MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 86201

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_016818	GTT	2	6	835215	835220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188717
15003	NC_016818	TGC	2	6	835274	835279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188717
15004	NC_016818	CGC	2	6	835343	835348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188717
15005	NC_016818	TGG	2	6	835385	835390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188717
15006	NC_016818	ACCGGA	2	12	835395	835406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188717
15007	NC_016818	ATG	2	6	835414	835419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188717
15008	NC_016818	CTT	2	6	835433	835438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188717
15009	NC_016818	TCT	2	6	835495	835500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188717
15010	NC_016818	ATC	2	6	835519	835524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188717
15011	NC_016818	TGGT	2	8	835751	835758	0 %	50 %	50 %	0 %	383188718
15012	NC_016818	GGT	2	6	835788	835793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188718
15013	NC_016818	TTCA	2	8	835798	835805	25 %	50 %	0 %	25 %	383188718
15014	NC_016818	CA	3	6	836280	836285	50 %	0 %	0 %	50 %	383188719
15015	NC_016818	CTT	2	6	836327	836332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188719
15016	NC_016818	CCA	2	6	836333	836338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188719
15017	NC_016818	CGAC	2	8	836345	836352	25 %	0 %	25 %	50 %	383188719
15018	NC_016818	GGC	2	6	836628	836633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188719
15019	NC_016818	TGC	2	6	836743	836748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188719
15020	NC_016818	GCA	2	6	836750	836755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188719
15021	NC_016818	GCT	2	6	836880	836885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188719
15022	NC_016818	CCG	2	6	836916	836921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188720
15023	NC_016818	GCG	2	6	836955	836960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188720
15024	NC_016818	TGT	2	6	836961	836966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188720
15025	NC_016818	TGC	2	6	836979	836984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188720
15026	NC_016818	CCA	2	6	837009	837014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188720
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15028	NC_016818	CCGGTG	2	12	837183	837194	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383188720
15029	NC_016818	CG	4	8	837333	837340	0 %	0 %	50 %	50 %	383188720
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15032	NC_016818	GC	3	6	837417	837422	0 %	0 %	50 %	50 %	383188720
15033	NC_016818	CGT	3	9	837453	837461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188720
15034	NC_016818	GCA	2	6	837474	837479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188720
15035	NC_016818	CAGTT	2	10	837500	837509	20 %	40 %	20 %	20 %	383188720
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15038	NC_016818	GCTG	2	8	837696	837703	0 %	25 %	50 %	25 %	383188720
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15043	NC_016818	A	6	6	837978	837983	100 %	0 %	0 %	0 %	383188720
15044	NC_016818	CAG	2	6	837988	837993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188720
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15054	NC_016818	CGCT	2	8	838402	838409	0 %	25 %	25 %	50 %	383188720
15055	NC_016818	ATG	2	6	838420	838425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188720
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15058	NC_016818	ACC	2	6	838490	838495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188720
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15241	NC_016818	GCA	2	6	849634	849639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188730
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15246	NC_016818	TCG	2	6	849985	849990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188730
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15250	NC_016818	CTGG	2	8	850088	850095	0 %	25 %	50 %	25 %	383188730
15251	NC_016818	CTG	2	6	850134	850139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188730
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15302	NC_016818	A	6	6	852668	852673	100 %	0 %	0 %	0 %	383188731
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15304	NC_016818	CCAG	2	8	852843	852850	25 %	0 %	25 %	50 %	383188731
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15320	NC_016818	GCC	2	6	854164	854169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188733
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15341	NC_016818	TAA	2	6	855516	855521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188735
15342	NC_016818	ATAA	2	8	855529	855536	75 %	25 %	0 %	0 %	383188735
15343	NC_016818	ACA	2	6	855539	855544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188735
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15347	NC_016818	CTG	2	6	855699	855704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188735
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15350	NC_016818	TGA	2	6	855999	856004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188736
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15356	NC_016818	TCA	2	6	856262	856267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188736
15357	NC_016818	TGA	3	9	856362	856370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188736
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15359	NC_016818	TGG	2	6	856439	856444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188736
15360	NC_016818	TTC	2	6	856555	856560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188737
15361	NC_016818	CTGG	2	8	856591	856598	0 %	25 %	50 %	25 %	383188737
15362	NC_016818	GCTGA	2	10	856678	856687	20 %	20 %	40 %	20 %	383188737
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15364	NC_016818	CCG	2	6	856749	856754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188737
15365	NC_016818	CCAG	3	12	856778	856789	25 %	0 %	25 %	50 %	383188737
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15369	NC_016818	GCCA	2	8	856964	856971	25 %	0 %	25 %	50 %	383188737
15370	NC_016818	TTC	2	6	857008	857013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188737
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15435	NC_016818	CGT	2	6	860029	860034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188741
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15441	NC_016818	TGC	2	6	860182	860187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188742
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15462	NC_016818	TCG	2	6	861118	861123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188743
15463	NC_016818	GCT	2	6	861164	861169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188743
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15465	NC_016818	GGC	2	6	861263	861268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188743
15466	NC_016818	CG	3	6	861271	861276	0 %	0 %	50 %	50 %	383188743
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15469	NC_016818	TGGCG	2	10	861467	861476	0 %	20 %	60 %	20 %	383188743
15470	NC_016818	ATCTGG	2	12	861565	861576	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383188743
15471	NC_016818	CGT	2	6	861599	861604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188743
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15473	NC_016818	CAT	2	6	861626	861631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188743
15474	NC_016818	GCT	2	6	861689	861694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188743
15475	NC_016818	TGC	2	6	861767	861772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188743
15476	NC_016818	GAT	2	6	861783	861788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188743
15477	NC_016818	GGTG	2	8	861794	861801	0 %	25 %	75 %	0 %	383188743
15478	NC_016818	CCG	2	6	861875	861880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188743
15479	NC_016818	TG	3	6	861919	861924	0 %	50 %	50 %	0 %	383188743
15480	NC_016818	CCGG	2	8	862037	862044	0 %	0 %	50 %	50 %	383188743
15481	NC_016818	CGG	2	6	862060	862065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188743
15482	NC_016818	TGA	3	9	862156	862164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188743
15483	NC_016818	CGG	2	6	862169	862174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188743
15484	NC_016818	GCC	2	6	862185	862190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188743
15485	NC_016818	CGA	2	6	862217	862222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188743
15486	NC_016818	TGGTC	2	10	862285	862294	0 %	40 %	40 %	20 %	383188743
15487	NC_016818	TGC	2	6	862342	862347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188743
15488	NC_016818	CGG	2	6	862352	862357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188743
15489	NC_016818	CTG	2	6	862422	862427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188743
15490	NC_016818	TGA	2	6	862447	862452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188743
15491	NC_016818	CGG	3	9	862463	862471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188743
15492	NC_016818	CAG	2	6	862523	862528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188743
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15494	NC_016818	ATG	2	6	862836	862841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188744
15495	NC_016818	AAGA	2	8	862844	862851	75 %	0 %	25 %	0 %	383188744
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15497	NC_016818	GTT	2	6	862972	862977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188744
15498	NC_016818	CTG	2	6	863003	863008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188744
15499	NC_016818	GAT	2	6	863027	863032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188744
15500	NC_016818	CCG	2	6	863101	863106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188744

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