MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 86201

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016818	CAG	3	9	722085	722093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188616
13002	NC_016818	TGC	2	6	722168	722173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188616
13003	NC_016818	ACA	2	6	722174	722179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188616
13004	NC_016818	GCC	2	6	722206	722211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188616
13005	NC_016818	GTG	2	6	722215	722220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188616
13006	NC_016818	TG	3	6	722224	722229	0 %	50 %	50 %	0 %	383188616
13007	NC_016818	GCG	2	6	722237	722242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188616
13008	NC_016818	CGC	3	9	722271	722279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188616
13009	NC_016818	TTCA	2	8	722352	722359	25 %	50 %	0 %	25 %	383188616
13010	NC_016818	GCTG	2	8	722402	722409	0 %	25 %	50 %	25 %	383188616
13011	NC_016818	TTTC	2	8	722432	722439	0 %	75 %	0 %	25 %	383188616
13012	NC_016818	GCC	2	6	722475	722480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188616
13013	NC_016818	GGC	2	6	722483	722488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188616
13014	NC_016818	ATT	2	6	722598	722603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188616
13015	NC_016818	TGC	2	6	722686	722691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188616
13016	NC_016818	GTT	2	6	722727	722732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188616
13017	NC_016818	ATG	2	6	722884	722889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188616
13018	NC_016818	CAG	2	6	722892	722897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188616
13019	NC_016818	CTGC	2	8	722933	722940	0 %	25 %	25 %	50 %	383188616
13020	NC_016818	GCG	2	6	722951	722956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188616
13021	NC_016818	CGC	2	6	723048	723053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188616
13022	NC_016818	GC	3	6	723059	723064	0 %	0 %	50 %	50 %	383188616
13023	NC_016818	T	6	6	723066	723071	0 %	100 %	0 %	0 %	383188616
13024	NC_016818	CTG	2	6	723150	723155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188616
13025	NC_016818	CTT	2	6	723158	723163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188616
13026	NC_016818	CGG	2	6	723265	723270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188616
13027	NC_016818	CAA	2	6	723363	723368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188616
13028	NC_016818	TGG	2	6	723374	723379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188616
13029	NC_016818	AACG	2	8	723381	723388	50 %	0 %	25 %	25 %	383188616
13030	NC_016818	GTC	2	6	723600	723605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188616
13031	NC_016818	GCTG	2	8	723608	723615	0 %	25 %	50 %	25 %	383188616
13032	NC_016818	TGC	2	6	723659	723664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188616
13033	NC_016818	ATA	2	6	723769	723774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188616
13034	NC_016818	CAC	2	6	723822	723827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188616
13035	NC_016818	AAG	2	6	723829	723834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188616
13036	NC_016818	AGC	2	6	723841	723846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188616
13037	NC_016818	CAGGAT	2	12	723870	723881	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383188616
13038	NC_016818	CAT	2	6	723882	723887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188616
13039	NC_016818	AAT	2	6	723974	723979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188617
13040	NC_016818	GAC	2	6	724010	724015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188617
13041	NC_016818	GC	3	6	724071	724076	0 %	0 %	50 %	50 %	383188617
13042	NC_016818	AGA	2	6	724142	724147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188617
13043	NC_016818	ACC	2	6	724188	724193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188617
13044	NC_016818	CGA	2	6	724196	724201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188617
13045	NC_016818	GCG	2	6	724237	724242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188617
13046	NC_016818	CAG	3	9	724248	724256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188617
13047	NC_016818	GCA	2	6	724293	724298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188617
13048	NC_016818	CGT	2	6	724380	724385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188617
13049	NC_016818	GCC	2	6	724437	724442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188617
13050	NC_016818	TGG	2	6	724489	724494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188617
13051	NC_016818	TGC	2	6	724513	724518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188617
13052	NC_016818	CTG	2	6	724536	724541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188617
13053	NC_016818	TCC	2	6	724563	724568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383188617
13054	NC_016818	GCT	2	6	724625	724630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188617
13055	NC_016818	TGC	2	6	724633	724638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188617
13056	NC_016818	CG	4	8	724668	724675	0 %	0 %	50 %	50 %	383188617
13057	NC_016818	GCG	2	6	724689	724694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188617
13058	NC_016818	GCG	2	6	724750	724755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188617
13059	NC_016818	TTA	2	6	724763	724768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188617
13060	NC_016818	TCTGAA	2	12	724781	724792	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383188617
13061	NC_016818	CG	3	6	724801	724806	0 %	0 %	50 %	50 %	383188617
13062	NC_016818	TGG	2	6	724843	724848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188617
13063	NC_016818	CTGG	2	8	724862	724869	0 %	25 %	50 %	25 %	383188617
13064	NC_016818	TGG	2	6	724981	724986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188617
13065	NC_016818	AAT	2	6	725010	725015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188617
13066	NC_016818	CTT	2	6	725033	725038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188617
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13068	NC_016818	GGC	2	6	725078	725083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188617
13069	NC_016818	GCG	2	6	725122	725127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188617
13070	NC_016818	CTG	2	6	725128	725133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188617
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13080	NC_016818	GCT	2	6	725594	725599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188618
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13083	NC_016818	TGA	2	6	725627	725632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188618
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13089	NC_016818	GTG	2	6	725802	725807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188618
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13097	NC_016818	GTG	2	6	726201	726206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188618
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13101	NC_016818	CG	3	6	726343	726348	0 %	0 %	50 %	50 %	383188618
13102	NC_016818	AAG	2	6	726430	726435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188618
13103	NC_016818	CGA	2	6	726542	726547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188618
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13116	NC_016818	GC	3	6	727188	727193	0 %	0 %	50 %	50 %	383188618
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13355	NC_016818	TCC	2	6	740556	740561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383188629
13356	NC_016818	GCGG	2	8	740563	740570	0 %	0 %	75 %	25 %	383188629
13357	NC_016818	AAC	2	6	740616	740621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188629
13358	NC_016818	CAGA	2	8	740623	740630	50 %	0 %	25 %	25 %	383188629
13359	NC_016818	AGC	2	6	740670	740675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188629
13360	NC_016818	CGA	2	6	740677	740682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188629
13361	NC_016818	GCC	2	6	740699	740704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188629
13362	NC_016818	GAC	2	6	740708	740713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188629
13363	NC_016818	CCG	2	6	740749	740754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188629
13364	NC_016818	CGA	2	6	740776	740781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188629
13365	NC_016818	TTG	2	6	740814	740819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188629
13366	NC_016818	TGG	2	6	740835	740840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188629
13367	NC_016818	TTC	2	6	740845	740850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188629
13368	NC_016818	TGC	2	6	740880	740885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188629
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13370	NC_016818	TGCG	2	8	740982	740989	0 %	25 %	50 %	25 %	383188629
13371	NC_016818	AAC	2	6	741006	741011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188629
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13374	NC_016818	GCCGG	2	10	741137	741146	0 %	0 %	60 %	40 %	383188629
13375	NC_016818	GCA	2	6	741187	741192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188629
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13377	NC_016818	GAA	2	6	741308	741313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188629
13378	NC_016818	CTG	2	6	741323	741328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188629
13379	NC_016818	GCA	2	6	741340	741345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188629
13380	NC_016818	A	6	6	741350	741355	100 %	0 %	0 %	0 %	383188629
13381	NC_016818	GGC	2	6	741398	741403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188629
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13383	NC_016818	GGC	2	6	741424	741429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188629
13384	NC_016818	GGT	2	6	741445	741450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188629
13385	NC_016818	GCT	2	6	741464	741469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188629
13386	NC_016818	GCC	2	6	741549	741554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188629
13387	NC_016818	AAC	2	6	741560	741565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188629
13388	NC_016818	CAG	2	6	741596	741601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188629
13389	NC_016818	CAGC	2	8	741643	741650	25 %	0 %	25 %	50 %	383188629
13390	NC_016818	CAG	2	6	741719	741724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188629
13391	NC_016818	GGT	2	6	741802	741807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188629
13392	NC_016818	TCA	2	6	741814	741819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188629
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13394	NC_016818	GACT	2	8	741916	741923	25 %	25 %	25 %	25 %	383188630
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13403	NC_016818	CAT	2	6	742238	742243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188630
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13405	NC_016818	CGG	2	6	742298	742303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188630
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13409	NC_016818	ATCT	2	8	742494	742501	25 %	50 %	0 %	25 %	383188630
13410	NC_016818	TGC	2	6	742567	742572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188630
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13419	NC_016818	CTG	2	6	742903	742908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188631
13420	NC_016818	GTC	2	6	742958	742963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188631
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13422	NC_016818	CTG	2	6	743062	743067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188631
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13427	NC_016818	TGG	2	6	743339	743344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188631
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13433	NC_016818	CGCTGG	2	12	743750	743761	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383188631
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13455	NC_016818	A	6	6	744716	744721	100 %	0 %	0 %	0 %	383188632
13456	NC_016818	GCC	2	6	744772	744777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188632
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13459	NC_016818	TAT	2	6	744862	744867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188632
13460	NC_016818	ACAG	2	8	745027	745034	50 %	0 %	25 %	25 %	383188633
13461	NC_016818	GGGT	2	8	745068	745075	0 %	25 %	75 %	0 %	383188633
13462	NC_016818	TCT	2	6	745088	745093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188633
13463	NC_016818	CTGG	2	8	745095	745102	0 %	25 %	50 %	25 %	383188633
13464	NC_016818	T	7	7	745142	745148	0 %	100 %	0 %	0 %	383188633
13465	NC_016818	T	6	6	745168	745173	0 %	100 %	0 %	0 %	383188633
13466	NC_016818	GCATT	2	10	745205	745214	20 %	40 %	20 %	20 %	383188633
13467	NC_016818	CGG	2	6	745250	745255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188633
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13469	NC_016818	CTGG	2	8	745307	745314	0 %	25 %	50 %	25 %	383188633
13470	NC_016818	TGGC	2	8	745520	745527	0 %	25 %	50 %	25 %	383188634
13471	NC_016818	ATG	2	6	745582	745587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188634
13472	NC_016818	CAA	2	6	745599	745604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188634
13473	NC_016818	TAA	2	6	745607	745612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188634
13474	NC_016818	CGA	2	6	745655	745660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188634
13475	NC_016818	CGG	2	6	745667	745672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188634
13476	NC_016818	AGA	2	6	745685	745690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188634
13477	NC_016818	CGCA	2	8	745694	745701	25 %	0 %	25 %	50 %	383188634
13478	NC_016818	GCA	2	6	745771	745776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188634
13479	NC_016818	AAC	2	6	745788	745793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188634
13480	NC_016818	GCAG	2	8	745879	745886	25 %	0 %	50 %	25 %	383188635
13481	NC_016818	CGG	2	6	745912	745917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188635
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13493	NC_016818	CCTG	2	8	746343	746350	0 %	25 %	25 %	50 %	383188635
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