	2	6	314394	314399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704212
5572	NC_016835	TGG	2	6	314495	314500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704212
5573	NC_016835	CGG	2	6	314537	314542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704212
5574	NC_016835	GGCG	2	8	314544	314551	0 %	0 %	75 %	25 %	379704212
5575	NC_016835	TATC	2	8	314559	314566	25 %	50 %	0 %	25 %	379704212
5576	NC_016835	GAA	2	6	314572	314577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704212
5577	NC_016835	CGGC	2	8	314584	314591	0 %	0 %	50 %	50 %	379704212
5578	NC_016835	GTG	2	6	314628	314633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704212
5579	NC_016835	TAC	2	6	314659	314664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704212
5580	NC_016835	CAG	2	6	315075	315080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704213
5581	NC_016835	CGA	2	6	315092	315097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704213
5582	NC_016835	CAC	2	6	315123	315128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704213
5583	NC_016835	C	6	6	315130	315135	0 %	0 %	0 %	100 %	379704213
5584	NC_016835	GCA	2	6	315160	315165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704213
5585	NC_016835	ATG	2	6	315202	315207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704213
5586	NC_016835	GTG	2	6	315208	315213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704213
5587	NC_016835	GCA	2	6	315214	315219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704213
5588	NC_016835	GAAG	2	8	315254	315261	50 %	0 %	50 %	0 %	379704213
5589	NC_016835	TCT	2	6	315355	315360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704213
5590	NC_016835	CAG	3	9	315411	315419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704213
5591	NC_016835	ATA	2	6	315448	315453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704213
5592	NC_016835	CTGG	2	8	315456	315463	0 %	25 %	50 %	25 %	379704213
5593	NC_016835	TACG	2	8	316200	316207	25 %	25 %	25 %	25 %	379704214
5594	NC_016835	CCG	2	6	316302	316307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704214
5595	NC_016835	AAT	2	6	316336	316341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704214
5596	NC_016835	GGAA	2	8	316347	316354	50 %	0 %	50 %	0 %	379704214
5597	NC_016835	GTTG	2	8	316374	316381	0 %	50 %	50 %	0 %	379704214
5598	NC_016835	AAG	2	6	316400	316405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704214
5599	NC_016835	AATTC	2	10	316427	316436	40 %	40 %	0 %	20 %	379704214
5600	NC_016835	TC	3	6	316448	316453	0 %	50 %	0 %	50 %	379704214
5601	NC_016835	CTT	2	6	316492	316497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704214
5602	NC_016835	GTTG	2	8	316563	316570	0 %	50 %	50 %	0 %	379704214
5603	NC_016835	ATT	2	6	316572	316577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704214
5604	NC_016835	CAGG	2	8	316665	316672	25 %	0 %	50 %	25 %	379704215
5605	NC_016835	ATT	2	6	316689	316694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704215
5606	NC_016835	ATA	2	6	316696	316701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704215
5607	NC_016835	CCG	2	6	316712	316717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704215
5608	NC_016835	TAA	2	6	316730	316735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704215
5609	NC_016835	GC	3	6	316821	316826	0 %	0 %	50 %	50 %	379704215
5610	NC_016835	GCC	2	6	316830	316835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704215
5611	NC_016835	TCT	2	6	316851	316856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704215
5612	NC_016835	TCC	2	6	316902	316907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379704215
5613	NC_016835	AGC	2	6	316935	316940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704215
5614	NC_016835	AAAG	2	8	316979	316986	75 %	0 %	25 %	0 %	379704215
5615	NC_016835	GCT	2	6	316988	316993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704215
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