MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 86201

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_016818	GCA	2	6	607124	607129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188520
11002	NC_016818	GCC	2	6	607145	607150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188520
11003	NC_016818	TTC	2	6	607174	607179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188520
11004	NC_016818	GCG	2	6	607242	607247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188520
11005	NC_016818	CAG	2	6	607249	607254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188520
11006	NC_016818	GCC	2	6	607708	607713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188521
11007	NC_016818	TAT	2	6	607752	607757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188521
11008	NC_016818	GAA	2	6	607758	607763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188521
11009	NC_016818	GAT	2	6	607781	607786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188521
11010	NC_016818	CAT	2	6	607835	607840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188521
11011	NC_016818	TTG	2	6	607945	607950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188521
11012	NC_016818	TG	3	6	608001	608006	0 %	50 %	50 %	0 %	383188521
11013	NC_016818	CGC	3	9	608018	608026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188521
11014	NC_016818	GAT	2	6	608060	608065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188521
11015	NC_016818	GGC	3	9	608082	608090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188521
11016	NC_016818	CAC	2	6	608109	608114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188521
11017	NC_016818	GGA	2	6	608228	608233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188521
11018	NC_016818	GCG	2	6	608245	608250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188521
11019	NC_016818	CCG	2	6	608260	608265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188521
11020	NC_016818	TGG	2	6	608287	608292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188521
11021	NC_016818	TGT	2	6	608296	608301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188521
11022	NC_016818	CACG	2	8	608329	608336	25 %	0 %	25 %	50 %	383188521
11023	NC_016818	GAT	2	6	608378	608383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188521
11024	NC_016818	GT	3	6	608398	608403	0 %	50 %	50 %	0 %	383188521
11025	NC_016818	GGA	2	6	608438	608443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188521
11026	NC_016818	GGA	2	6	608468	608473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188521
11027	NC_016818	TGC	2	6	608506	608511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188521
11028	NC_016818	CAT	2	6	608527	608532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188521
11029	NC_016818	AGC	2	6	608548	608553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188521
11030	NC_016818	T	6	6	608626	608631	0 %	100 %	0 %	0 %	383188522
11031	NC_016818	TTGGC	2	10	608665	608674	0 %	40 %	40 %	20 %	383188522
11032	NC_016818	CTTCT	2	10	608720	608729	0 %	60 %	0 %	40 %	383188522
11033	NC_016818	CCG	2	6	608731	608736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188522
11034	NC_016818	ACC	2	6	608754	608759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188522
11035	NC_016818	GAA	2	6	608895	608900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188522
11036	NC_016818	ATC	2	6	608915	608920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188522
11037	NC_016818	GC	3	6	608932	608937	0 %	0 %	50 %	50 %	383188522
11038	NC_016818	CCA	2	6	608986	608991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188522
11039	NC_016818	CAG	2	6	609017	609022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188522
11040	NC_016818	T	6	6	609041	609046	0 %	100 %	0 %	0 %	383188522
11041	NC_016818	CGT	2	6	609062	609067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188522
11042	NC_016818	ATGA	2	8	609069	609076	50 %	25 %	25 %	0 %	383188522
11043	NC_016818	GTC	2	6	609091	609096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188522
11044	NC_016818	T	6	6	609131	609136	0 %	100 %	0 %	0 %	383188522
11045	NC_016818	TGA	2	6	609193	609198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188522
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11047	NC_016818	GCA	2	6	609268	609273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188522
11048	NC_016818	TCAT	2	8	609399	609406	25 %	50 %	0 %	25 %	383188522
11049	NC_016818	TGA	2	6	609410	609415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188522
11050	NC_016818	AC	3	6	609418	609423	50 %	0 %	0 %	50 %	383188522
11051	NC_016818	GT	3	6	609484	609489	0 %	50 %	50 %	0 %	383188522
11052	NC_016818	AAT	2	6	609641	609646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188522
11053	NC_016818	CGC	2	6	609655	609660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188522
11054	NC_016818	CCGC	2	8	609715	609722	0 %	0 %	25 %	75 %	383188522
11055	NC_016818	CGT	2	6	609754	609759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188522
11056	NC_016818	T	6	6	609764	609769	0 %	100 %	0 %	0 %	383188522
11057	NC_016818	ATCCAG	2	12	609776	609787	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383188522
11058	NC_016818	CAC	2	6	609811	609816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188522
11059	NC_016818	GAG	2	6	609821	609826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188522
11060	NC_016818	TCG	2	6	609924	609929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188522
11061	NC_016818	TGCCGC	2	12	609970	609981	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383188522
11062	NC_016818	AACAGG	2	12	610002	610013	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383188522
11063	NC_016818	A	6	6	610070	610075	100 %	0 %	0 %	0 %	383188522
11064	NC_016818	CTT	2	6	610105	610110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188522
11065	NC_016818	TCT	2	6	610152	610157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188522
11066	NC_016818	TTC	2	6	610175	610180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188522
11067	NC_016818	AAT	2	6	610220	610225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188522
11068	NC_016818	ACC	2	6	610251	610256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188522
11069	NC_016818	CTGC	2	8	610447	610454	0 %	25 %	25 %	50 %	383188522
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11071	NC_016818	T	7	7	610900	610906	0 %	100 %	0 %	0 %	383188523
11072	NC_016818	GAC	2	6	611077	611082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188523
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11074	NC_016818	CATC	2	8	611185	611192	25 %	25 %	0 %	50 %	383188523
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11077	NC_016818	GTG	2	6	611292	611297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188523
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11081	NC_016818	CATT	2	8	611524	611531	25 %	50 %	0 %	25 %	383188523
11082	NC_016818	ACA	2	6	611535	611540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188523
11083	NC_016818	CGA	2	6	611650	611655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188523
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11085	NC_016818	GCC	2	6	611880	611885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188523
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11087	NC_016818	CAGC	2	8	611917	611924	25 %	0 %	25 %	50 %	383188523
11088	NC_016818	GC	3	6	611923	611928	0 %	0 %	50 %	50 %	383188523
11089	NC_016818	ACG	2	6	611931	611936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188523
11090	NC_016818	T	6	6	611948	611953	0 %	100 %	0 %	0 %	383188523
11091	NC_016818	CAG	2	6	611984	611989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188523
11092	NC_016818	CG	3	6	612013	612018	0 %	0 %	50 %	50 %	383188523
11093	NC_016818	CCT	2	6	612019	612024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383188523
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11098	NC_016818	CATA	2	8	612205	612212	50 %	25 %	0 %	25 %	383188523
11099	NC_016818	GTC	2	6	612347	612352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188523
11100	NC_016818	CAG	2	6	612368	612373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188523
11101	NC_016818	CCA	2	6	612418	612423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188523
11102	NC_016818	CGC	2	6	612427	612432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188523
11103	NC_016818	CTG	2	6	612448	612453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188523
11104	NC_016818	GCC	2	6	612521	612526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188523
11105	NC_016818	AGGT	2	8	612639	612646	25 %	25 %	50 %	0 %	383188523
11106	NC_016818	GCC	2	6	612735	612740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188523
11107	NC_016818	TGCG	2	8	612757	612764	0 %	25 %	50 %	25 %	383188523
11108	NC_016818	TGG	2	6	612766	612771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188523
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11110	NC_016818	CAC	2	6	612839	612844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188523
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11112	NC_016818	CGG	2	6	612903	612908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188523
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11114	NC_016818	CTT	2	6	612976	612981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188523
11115	NC_016818	T	6	6	613024	613029	0 %	100 %	0 %	0 %	383188523
11116	NC_016818	T	7	7	613042	613048	0 %	100 %	0 %	0 %	383188523
11117	NC_016818	GTT	2	6	613104	613109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188523
11118	NC_016818	GA	3	6	613118	613123	50 %	0 %	50 %	0 %	383188523
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11120	NC_016818	TCGG	2	8	613578	613585	0 %	25 %	50 %	25 %	383188524
11121	NC_016818	GGC	2	6	613747	613752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188524
11122	NC_016818	GCTG	2	8	613765	613772	0 %	25 %	50 %	25 %	383188524
11123	NC_016818	CAT	2	6	613811	613816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188524
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11133	NC_016818	AGTAA	2	10	614587	614596	60 %	20 %	20 %	0 %	383188525
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11234	NC_016818	CGG	2	6	620090	620095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188527
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11361	NC_016818	GAC	2	6	626214	626219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188532
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11476	NC_016818	ACC	2	6	633248	633253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188539
11477	NC_016818	CAA	2	6	633255	633260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188539
11478	NC_016818	TCA	2	6	633294	633299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188539
11479	NC_016818	GCC	2	6	633323	633328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188539
11480	NC_016818	GCC	2	6	633332	633337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188539
11481	NC_016818	TGG	2	6	633378	633383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188539
11482	NC_016818	TGAT	2	8	633393	633400	25 %	50 %	25 %	0 %	383188539
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11484	NC_016818	CA	3	6	633472	633477	50 %	0 %	0 %	50 %	383188539
11485	NC_016818	TCA	2	6	633481	633486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188539
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