MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 86201

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_016818	CTGA	2	8	1015490	1015497	25 %	25 %	25 %	25 %	383188880
18003	NC_016818	GCTG	2	8	1015549	1015556	0 %	25 %	50 %	25 %	383188881
18004	NC_016818	GCT	2	6	1015568	1015573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188881
18005	NC_016818	GGC	2	6	1015577	1015582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188881
18006	NC_016818	ATT	2	6	1015583	1015588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188881
18007	NC_016818	TGC	2	6	1015594	1015599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188881
18008	NC_016818	CAG	2	6	1015616	1015621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188881
18009	NC_016818	GCA	2	6	1015640	1015645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188881
18010	NC_016818	CGC	2	6	1015726	1015731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188881
18011	NC_016818	GCT	2	6	1015752	1015757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188881
18012	NC_016818	CAG	2	6	1015827	1015832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188881
18013	NC_016818	CTT	3	9	1015844	1015852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188881
18014	NC_016818	CAG	2	6	1015900	1015905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188881
18015	NC_016818	CAG	2	6	1016025	1016030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188881
18016	NC_016818	AGC	2	6	1016031	1016036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188881
18017	NC_016818	GCTG	2	8	1016059	1016066	0 %	25 %	50 %	25 %	383188881
18018	NC_016818	ACATC	2	10	1016134	1016143	40 %	20 %	0 %	40 %	383188881
18019	NC_016818	AAAC	2	8	1016148	1016155	75 %	0 %	0 %	25 %	383188881
18020	NC_016818	GCCA	2	8	1016250	1016257	25 %	0 %	25 %	50 %	383188881
18021	NC_016818	GC	3	6	1016380	1016385	0 %	0 %	50 %	50 %	383188881
18022	NC_016818	CTGA	2	8	1016493	1016500	25 %	25 %	25 %	25 %	383188881
18023	NC_016818	GAA	2	6	1016543	1016548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188881
18024	NC_016818	GCT	2	6	1016573	1016578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188881
18025	NC_016818	GAC	2	6	1016579	1016584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188881
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18027	NC_016818	TGC	2	6	1016602	1016607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188881
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18030	NC_016818	CTGGC	2	10	1016763	1016772	0 %	20 %	40 %	40 %	383188881
18031	NC_016818	TGG	2	6	1016821	1016826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188881
18032	NC_016818	ATG	2	6	1016854	1016859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188881
18033	NC_016818	CCGG	2	8	1016883	1016890	0 %	0 %	50 %	50 %	383188881
18034	NC_016818	CAG	3	9	1016895	1016903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188881
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18036	NC_016818	TGG	2	6	1016953	1016958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188881
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18039	NC_016818	GC	4	8	1017113	1017120	0 %	0 %	50 %	50 %	383188881
18040	NC_016818	GCA	2	6	1017140	1017145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188881
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18042	NC_016818	GGC	2	6	1017314	1017319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188881
18043	NC_016818	GCTG	2	8	1017320	1017327	0 %	25 %	50 %	25 %	383188881
18044	NC_016818	GATC	2	8	1017350	1017357	25 %	25 %	25 %	25 %	383188881
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18046	NC_016818	TTGT	2	8	1017478	1017485	0 %	75 %	25 %	0 %	383188881
18047	NC_016818	CTG	2	6	1017564	1017569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188881
18048	NC_016818	CG	3	6	1017625	1017630	0 %	0 %	50 %	50 %	383188881
18049	NC_016818	ACG	2	6	1017639	1017644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188881
18050	NC_016818	GTTCA	2	10	1017704	1017713	20 %	40 %	20 %	20 %	383188881
18051	NC_016818	CAG	2	6	1017725	1017730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188881
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18053	NC_016818	A	6	6	1017813	1017818	100 %	0 %	0 %	0 %	383188881
18054	NC_016818	CTGC	2	8	1017833	1017840	0 %	25 %	25 %	50 %	383188882
18055	NC_016818	GTCA	2	8	1017965	1017972	25 %	25 %	25 %	25 %	383188882
18056	NC_016818	GCA	2	6	1017973	1017978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188882
18057	NC_016818	ACA	2	6	1018006	1018011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188882
18058	NC_016818	TGC	2	6	1018023	1018028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188882
18059	NC_016818	GCC	2	6	1018222	1018227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188882
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18061	NC_016818	ATTT	2	8	1018398	1018405	25 %	75 %	0 %	0 %	383188883
18062	NC_016818	GAA	2	6	1018515	1018520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188883
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18064	NC_016818	AAC	2	6	1018596	1018601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188883
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18088	NC_016818	TTA	2	6	1020012	1020017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188884
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18105	NC_016818	GC	3	6	1020919	1020924	0 %	0 %	50 %	50 %	383188886
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18111	NC_016818	GAT	2	6	1021181	1021186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188886
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18116	NC_016818	GAA	2	6	1021344	1021349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188886
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18223	NC_016818	CCGCA	2	10	1027421	1027430	20 %	0 %	20 %	60 %	383188892
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18225	NC_016818	CAG	2	6	1027480	1027485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188892
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18228	NC_016818	GTTT	2	8	1027560	1027567	0 %	75 %	25 %	0 %	383188892
18229	NC_016818	TGC	2	6	1027638	1027643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188892
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18347	NC_016818	GCC	2	6	1033914	1033919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188898
18348	NC_016818	GCA	2	6	1033934	1033939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188898
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18461	NC_016818	ATTTT	2	10	1040003	1040012	20 %	80 %	0 %	0 %	383188906
18462	NC_016818	CGA	2	6	1040022	1040027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188906
18463	NC_016818	TGA	2	6	1040030	1040035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188906
18464	NC_016818	ACA	2	6	1040039	1040044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188906
18465	NC_016818	GCG	2	6	1040066	1040071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188906
18466	NC_016818	GCC	2	6	1040090	1040095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188906
18467	NC_016818	TGA	2	6	1040136	1040141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188906
18468	NC_016818	GC	3	6	1040285	1040290	0 %	0 %	50 %	50 %	383188906
18469	NC_016818	CGC	2	6	1040295	1040300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188906
18470	NC_016818	CTG	2	6	1040326	1040331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188906
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18473	NC_016818	GAA	2	6	1040434	1040439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188906
18474	NC_016818	TGG	2	6	1040441	1040446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188906
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18477	NC_016818	TGC	2	6	1040546	1040551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188906
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18479	NC_016818	GCCGC	2	10	1040605	1040614	0 %	0 %	40 %	60 %	383188906
18480	NC_016818	TTC	2	6	1040643	1040648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188906
18481	NC_016818	TGC	2	6	1040684	1040689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188906
18482	NC_016818	TCA	2	6	1040721	1040726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188906
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18484	NC_016818	TATGAA	2	12	1041030	1041041	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383188907
18485	NC_016818	TTC	2	6	1041391	1041396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188907
18486	NC_016818	GC	3	6	1041410	1041415	0 %	0 %	50 %	50 %	383188907
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18488	NC_016818	ACTG	2	8	1041495	1041502	25 %	25 %	25 %	25 %	383188907
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18490	NC_016818	TGG	3	9	1041605	1041613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188907
18491	NC_016818	AAGAC	2	10	1041752	1041761	60 %	0 %	20 %	20 %	383188907
18492	NC_016818	CTGC	2	8	1041799	1041806	0 %	25 %	25 %	50 %	383188907
18493	NC_016818	GC	3	6	1041869	1041874	0 %	0 %	50 %	50 %	383188908
18494	NC_016818	CTG	2	6	1041895	1041900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188908
18495	NC_016818	ACC	2	6	1041913	1041918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188908
18496	NC_016818	GCG	2	6	1041968	1041973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188908
18497	NC_016818	TGCG	2	8	1042004	1042011	0 %	25 %	50 %	25 %	383188908
18498	NC_016818	GCCA	2	8	1042086	1042093	25 %	0 %	25 %	50 %	383188908
18499	NC_016818	CTG	2	6	1042126	1042131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188908
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