MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 86201

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57001	NC_016818	CTGG	2	8	3215392	3215399	0 %	25 %	50 %	25 %	383190827
57002	NC_016818	CGG	2	6	3215460	3215465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383190827
57003	NC_016818	TCC	2	6	3215484	3215489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383190827
57004	NC_016818	GAA	2	6	3215555	3215560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383190827
57005	NC_016818	TAC	2	6	3215606	3215611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383190827
57006	NC_016818	CGG	2	6	3215656	3215661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383190827
57007	NC_016818	TCAG	2	8	3215706	3215713	25 %	25 %	25 %	25 %	383190827
57008	NC_016818	TTC	2	6	3215735	3215740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383190827
57009	NC_016818	ATGAC	2	10	3215793	3215802	40 %	20 %	20 %	20 %	383190827
57010	NC_016818	TGA	2	6	3215806	3215811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383190827
57011	NC_016818	ATT	2	6	3215819	3215824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383190827
57012	NC_016818	AG	3	6	3215840	3215845	50 %	0 %	50 %	0 %	383190827
57013	NC_016818	ATC	2	6	3215931	3215936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383190827
57014	NC_016818	TCT	2	6	3216231	3216236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383190828
57015	NC_016818	TAG	2	6	3216253	3216258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383190828
57016	NC_016818	ATT	2	6	3216266	3216271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383190828
57017	NC_016818	CAT	2	6	3216325	3216330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383190828
57018	NC_016818	T	6	6	3216389	3216394	0 %	100 %	0 %	0 %	383190828
57019	NC_016818	CAA	2	6	3216490	3216495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383190828
57020	NC_016818	CAC	2	6	3216505	3216510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383190828
57021	NC_016818	GCA	2	6	3216517	3216522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190828
57022	NC_016818	AGC	2	6	3216526	3216531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190828
57023	NC_016818	ATAA	2	8	3216554	3216561	75 %	25 %	0 %	0 %	383190828
57024	NC_016818	TGA	2	6	3216606	3216611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383190828
57025	NC_016818	CAG	2	6	3216664	3216669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190828
57026	NC_016818	A	6	6	3216705	3216710	100 %	0 %	0 %	0 %	383190828
57027	NC_016818	TTTA	2	8	3216740	3216747	25 %	75 %	0 %	0 %	383190828
57028	NC_016818	TATT	2	8	3216761	3216768	25 %	75 %	0 %	0 %	383190828
57029	NC_016818	TGA	2	6	3216778	3216783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383190828
57030	NC_016818	GAC	2	6	3216818	3216823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190828
57031	NC_016818	GAT	2	6	3216829	3216834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383190828
57032	NC_016818	AAT	2	6	3217180	3217185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383190829
57033	NC_016818	C	7	7	3217216	3217222	0 %	0 %	0 %	100 %	383190829
57034	NC_016818	CGG	2	6	3217273	3217278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383190829
57035	NC_016818	CAC	2	6	3217399	3217404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383190829
57036	NC_016818	ATC	2	6	3217483	3217488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383190829
57037	NC_016818	AGC	2	6	3217529	3217534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190829
57038	NC_016818	TCA	2	6	3217548	3217553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383190829
57039	NC_016818	AT	3	6	3217634	3217639	50 %	50 %	0 %	0 %	383190829
57040	NC_016818	GTT	2	6	3217647	3217652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383190829
57041	NC_016818	TGG	2	6	3217773	3217778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383190829
57042	NC_016818	CCA	2	6	3217812	3217817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383190829
57043	NC_016818	ATA	2	6	3217916	3217921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383190829
57044	NC_016818	CTG	2	6	3217923	3217928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383190829
57045	NC_016818	ACC	2	6	3217952	3217957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383190829
57046	NC_016818	CAT	2	6	3217966	3217971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383190829
57047	NC_016818	ACA	2	6	3217973	3217978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383190829
57048	NC_016818	CGT	2	6	3218116	3218121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383190830
57049	NC_016818	GAT	2	6	3218155	3218160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383190830
57050	NC_016818	GGC	2	6	3218163	3218168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383190830
57051	NC_016818	GGCACC	2	12	3218173	3218184	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383190830
57052	NC_016818	TCA	2	6	3218232	3218237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383190830
57053	NC_016818	CGGA	2	8	3218282	3218289	25 %	0 %	50 %	25 %	383190830
57054	NC_016818	CTCTT	2	10	3218296	3218305	0 %	60 %	0 %	40 %	383190830
57055	NC_016818	CGC	2	6	3218344	3218349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383190830
57056	NC_016818	AT	3	6	3218383	3218388	50 %	50 %	0 %	0 %	383190830
57057	NC_016818	ATC	2	6	3218453	3218458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383190830
57058	NC_016818	ACA	2	6	3218459	3218464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383190830
57059	NC_016818	CCA	2	6	3218493	3218498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383190830
57060	NC_016818	CAG	2	6	3218515	3218520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190830
57061	NC_016818	GCA	2	6	3218525	3218530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190830
57062	NC_016818	TGGCC	2	10	3218541	3218550	0 %	20 %	40 %	40 %	383190830
57063	NC_016818	GCC	2	6	3218669	3218674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383190830
57064	NC_016818	GAAA	2	8	3218693	3218700	75 %	0 %	25 %	0 %	383190830
57065	NC_016818	AG	3	6	3218732	3218737	50 %	0 %	50 %	0 %	383190830
57066	NC_016818	GC	3	6	3218816	3218821	0 %	0 %	50 %	50 %	383190830
57067	NC_016818	GTT	2	6	3218866	3218871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383190830
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57069	NC_016818	GTA	2	6	3219008	3219013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383190830
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57073	NC_016818	CAG	2	6	3219301	3219306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190830
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57083	NC_016818	GGT	2	6	3219796	3219801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383190830
57084	NC_016818	CCGGC	2	10	3219810	3219819	0 %	0 %	40 %	60 %	383190830
57085	NC_016818	CAT	2	6	3219874	3219879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383190830
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57087	NC_016818	AAT	2	6	3219940	3219945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383190830
57088	NC_016818	CAAA	2	8	3219948	3219955	75 %	0 %	0 %	25 %	383190830
57089	NC_016818	CAG	2	6	3220006	3220011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190830
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57099	NC_016818	CGC	2	6	3220519	3220524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383190830
57100	NC_016818	CTG	2	6	3220538	3220543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383190830
57101	NC_016818	CCAG	2	8	3220572	3220579	25 %	0 %	25 %	50 %	383190830
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57103	NC_016818	GCC	2	6	3220829	3220834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383190830
57104	NC_016818	CGA	2	6	3220900	3220905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190830
57105	NC_016818	ACTG	2	8	3221002	3221009	25 %	25 %	25 %	25 %	383190830
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57108	NC_016818	TAA	2	6	3221121	3221126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383190830
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57115	NC_016818	TGGC	2	8	3221633	3221640	0 %	25 %	50 %	25 %	383190831
57116	NC_016818	GC	3	6	3221709	3221714	0 %	0 %	50 %	50 %	383190831
57117	NC_016818	GCCTGC	2	12	3221828	3221839	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383190831
57118	NC_016818	GCC	2	6	3221846	3221851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383190831
57119	NC_016818	GC	3	6	3221905	3221910	0 %	0 %	50 %	50 %	383190831
57120	NC_016818	GCC	2	6	3222002	3222007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383190831
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57126	NC_016818	CTGG	2	8	3223117	3223124	0 %	25 %	50 %	25 %	383190832
57127	NC_016818	CTG	2	6	3223133	3223138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383190832
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57230	NC_016818	ATT	2	6	3230322	3230327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383190839
57231	NC_016818	GC	3	6	3230384	3230389	0 %	0 %	50 %	50 %	383190839
57232	NC_016818	TTCG	2	8	3230597	3230604	0 %	50 %	25 %	25 %	383190840
57233	NC_016818	CAT	2	6	3230718	3230723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383190840
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57340	NC_016818	AT	3	6	3238614	3238619	50 %	50 %	0 %	0 %	383190848
57341	NC_016818	ATG	2	6	3238689	3238694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383190848
57342	NC_016818	GCA	2	6	3238774	3238779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190848
57343	NC_016818	GGC	2	6	3238819	3238824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383190848
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57462	NC_016818	ACG	2	6	3245799	3245804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190856
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