MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia slovaca 13-B chromosome

Total Repeats: 22999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016639	AT	3	6	92127	92132	50 %	50 %	0 %	0 %	374318843
1502	NC_016639	ACT	2	6	92185	92190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318843
1503	NC_016639	ATA	2	6	92259	92264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318843
1504	NC_016639	ATT	2	6	92275	92280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318843
1505	NC_016639	CTA	2	6	92286	92291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318843
1506	NC_016639	ATG	2	6	92621	92626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318843
1507	NC_016639	TTGATT	2	12	92652	92663	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374318843
1508	NC_016639	TAA	2	6	92776	92781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318843
1509	NC_016639	TAT	2	6	92811	92816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318843
1510	NC_016639	GAA	3	9	92822	92830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318843
1511	NC_016639	CGCAT	3	15	92898	92912	20 %	20 %	20 %	40 %	374318843
1512	NC_016639	TTTA	2	8	92913	92920	25 %	75 %	0 %	0 %	374318843
1513	NC_016639	TAGC	2	8	93054	93061	25 %	25 %	25 %	25 %	374318843
1514	NC_016639	GTAT	2	8	93318	93325	25 %	50 %	25 %	0 %	374318844
1515	NC_016639	TATT	2	8	93332	93339	25 %	75 %	0 %	0 %	374318844
1516	NC_016639	TGA	2	6	93389	93394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318844
1517	NC_016639	AT	3	6	93459	93464	50 %	50 %	0 %	0 %	374318844
1518	NC_016639	TGA	2	6	93575	93580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318844
1519	NC_016639	ATA	2	6	93613	93618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318844
1520	NC_016639	ATA	2	6	93645	93650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318844
1521	NC_016639	AAT	2	6	93702	93707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318844
1522	NC_016639	GAAGCA	2	12	93744	93755	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	374318844
1523	NC_016639	AAG	2	6	93760	93765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318844
1524	NC_016639	A	6	6	93776	93781	100 %	0 %	0 %	0 %	374318844
1525	NC_016639	TGT	2	6	93806	93811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374318844
1526	NC_016639	A	6	6	93822	93827	100 %	0 %	0 %	0 %	374318844
1527	NC_016639	GAC	2	6	93837	93842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318844
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1529	NC_016639	TG	3	6	93936	93941	0 %	50 %	50 %	0 %	374318844
1530	NC_016639	AAG	2	6	94132	94137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318845
1531	NC_016639	CAA	2	6	94201	94206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374318845
1532	NC_016639	ACGT	2	8	94228	94235	25 %	25 %	25 %	25 %	374318845
1533	NC_016639	TTA	2	6	94263	94268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318845
1534	NC_016639	GGT	2	6	94325	94330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374318845
1535	NC_016639	ACC	2	6	94351	94356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374318845
1536	NC_016639	GCA	2	6	94470	94475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318845
1537	NC_016639	TTA	2	6	94518	94523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318845
1538	NC_016639	GGA	2	6	94526	94531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374318845
1539	NC_016639	ATG	2	6	94567	94572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318845
1540	NC_016639	TAA	2	6	94591	94596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318845
1541	NC_016639	CCG	2	6	94668	94673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374318845
1542	NC_016639	CGG	2	6	94778	94783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374318845
1543	NC_016639	ATT	2	6	94788	94793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318845
1544	NC_016639	TTA	2	6	94807	94812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318845
1545	NC_016639	TGC	2	6	94814	94819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374318845
1546	NC_016639	TAC	2	6	94823	94828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318845
1547	NC_016639	AAG	2	6	94850	94855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318845
1548	NC_016639	A	7	7	94971	94977	100 %	0 %	0 %	0 %	374318845
1549	NC_016639	GGTT	2	8	95023	95030	0 %	50 %	50 %	0 %	374318845
1550	NC_016639	GA	3	6	95039	95044	50 %	0 %	50 %	0 %	374318845
1551	NC_016639	TAA	2	6	95138	95143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318845
1552	NC_016639	TGA	2	6	95294	95299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318845
1553	NC_016639	ATT	2	6	95310	95315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318845
1554	NC_016639	GAA	2	6	95319	95324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318845
1555	NC_016639	ATG	2	6	95343	95348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318845
1556	NC_016639	TCGC	2	8	95402	95409	0 %	25 %	25 %	50 %	374318845
1557	NC_016639	ATT	2	6	95433	95438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318845
1558	NC_016639	CAA	2	6	95463	95468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374318845
1559	NC_016639	AGA	2	6	95477	95482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318845
1560	NC_016639	AAT	2	6	95490	95495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318845
1561	NC_016639	A	6	6	95520	95525	100 %	0 %	0 %	0 %	374318845
1562	NC_016639	AGT	2	6	95615	95620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318845
1563	NC_016639	TAT	2	6	95657	95662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318845
1564	NC_016639	CGTT	2	8	95685	95692	0 %	50 %	25 %	25 %	374318845
1565	NC_016639	AAG	2	6	95731	95736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318845
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1567	NC_016639	TAGT	2	8	95788	95795	25 %	50 %	25 %	0 %	374318845
1568	NC_016639	T	6	6	95808	95813	0 %	100 %	0 %	0 %	374318845
1569	NC_016639	ATA	2	6	95827	95832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318845
1570	NC_016639	ACT	2	6	95867	95872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318845
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1572	NC_016639	TTA	2	6	95931	95936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318845
1573	NC_016639	AGT	2	6	95943	95948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318845
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1576	NC_016639	TGAAA	2	10	96128	96137	60 %	20 %	20 %	0 %	374318845
1577	NC_016639	A	6	6	96135	96140	100 %	0 %	0 %	0 %	374318845
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1581	NC_016639	A	6	6	96317	96322	100 %	0 %	0 %	0 %	374318845
1582	NC_016639	TCA	2	6	96333	96338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318845
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1589	NC_016639	CAC	2	6	97343	97348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374318846
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1596	NC_016639	TTGAT	2	10	97789	97798	20 %	60 %	20 %	0 %	374318846
1597	NC_016639	AT	3	6	97873	97878	50 %	50 %	0 %	0 %	374318846
1598	NC_016639	TCC	2	6	97908	97913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374318846
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1602	NC_016639	CAT	2	6	98087	98092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318846
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1609	NC_016639	T	6	6	98331	98336	0 %	100 %	0 %	0 %	374318846
1610	NC_016639	AAG	2	6	98651	98656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318847
1611	NC_016639	ATA	2	6	98711	98716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318847
1612	NC_016639	ATT	2	6	98725	98730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318847
1613	NC_016639	TCT	2	6	98743	98748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374318847
1614	NC_016639	ATG	2	6	98756	98761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318847
1615	NC_016639	CTA	2	6	98804	98809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318847
1616	NC_016639	A	6	6	98820	98825	100 %	0 %	0 %	0 %	374318847
1617	NC_016639	TG	3	6	98862	98867	0 %	50 %	50 %	0 %	374318847
1618	NC_016639	TAT	2	6	98868	98873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318847
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1621	NC_016639	TTTTTA	2	12	99091	99102	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374318847
1622	NC_016639	AT	3	6	99150	99155	50 %	50 %	0 %	0 %	374318847
1623	NC_016639	AT	3	6	99294	99299	50 %	50 %	0 %	0 %	374318848
1624	NC_016639	TCT	2	6	99334	99339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374318848
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1995	NC_016639	AGT	2	6	115172	115177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318861
1996	NC_016639	AGA	2	6	115216	115221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318861
1997	NC_016639	ATT	2	6	115239	115244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318861
1998	NC_016639	TGA	2	6	115315	115320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318861
1999	NC_016639	CGC	2	6	115329	115334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374318861
2000	NC_016639	GAA	3	9	115388	115396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318861

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