MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 22440

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_016050	AGTAG	2	10	358213	358222	40 %	20 %	40 %	0 %	350273322
6503	NC_016050	AGT	2	6	358278	358283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273322
6504	NC_016050	AGA	2	6	358299	358304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273322
6505	NC_016050	GTT	2	6	358348	358353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273322
6506	NC_016050	T	7	7	358352	358358	0 %	100 %	0 %	0 %	350273322
6507	NC_016050	AG	3	6	358441	358446	50 %	0 %	50 %	0 %	350273322
6508	NC_016050	GTA	2	6	358448	358453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273322
6509	NC_016050	TGC	2	6	358500	358505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273322
6510	NC_016050	ATA	2	6	358523	358528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273322
6511	NC_016050	AAT	2	6	358581	358586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273322
6512	NC_016050	A	7	7	358597	358603	100 %	0 %	0 %	0 %	350273322
6513	NC_016050	GAA	2	6	358624	358629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273322
6514	NC_016050	T	6	6	358636	358641	0 %	100 %	0 %	0 %	350273322
6515	NC_016050	AAG	2	6	358679	358684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273322
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6517	NC_016050	CCTTCC	2	12	358731	358742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350273322
6518	NC_016050	TTA	2	6	358815	358820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273322
6519	NC_016050	CTCG	2	8	359045	359052	0 %	25 %	25 %	50 %	350273323
6520	NC_016050	TA	3	6	359061	359066	50 %	50 %	0 %	0 %	350273323
6521	NC_016050	GTT	2	6	359150	359155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273323
6522	NC_016050	TA	3	6	359219	359224	50 %	50 %	0 %	0 %	350273323
6523	NC_016050	TCT	2	6	359260	359265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273323
6524	NC_016050	TCT	2	6	359328	359333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273323
6525	NC_016050	CCG	2	6	359470	359475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350273323
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6529	NC_016050	TTA	2	6	359587	359592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273323
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6541	NC_016050	ATC	2	6	360267	360272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273323
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6545	NC_016050	TTTG	2	8	360472	360479	0 %	75 %	25 %	0 %	350273323
6546	NC_016050	CACGCT	2	12	360644	360655	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	350273323
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6550	NC_016050	TTTA	2	8	360963	360970	25 %	75 %	0 %	0 %	350273324
6551	NC_016050	GA	3	6	361019	361024	50 %	0 %	50 %	0 %	350273324
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6554	NC_016050	GAA	2	6	361078	361083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273324
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6993	NC_016050	AAT	2	6	390227	390232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273346
6994	NC_016050	CTA	2	6	390236	390241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273346
6995	NC_016050	ATT	2	6	390286	390291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273346
6996	NC_016050	ATA	2	6	390305	390310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273346
6997	NC_016050	ATC	2	6	390322	390327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273346
6998	NC_016050	TA	3	6	390344	390349	50 %	50 %	0 %	0 %	350273346
6999	NC_016050	TAT	2	6	390365	390370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273346
7000	NC_016050	A	6	6	390388	390393	100 %	0 %	0 %	0 %	350273346

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