MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48502	NC_015966	CAG	2	6	2227162	2227167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303791
48503	NC_015966	AGC	2	6	2227218	2227223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303791
48504	NC_015966	CCT	2	6	2227254	2227259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303791
48505	NC_015966	CGGCC	2	10	2227281	2227290	0 %	0 %	40 %	60 %	345303791
48506	NC_015966	CGG	2	6	2227357	2227362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303791
48507	NC_015966	CGG	2	6	2227410	2227415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303791
48508	NC_015966	TCG	2	6	2227427	2227432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303791
48509	NC_015966	GCG	2	6	2227473	2227478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303791
48510	NC_015966	TCG	2	6	2227481	2227486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303791
48511	NC_015966	GCC	2	6	2227553	2227558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303791
48512	NC_015966	CAG	2	6	2227564	2227569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303791
48513	NC_015966	CGCC	2	8	2227573	2227580	0 %	0 %	25 %	75 %	345303791
48514	NC_015966	GCC	2	6	2227785	2227790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303792
48515	NC_015966	GTA	2	6	2227814	2227819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303792
48516	NC_015966	CCA	2	6	2227850	2227855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303792
48517	NC_015966	CGGCG	2	10	2227870	2227879	0 %	0 %	60 %	40 %	345303792
48518	NC_015966	GTA	2	6	2227895	2227900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303792
48519	NC_015966	CCA	3	9	2228002	2228010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303792
48520	NC_015966	GCC	2	6	2228040	2228045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303792
48521	NC_015966	CGAA	2	8	2228074	2228081	50 %	0 %	25 %	25 %	345303792
48522	NC_015966	CCA	2	6	2228130	2228135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303792
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48524	NC_015966	GTT	2	6	2228186	2228191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303792
48525	NC_015966	GCA	2	6	2228236	2228241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303792
48526	NC_015966	TCGA	2	8	2228247	2228254	25 %	25 %	25 %	25 %	345303792
48527	NC_015966	GTT	2	6	2228297	2228302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303792
48528	NC_015966	TGA	2	6	2228328	2228333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303792
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48530	NC_015966	GC	4	8	2228644	2228651	0 %	0 %	50 %	50 %	345303793
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48532	NC_015966	GCG	2	6	2228762	2228767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303793
48533	NC_015966	GCC	2	6	2228768	2228773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303793
48534	NC_015966	CCG	2	6	2228780	2228785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303793
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48538	NC_015966	GC	3	6	2228965	2228970	0 %	0 %	50 %	50 %	345303793
48539	NC_015966	GCG	2	6	2229019	2229024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303793
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48541	NC_015966	CG	3	6	2229086	2229091	0 %	0 %	50 %	50 %	345303794
48542	NC_015966	CG	3	6	2229114	2229119	0 %	0 %	50 %	50 %	345303794
48543	NC_015966	GAA	2	6	2229133	2229138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303794
48544	NC_015966	CGGC	2	8	2229159	2229166	0 %	0 %	50 %	50 %	345303794
48545	NC_015966	CG	3	6	2229225	2229230	0 %	0 %	50 %	50 %	345303794
48546	NC_015966	TCC	2	6	2229239	2229244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303794
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48550	NC_015966	CTG	2	6	2229505	2229510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303794
48551	NC_015966	GGC	2	6	2229514	2229519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303794
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48553	NC_015966	GGT	2	6	2229601	2229606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303794
48554	NC_015966	GCC	2	6	2229610	2229615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303794
48555	NC_015966	CGA	2	6	2229633	2229638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303794
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48559	NC_015966	GCA	2	6	2229819	2229824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303794
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48563	NC_015966	AGCC	2	8	2229925	2229932	25 %	0 %	25 %	50 %	345303794
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48585	NC_015966	CAG	3	9	2230889	2230897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303795
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48589	NC_015966	GCCGT	2	10	2231089	2231098	0 %	20 %	40 %	40 %	345303796
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48599	NC_015966	ATCC	2	8	2231828	2231835	25 %	25 %	0 %	50 %	345303796
48600	NC_015966	GTC	2	6	2231880	2231885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303796
48601	NC_015966	GAT	2	6	2231910	2231915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303796
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48604	NC_015966	GTT	2	6	2232089	2232094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303796
48605	NC_015966	CCCA	2	8	2232112	2232119	25 %	0 %	0 %	75 %	345303796
48606	NC_015966	CCGC	2	8	2232167	2232174	0 %	0 %	25 %	75 %	345303796
48607	NC_015966	CGG	2	6	2232179	2232184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303796
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48614	NC_015966	CAC	2	6	2235939	2235944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303797
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48616	NC_015966	ACG	2	6	2236029	2236034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303797
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48729	NC_015966	GTC	2	6	2241350	2241355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303801
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48732	NC_015966	CGG	2	6	2241415	2241420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303801
48733	NC_015966	GGC	2	6	2241440	2241445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303801
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48841	NC_015966	CGGG	2	8	2245533	2245540	0 %	0 %	75 %	25 %	345303805
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48843	NC_015966	GC	3	6	2245560	2245565	0 %	0 %	50 %	50 %	345303805
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48848	NC_015966	CTG	2	6	2245792	2245797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303805
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48961	NC_015966	GCG	2	6	2251224	2251229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303809
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