MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 86201

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55002	NC_016818	ATT	2	6	3096495	3096500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383190718
55003	NC_016818	GCGTG	2	10	3096521	3096530	0 %	20 %	60 %	20 %	383190718
55004	NC_016818	TCG	2	6	3096547	3096552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383190718
55005	NC_016818	GCC	2	6	3096582	3096587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383190718
55006	NC_016818	CCT	2	6	3096604	3096609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383190718
55007	NC_016818	CAG	2	6	3096722	3096727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190718
55008	NC_016818	TGA	2	6	3096730	3096735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383190718
55009	NC_016818	CTG	2	6	3096753	3096758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383190718
55010	NC_016818	CTT	2	6	3096825	3096830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383190718
55011	NC_016818	ATC	2	6	3096831	3096836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383190718
55012	NC_016818	GCT	2	6	3096878	3096883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383190718
55013	NC_016818	CGAT	2	8	3096886	3096893	25 %	25 %	25 %	25 %	383190718
55014	NC_016818	CTT	2	6	3096980	3096985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383190718
55015	NC_016818	AC	3	6	3096994	3096999	50 %	0 %	0 %	50 %	383190718
55016	NC_016818	CGA	2	6	3097051	3097056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190718
55017	NC_016818	TCATTG	2	12	3097152	3097163	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383190718
55018	NC_016818	ATC	2	6	3097191	3097196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383190718
55019	NC_016818	AAT	2	6	3097245	3097250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383190718
55020	NC_016818	ATC	2	6	3097257	3097262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383190718
55021	NC_016818	GGC	2	6	3097287	3097292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383190718
55022	NC_016818	CTG	2	6	3097302	3097307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383190718
55023	NC_016818	CGGCG	2	10	3097337	3097346	0 %	0 %	60 %	40 %	383190718
55024	NC_016818	CAG	2	6	3097466	3097471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190718
55025	NC_016818	AT	3	6	3097566	3097571	50 %	50 %	0 %	0 %	383190719
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55027	NC_016818	GCG	2	6	3097606	3097611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383190719
55028	NC_016818	GACTTA	2	12	3097638	3097649	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383190719
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55030	NC_016818	GCA	2	6	3097719	3097724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190719
55031	NC_016818	T	6	6	3097729	3097734	0 %	100 %	0 %	0 %	383190719
55032	NC_016818	CCGCAT	2	12	3097759	3097770	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383190719
55033	NC_016818	ATG	2	6	3097803	3097808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383190719
55034	NC_016818	AAAT	2	8	3097854	3097861	75 %	25 %	0 %	0 %	383190719
55035	NC_016818	TGC	2	6	3097876	3097881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383190719
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55038	NC_016818	ATA	2	6	3097932	3097937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383190719
55039	NC_016818	GCA	2	6	3098065	3098070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190719
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55042	NC_016818	TGCC	2	8	3098170	3098177	0 %	25 %	25 %	50 %	383190719
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55052	NC_016818	CAT	2	6	3098435	3098440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383190719
55053	NC_016818	TGT	2	6	3098792	3098797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383190720
55054	NC_016818	TCA	2	6	3098803	3098808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383190720
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55057	NC_016818	CGTT	2	8	3098887	3098894	0 %	50 %	25 %	25 %	383190720
55058	NC_016818	CAT	2	6	3098915	3098920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383190720
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55106	NC_016818	TTCCC	2	10	3102517	3102526	0 %	40 %	0 %	60 %	383190723
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55115	NC_016818	GAG	2	6	3102968	3102973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383190723
55116	NC_016818	CGCAG	2	10	3102981	3102990	20 %	0 %	40 %	40 %	383190723
55117	NC_016818	TGCCT	2	10	3103022	3103031	0 %	40 %	20 %	40 %	383190723
55118	NC_016818	A	6	6	3103116	3103121	100 %	0 %	0 %	0 %	383190723
55119	NC_016818	GCG	2	6	3103127	3103132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383190723
55120	NC_016818	GCA	2	6	3103139	3103144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190723
55121	NC_016818	TGC	2	6	3103170	3103175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383190723
55122	NC_016818	CAT	2	6	3103183	3103188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383190723
55123	NC_016818	GCA	2	6	3103201	3103206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190723
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55129	NC_016818	GCA	2	6	3103746	3103751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190724
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55131	NC_016818	CTGG	2	8	3103904	3103911	0 %	25 %	50 %	25 %	383190724
55132	NC_016818	TGG	2	6	3103957	3103962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383190724
55133	NC_016818	ATG	2	6	3103980	3103985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383190724
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55143	NC_016818	GCT	2	6	3104735	3104740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383190724
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55229	NC_016818	TCAG	2	8	3109882	3109889	25 %	25 %	25 %	25 %	383190726
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55463	NC_016818	CGA	2	6	3124678	3124683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190738
55464	NC_016818	GGTAA	2	10	3124700	3124709	40 %	20 %	40 %	0 %	383190738
55465	NC_016818	GCCG	2	8	3124720	3124727	0 %	0 %	50 %	50 %	383190738
55466	NC_016818	GCC	2	6	3124779	3124784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383190738
55467	NC_016818	CTG	2	6	3124808	3124813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383190738
55468	NC_016818	ACC	2	6	3124853	3124858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383190738
55469	NC_016818	CGG	2	6	3124863	3124868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383190738
55470	NC_016818	ATG	2	6	3124952	3124957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383190738
55471	NC_016818	TGT	2	6	3124986	3124991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383190738
55472	NC_016818	A	6	6	3125006	3125011	100 %	0 %	0 %	0 %	383190738
55473	NC_016818	AGA	2	6	3125026	3125031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383190738
55474	NC_016818	ATC	2	6	3125147	3125152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383190738
55475	NC_016818	GCA	2	6	3125158	3125163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190738
55476	NC_016818	TGA	2	6	3125202	3125207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383190738
55477	NC_016818	TGA	2	6	3125278	3125283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383190738
55478	NC_016818	TTA	2	6	3125341	3125346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383190738
55479	NC_016818	ATG	2	6	3125361	3125366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383190738
55480	NC_016818	AGC	2	6	3125443	3125448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190738
55481	NC_016818	A	6	6	3125492	3125497	100 %	0 %	0 %	0 %	383190738
55482	NC_016818	AG	3	6	3125501	3125506	50 %	0 %	50 %	0 %	383190738
55483	NC_016818	GGT	2	6	3125542	3125547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383190738
55484	NC_016818	GC	3	6	3125667	3125672	0 %	0 %	50 %	50 %	383190738
55485	NC_016818	GCG	2	6	3125795	3125800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383190738
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55487	NC_016818	CTGGAA	2	12	3125855	3125866	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383190738
55488	NC_016818	CGCTGA	2	12	3125887	3125898	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383190738
55489	NC_016818	GATGCC	2	12	3125906	3125917	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383190738
55490	NC_016818	ATC	2	6	3125951	3125956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383190738
55491	NC_016818	GAA	2	6	3125963	3125968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383190738
55492	NC_016818	ATAA	2	8	3126085	3126092	75 %	25 %	0 %	0 %	383190738
55493	NC_016818	GGC	2	6	3126202	3126207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383190739
55494	NC_016818	TGC	2	6	3126226	3126231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383190739
55495	NC_016818	TAT	2	6	3126281	3126286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383190739
55496	NC_016818	CCTC	2	8	3126413	3126420	0 %	25 %	0 %	75 %	383190739
55497	NC_016818	TGAT	2	8	3126471	3126478	25 %	50 %	25 %	0 %	383190739
55498	NC_016818	CTG	2	6	3126489	3126494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383190739
55499	NC_016818	GCTTTG	2	12	3126498	3126509	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	383190739
55500	NC_016818	GCA	2	6	3126637	3126642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383190739

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