MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49001	NC_015966	GCGATG	2	12	2252714	2252725	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345303809
49002	NC_015966	GCA	2	6	2252748	2252753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303809
49003	NC_015966	CCA	2	6	2252760	2252765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303809
49004	NC_015966	CGTT	2	8	2252795	2252802	0 %	50 %	25 %	25 %	345303809
49005	NC_015966	GGC	2	6	2252847	2252852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303809
49006	NC_015966	CTT	3	9	2252856	2252864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303809
49007	NC_015966	GTT	2	6	2252875	2252880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303809
49008	NC_015966	GGC	2	6	2252901	2252906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303809
49009	NC_015966	C	6	6	2252936	2252941	0 %	0 %	0 %	100 %	345303809
49010	NC_015966	GCC	2	6	2253017	2253022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303809
49011	NC_015966	CCAG	2	8	2253036	2253043	25 %	0 %	25 %	50 %	345303809
49012	NC_015966	C	6	6	2253066	2253071	0 %	0 %	0 %	100 %	345303809
49013	NC_015966	CTC	2	6	2253124	2253129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303809
49014	NC_015966	GCATCG	2	12	2253197	2253208	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345303809
49015	NC_015966	GC	3	6	2253257	2253262	0 %	0 %	50 %	50 %	345303809
49016	NC_015966	CGT	2	6	2253279	2253284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303809
49017	NC_015966	GCC	2	6	2253287	2253292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303809
49018	NC_015966	TCG	2	6	2253330	2253335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303809
49019	NC_015966	CGAA	2	8	2253364	2253371	50 %	0 %	25 %	25 %	345303809
49020	NC_015966	CGG	2	6	2253472	2253477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303809
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49022	NC_015966	GCA	2	6	2253656	2253661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303810
49023	NC_015966	ACG	2	6	2253745	2253750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303810
49024	NC_015966	GC	3	6	2253753	2253758	0 %	0 %	50 %	50 %	345303810
49025	NC_015966	TTC	2	6	2253849	2253854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303810
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49028	NC_015966	GCA	2	6	2253929	2253934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303810
49029	NC_015966	TCG	2	6	2253946	2253951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303810
49030	NC_015966	CGGCA	2	10	2254056	2254065	20 %	0 %	40 %	40 %	345303810
49031	NC_015966	CTGA	2	8	2254266	2254273	25 %	25 %	25 %	25 %	345303810
49032	NC_015966	CGC	2	6	2254277	2254282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303810
49033	NC_015966	GC	4	8	2254313	2254320	0 %	0 %	50 %	50 %	345303810
49034	NC_015966	AGC	2	6	2254321	2254326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303810
49035	NC_015966	TCG	2	6	2254366	2254371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303810
49036	NC_015966	CTT	2	6	2254415	2254420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303810
49037	NC_015966	CGACC	2	10	2254436	2254445	20 %	0 %	20 %	60 %	345303810
49038	NC_015966	CGCC	2	8	2254475	2254482	0 %	0 %	25 %	75 %	345303810
49039	NC_015966	GAC	2	6	2254497	2254502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303810
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49042	NC_015966	CCCG	2	8	2254586	2254593	0 %	0 %	25 %	75 %	345303810
49043	NC_015966	GAT	2	6	2254626	2254631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303810
49044	NC_015966	CGA	2	6	2254660	2254665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303810
49045	NC_015966	CGA	2	6	2254830	2254835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303811
49046	NC_015966	GCT	2	6	2254836	2254841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303811
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49049	NC_015966	CTG	2	6	2254987	2254992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303811
49050	NC_015966	GGT	2	6	2255025	2255030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303811
49051	NC_015966	GCT	2	6	2255058	2255063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303811
49052	NC_015966	GCC	2	6	2255078	2255083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303811
49053	NC_015966	GGT	2	6	2255125	2255130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303811
49054	NC_015966	CGG	2	6	2255147	2255152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303811
49055	NC_015966	CTGCG	2	10	2255158	2255167	0 %	20 %	40 %	40 %	345303811
49056	NC_015966	CGC	3	9	2255168	2255176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303811
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49064	NC_015966	CCAG	2	8	2255472	2255479	25 %	0 %	25 %	50 %	345303811
49065	NC_015966	GC	3	6	2255487	2255492	0 %	0 %	50 %	50 %	345303811
49066	NC_015966	TCG	2	6	2255534	2255539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303811
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49069	NC_015966	CCGTT	2	10	2255721	2255730	0 %	40 %	20 %	40 %	345303811
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49092	NC_015966	CGGCG	2	10	2257161	2257170	0 %	0 %	60 %	40 %	345303812
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49116	NC_015966	CCA	2	6	2258107	2258112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303812
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49220	NC_015966	CAG	2	6	2263104	2263109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303816
49221	NC_015966	GGC	2	6	2263110	2263115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303816
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49224	NC_015966	CCA	2	6	2263211	2263216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303816
49225	NC_015966	CCA	2	6	2263218	2263223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303816
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49228	NC_015966	GGC	2	6	2263260	2263265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303816
49229	NC_015966	CCA	2	6	2263307	2263312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303816
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49231	NC_015966	CGT	2	6	2263416	2263421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303816
49232	NC_015966	CAT	2	6	2263971	2263976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303817
49233	NC_015966	GCC	2	6	2264056	2264061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303817
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49332	NC_015966	T	6	6	2268080	2268085	0 %	100 %	0 %	0 %	345303821
49333	NC_015966	TC	3	6	2268090	2268095	0 %	50 %	0 %	50 %	345303821
49334	NC_015966	TCA	2	6	2268114	2268119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303821
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49336	NC_015966	CAA	2	6	2268175	2268180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303821
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49339	NC_015966	ACA	2	6	2268360	2268365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303821
49340	NC_015966	GGA	2	6	2268444	2268449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303821
49341	NC_015966	TCC	2	6	2268509	2268514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303821
49342	NC_015966	AGA	2	6	2268600	2268605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303821
49343	NC_015966	TCC	2	6	2269808	2269813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303822
49344	NC_015966	TACCAA	2	12	2269954	2269965	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	345303822
49345	NC_015966	GCT	2	6	2270000	2270005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303822
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49347	NC_015966	AGA	2	6	2270054	2270059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303822
49348	NC_015966	AGAA	2	8	2270073	2270080	75 %	0 %	25 %	0 %	345303822
49349	NC_015966	TCA	2	6	2270114	2270119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303822
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49458	NC_015966	CAG	2	6	2275404	2275409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303827
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49465	NC_015966	CGC	2	6	2275773	2275778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303827
49466	NC_015966	TCC	2	6	2275792	2275797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303827
49467	NC_015966	CAA	2	6	2275836	2275841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303827
49468	NC_015966	C	6	6	2275842	2275847	0 %	0 %	0 %	100 %	345303827
49469	NC_015966	TCC	2	6	2275906	2275911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303827
49470	NC_015966	GC	3	6	2275925	2275930	0 %	0 %	50 %	50 %	345303827
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49474	NC_015966	GTA	2	6	2276028	2276033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303827
49475	NC_015966	CG	3	6	2276081	2276086	0 %	0 %	50 %	50 %	345303827
49476	NC_015966	CAG	2	6	2276094	2276099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303827
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49478	NC_015966	CGAA	2	8	2276171	2276178	50 %	0 %	25 %	25 %	345303827
49479	NC_015966	ACGT	2	8	2276242	2276249	25 %	25 %	25 %	25 %	345303827
49480	NC_015966	CAG	2	6	2276259	2276264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303827
49481	NC_015966	CCA	3	9	2276267	2276275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303827
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49485	NC_015966	GGCG	2	8	2276324	2276331	0 %	0 %	75 %	25 %	345303827
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49489	NC_015966	ACC	2	6	2276390	2276395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303827
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49491	NC_015966	GGC	2	6	2276410	2276415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303827
49492	NC_015966	CTG	2	6	2276436	2276441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303827
49493	NC_015966	GCA	2	6	2279278	2279283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303828
49494	NC_015966	AAC	2	6	2279289	2279294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303828
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