MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia slovaca 13-B chromosome

Total Repeats: 22999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016639	TAA	2	6	217332	217337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318944
4002	NC_016639	TAT	2	6	217342	217347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318944
4003	NC_016639	AG	3	6	217348	217353	50 %	0 %	50 %	0 %	374318944
4004	NC_016639	TAA	2	6	217560	217565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318945
4005	NC_016639	GCA	2	6	217585	217590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318945
4006	NC_016639	ACG	2	6	217625	217630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318945
4007	NC_016639	GAT	2	6	217636	217641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318945
4008	NC_016639	CTTT	2	8	217657	217664	0 %	75 %	0 %	25 %	374318945
4009	NC_016639	ATA	2	6	217673	217678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318945
4010	NC_016639	CTA	2	6	217883	217888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318945
4011	NC_016639	AGT	2	6	217899	217904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318945
4012	NC_016639	AAT	2	6	218154	218159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318946
4013	NC_016639	AAAT	2	8	218174	218181	75 %	25 %	0 %	0 %	374318946
4014	NC_016639	A	6	6	218202	218207	100 %	0 %	0 %	0 %	374318946
4015	NC_016639	TCT	2	6	218217	218222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374318946
4016	NC_016639	ACT	2	6	218306	218311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318946
4017	NC_016639	TTG	2	6	218356	218361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374318946
4018	NC_016639	AGC	2	6	218369	218374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318946
4019	NC_016639	ATA	2	6	218422	218427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318946
4020	NC_016639	ATA	2	6	218434	218439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318946
4021	NC_016639	AAT	2	6	218441	218446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318946
4022	NC_016639	T	6	6	218505	218510	0 %	100 %	0 %	0 %	374318946
4023	NC_016639	GAA	2	6	218523	218528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318946
4024	NC_016639	ATT	2	6	218532	218537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318946
4025	NC_016639	ATT	2	6	218723	218728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318946
4026	NC_016639	TAAAG	2	10	218732	218741	60 %	20 %	20 %	0 %	374318946
4027	NC_016639	AAT	2	6	218827	218832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318946
4028	NC_016639	ATT	2	6	220116	220121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318947
4029	NC_016639	TAA	2	6	220143	220148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318947
4030	NC_016639	TTAC	2	8	220154	220161	25 %	50 %	0 %	25 %	374318947
4031	NC_016639	AAAAGC	2	12	220176	220187	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	374318947
4032	NC_016639	T	6	6	220225	220230	0 %	100 %	0 %	0 %	374318947
4033	NC_016639	AGTA	2	8	220236	220243	50 %	25 %	25 %	0 %	374318947
4034	NC_016639	GTTT	2	8	220244	220251	0 %	75 %	25 %	0 %	374318947
4035	NC_016639	TAG	2	6	220257	220262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318947
4036	NC_016639	TAA	2	6	220283	220288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318947
4037	NC_016639	AT	3	6	220473	220478	50 %	50 %	0 %	0 %	374318947
4038	NC_016639	ATA	2	6	220498	220503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318947
4039	NC_016639	TGG	2	6	220569	220574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374318947
4040	NC_016639	TAG	2	6	220583	220588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318947
4041	NC_016639	AAAT	2	8	220644	220651	75 %	25 %	0 %	0 %	374318947
4042	NC_016639	TTC	2	6	220670	220675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374318947
4043	NC_016639	TAT	2	6	220689	220694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318947
4044	NC_016639	CAG	2	6	220696	220701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318947
4045	NC_016639	AG	3	6	220766	220771	50 %	0 %	50 %	0 %	374318947
4046	NC_016639	AAGT	2	8	220818	220825	50 %	25 %	25 %	0 %	374318947
4047	NC_016639	AGT	2	6	220860	220865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318947
4048	NC_016639	AAAT	2	8	220898	220905	75 %	25 %	0 %	0 %	374318947
4049	NC_016639	GAA	2	6	220915	220920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318947
4050	NC_016639	GAA	2	6	220951	220956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318947
4051	NC_016639	AAG	2	6	220958	220963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318947
4052	NC_016639	TAA	2	6	220986	220991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318947
4053	NC_016639	AT	4	8	221040	221047	50 %	50 %	0 %	0 %	374318947
4054	NC_016639	T	6	6	221116	221121	0 %	100 %	0 %	0 %	374318948
4055	NC_016639	TAA	2	6	221125	221130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318948
4056	NC_016639	T	6	6	221164	221169	0 %	100 %	0 %	0 %	374318948
4057	NC_016639	AT	3	6	221333	221338	50 %	50 %	0 %	0 %	374318948
4058	NC_016639	CAT	2	6	221341	221346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318948
4059	NC_016639	ATT	2	6	221429	221434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318948
4060	NC_016639	AAT	2	6	221441	221446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318948
4061	NC_016639	TGC	2	6	221585	221590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374318949
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4063	NC_016639	TTTTCT	2	12	221654	221665	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374318949
4064	NC_016639	AT	3	6	221667	221672	50 %	50 %	0 %	0 %	374318949
4065	NC_016639	TGC	2	6	221763	221768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374318949
4066	NC_016639	CT	3	6	221791	221796	0 %	50 %	0 %	50 %	374318949
4067	NC_016639	TAT	2	6	221820	221825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318949
4068	NC_016639	T	6	6	221827	221832	0 %	100 %	0 %	0 %	374318949
4069	NC_016639	AT	3	6	221850	221855	50 %	50 %	0 %	0 %	374318950
4070	NC_016639	ATC	2	6	221921	221926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318950
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4073	NC_016639	TAA	2	6	222110	222115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318950
4074	NC_016639	AATA	2	8	222138	222145	75 %	25 %	0 %	0 %	374318950
4075	NC_016639	ATT	2	6	222172	222177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318950
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4078	NC_016639	AAT	3	9	222322	222330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318950
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4082	NC_016639	GGAG	2	8	222429	222436	25 %	0 %	75 %	0 %	374318950
4083	NC_016639	ATG	2	6	222446	222451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318950
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4089	NC_016639	AAT	2	6	222776	222781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318951
4090	NC_016639	AAATTA	2	12	222810	222821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318951
4091	NC_016639	AAT	2	6	222822	222827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318951
4092	NC_016639	AGA	2	6	222857	222862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318951
4093	NC_016639	TAA	2	6	222863	222868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318951
4094	NC_016639	AGT	2	6	222875	222880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318951
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4096	NC_016639	TATT	2	8	222901	222908	25 %	75 %	0 %	0 %	374318951
4097	NC_016639	TTA	2	6	223165	223170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318952
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4100	NC_016639	TCC	2	6	223237	223242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374318952
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4103	NC_016639	TAT	2	6	223372	223377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318952
4104	NC_016639	CTT	2	6	223380	223385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374318952
4105	NC_016639	CTA	2	6	223425	223430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318952
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4107	NC_016639	TAAT	2	8	223449	223456	50 %	50 %	0 %	0 %	374318952
4108	NC_016639	TAA	2	6	223467	223472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318952
4109	NC_016639	AG	3	6	223515	223520	50 %	0 %	50 %	0 %	374318952
4110	NC_016639	ACC	2	6	223528	223533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374318952
4111	NC_016639	TAA	2	6	223564	223569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318952
4112	NC_016639	CT	3	6	223660	223665	0 %	50 %	0 %	50 %	374318952
4113	NC_016639	AT	3	6	223685	223690	50 %	50 %	0 %	0 %	374318952
4114	NC_016639	CAT	2	6	223752	223757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318952
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4118	NC_016639	ATT	3	9	223879	223887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318952
4119	NC_016639	T	6	6	223886	223891	0 %	100 %	0 %	0 %	374318952
4120	NC_016639	TTG	2	6	223996	224001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374318952
4121	NC_016639	TTG	2	6	224164	224169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374318952
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4493	NC_016639	TC	3	6	246544	246549	0 %	50 %	0 %	50 %	374318966
4494	NC_016639	AGC	2	6	246557	246562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318966
4495	NC_016639	GTT	2	6	246754	246759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374318966
4496	NC_016639	CCATG	2	10	246772	246781	20 %	20 %	20 %	40 %	374318966
4497	NC_016639	T	6	6	246798	246803	0 %	100 %	0 %	0 %	374318966
4498	NC_016639	TGC	2	6	246861	246866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374318966
4499	NC_016639	AGT	2	6	246902	246907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318966
4500	NC_016639	T	7	7	246978	246984	0 %	100 %	0 %	0 %	374318966

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