MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 86201

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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64002	NC_016818	CAA	2	6	3607295	3607300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383191211
64003	NC_016818	GCT	2	6	3607411	3607416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383191211
64004	NC_016818	TGA	2	6	3607477	3607482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383191211
64005	NC_016818	CTG	2	6	3607535	3607540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383191211
64006	NC_016818	GC	4	8	3607555	3607562	0 %	0 %	50 %	50 %	383191211
64007	NC_016818	AAC	2	6	3607580	3607585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383191211
64008	NC_016818	CTG	2	6	3607592	3607597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383191211
64009	NC_016818	ACG	2	6	3607691	3607696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383191211
64010	NC_016818	A	6	6	3607770	3607775	100 %	0 %	0 %	0 %	383191211
64011	NC_016818	GCA	2	6	3607820	3607825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383191211
64012	NC_016818	CGA	2	6	3607839	3607844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383191211
64013	NC_016818	T	6	6	3607878	3607883	0 %	100 %	0 %	0 %	383191212
64014	NC_016818	CAT	2	6	3607916	3607921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383191212
64015	NC_016818	G	6	6	3607934	3607939	0 %	0 %	100 %	0 %	383191212
64016	NC_016818	GAACA	2	10	3608064	3608073	60 %	0 %	20 %	20 %	383191212
64017	NC_016818	ACA	2	6	3608086	3608091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383191212
64018	NC_016818	GTC	2	6	3608102	3608107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383191212
64019	NC_016818	TGC	2	6	3608218	3608223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383191212
64020	NC_016818	AGC	3	9	3608265	3608273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383191212
64021	NC_016818	TGGA	2	8	3608427	3608434	25 %	25 %	50 %	0 %	383191212
64022	NC_016818	AAC	2	6	3608448	3608453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383191212
64023	NC_016818	AAC	2	6	3608499	3608504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383191212
64024	NC_016818	CCA	2	6	3608535	3608540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383191212
64025	NC_016818	CAG	2	6	3608550	3608555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383191212
64026	NC_016818	ATC	2	6	3608613	3608618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383191212
64027	NC_016818	TGG	2	6	3608678	3608683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383191212
64028	NC_016818	ACG	2	6	3608692	3608697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383191212
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64030	NC_016818	GTT	2	6	3608835	3608840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383191212
64031	NC_016818	CGTT	2	8	3608860	3608867	0 %	50 %	25 %	25 %	383191212
64032	NC_016818	AAG	2	6	3608881	3608886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383191212
64033	NC_016818	TGTTCC	2	12	3608932	3608943	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383191212
64034	NC_016818	GGT	2	6	3608987	3608992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383191212
64035	NC_016818	GGC	2	6	3609017	3609022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383191212
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64037	NC_016818	TCG	2	6	3609097	3609102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383191212
64038	NC_016818	GCC	2	6	3609143	3609148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383191212
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64045	NC_016818	GAT	2	6	3609323	3609328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383191212
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64048	NC_016818	CAA	2	6	3609413	3609418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383191212
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64050	NC_016818	CTG	2	6	3609501	3609506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383191212
64051	NC_016818	GGCAT	2	10	3609516	3609525	20 %	20 %	40 %	20 %	383191212
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64053	NC_016818	GAA	2	6	3609561	3609566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383191212
64054	NC_016818	GT	3	6	3609574	3609579	0 %	50 %	50 %	0 %	383191212
64055	NC_016818	ACT	2	6	3609652	3609657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383191212
64056	NC_016818	GAAA	2	8	3609665	3609672	75 %	0 %	25 %	0 %	383191212
64057	NC_016818	GCG	2	6	3609778	3609783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383191212
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64061	NC_016818	GAA	2	6	3610169	3610174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383191212
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64063	NC_016818	CAC	2	6	3610303	3610308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383191212
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64098	NC_016818	AG	3	6	3611890	3611895	50 %	0 %	50 %	0 %	383191215
64099	NC_016818	GCTTCA	2	12	3611914	3611925	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383191215
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64104	NC_016818	TCT	2	6	3612214	3612219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383191215
64105	NC_016818	CGAT	2	8	3612292	3612299	25 %	25 %	25 %	25 %	383191215
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64115	NC_016818	GGC	2	6	3612808	3612813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383191216
64116	NC_016818	CAT	2	6	3612820	3612825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383191216
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64203	NC_016818	GCA	2	6	3618224	3618229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383191222
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64207	NC_016818	GCG	3	9	3618432	3618440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383191222
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64212	NC_016818	CGC	2	6	3618860	3618865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383191223
64213	NC_016818	GGCA	2	8	3618910	3618917	25 %	0 %	50 %	25 %	383191223
64214	NC_016818	GCG	3	9	3618932	3618940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383191223
64215	NC_016818	TGG	2	6	3618948	3618953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383191223
64216	NC_016818	ACC	2	6	3619001	3619006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383191223
64217	NC_016818	CTG	2	6	3619037	3619042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383191223
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64219	NC_016818	GGC	2	6	3619088	3619093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383191223
64220	NC_016818	ATTTT	2	10	3619172	3619181	20 %	80 %	0 %	0 %	383191223
64221	NC_016818	TGA	2	6	3619185	3619190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383191223
64222	NC_016818	GCT	2	6	3619279	3619284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383191223
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64224	NC_016818	CTT	2	6	3619376	3619381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383191223
64225	NC_016818	CTG	2	6	3619385	3619390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383191223
64226	NC_016818	GTT	2	6	3619528	3619533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383191223
64227	NC_016818	TTC	2	6	3619607	3619612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383191223
64228	NC_016818	CGA	2	6	3619614	3619619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383191223
64229	NC_016818	CAC	2	6	3619624	3619629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383191223
64230	NC_016818	GGT	2	6	3619640	3619645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383191223
64231	NC_016818	TGG	2	6	3619701	3619706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383191223
64232	NC_016818	TGC	2	6	3619714	3619719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383191223
64233	NC_016818	TCG	2	6	3619734	3619739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383191223
64234	NC_016818	GCC	2	6	3619748	3619753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383191223
64235	NC_016818	TCC	2	6	3619769	3619774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383191223
64236	NC_016818	GCGG	2	8	3619787	3619794	0 %	0 %	75 %	25 %	383191223
64237	NC_016818	GCA	2	6	3619817	3619822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383191223
64238	NC_016818	ATGCTG	2	12	3619835	3619846	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383191223
64239	NC_016818	TGA	2	6	3619866	3619871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383191223
64240	NC_016818	CTGATT	2	12	3619898	3619909	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383191223
64241	NC_016818	TGA	2	6	3619977	3619982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383191223
64242	NC_016818	TGA	2	6	3619986	3619991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383191223
64243	NC_016818	CGG	2	6	3620029	3620034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383191223
64244	NC_016818	GCT	2	6	3620035	3620040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383191223
64245	NC_016818	TCA	2	6	3620049	3620054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383191223
64246	NC_016818	GGT	2	6	3620059	3620064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383191223
64247	NC_016818	TAT	2	6	3620123	3620128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383191223
64248	NC_016818	TCA	2	6	3620143	3620148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383191223
64249	NC_016818	ATGTC	2	10	3620563	3620572	20 %	40 %	20 %	20 %	383191224
64250	NC_016818	CGC	2	6	3620612	3620617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383191224
64251	NC_016818	CCGG	2	8	3620622	3620629	0 %	0 %	50 %	50 %	383191224
64252	NC_016818	CG	3	6	3620674	3620679	0 %	0 %	50 %	50 %	383191224
64253	NC_016818	CGTCAG	2	12	3620793	3620804	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383191224
64254	NC_016818	GCT	2	6	3620807	3620812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383191224
64255	NC_016818	TACT	2	8	3620976	3620983	25 %	50 %	0 %	25 %	383191225
64256	NC_016818	GCCCA	2	10	3620998	3621007	20 %	0 %	20 %	60 %	383191225
64257	NC_016818	TTGGT	2	10	3621042	3621051	0 %	60 %	40 %	0 %	383191225
64258	NC_016818	ACA	2	6	3621068	3621073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383191225
64259	NC_016818	CTT	2	6	3621120	3621125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383191225
64260	NC_016818	TGA	2	6	3621138	3621143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383191225
64261	NC_016818	GCA	2	6	3621170	3621175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383191225
64262	NC_016818	AGA	2	6	3621179	3621184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383191225
64263	NC_016818	CG	3	6	3621188	3621193	0 %	0 %	50 %	50 %	383191225
64264	NC_016818	TGG	2	6	3621340	3621345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383191225
64265	NC_016818	TGAT	2	8	3621359	3621366	25 %	50 %	25 %	0 %	383191225
64266	NC_016818	GCC	2	6	3621422	3621427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383191225
64267	NC_016818	AGG	2	6	3621436	3621441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383191225
64268	NC_016818	TGC	2	6	3621443	3621448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383191225
64269	NC_016818	ATG	2	6	3621460	3621465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383191225
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64273	NC_016818	A	6	6	3621841	3621846	100 %	0 %	0 %	0 %	383191226
64274	NC_016818	GAA	2	6	3621849	3621854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383191226
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64300	NC_016818	CAG	2	6	3623308	3623313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383191227
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64303	NC_016818	CAG	2	6	3623480	3623485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383191227
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64327	NC_016818	CAC	2	6	3624498	3624503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383191228
64328	NC_016818	TGC	2	6	3624907	3624912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383191229
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64330	NC_016818	CAG	2	6	3624960	3624965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383191229
64331	NC_016818	TCG	2	6	3625034	3625039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383191229
64332	NC_016818	GC	3	6	3625093	3625098	0 %	0 %	50 %	50 %	383191229
64333	NC_016818	CG	3	6	3625178	3625183	0 %	0 %	50 %	50 %	383191229
64334	NC_016818	ATT	2	6	3625218	3625223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383191229
64335	NC_016818	GCG	2	6	3625274	3625279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383191229
64336	NC_016818	TCA	2	6	3625318	3625323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383191229
64337	NC_016818	CTG	2	6	3625380	3625385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383191229
64338	NC_016818	TTTA	2	8	3625461	3625468	25 %	75 %	0 %	0 %	383191229
64339	NC_016818	CAG	2	6	3625485	3625490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383191229
64340	NC_016818	CGC	2	6	3625628	3625633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383191229
64341	NC_016818	TGC	2	6	3625663	3625668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383191229
64342	NC_016818	ATCAA	2	10	3625681	3625690	60 %	20 %	0 %	20 %	383191229
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64458	NC_016818	GCA	2	6	3632374	3632379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383191234
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64461	NC_016818	TGG	2	6	3632626	3632631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383191234
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64464	NC_016818	GCT	2	6	3632717	3632722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383191234
64465	NC_016818	GAA	2	6	3632829	3632834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383191234
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64468	NC_016818	TATCAG	2	12	3632964	3632975	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383191234
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64492	NC_016818	ATAC	2	8	3634075	3634082	50 %	25 %	0 %	25 %	383191236
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