MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_015966	CGC	2	6	2042950	2042955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303632
44502	NC_015966	AGC	2	6	2042999	2043004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303632
44503	NC_015966	CT	3	6	2043019	2043024	0 %	50 %	0 %	50 %	345303632
44504	NC_015966	ATCC	2	8	2043080	2043087	25 %	25 %	0 %	50 %	345303632
44505	NC_015966	CTG	2	6	2043117	2043122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303633
44506	NC_015966	GCA	2	6	2043150	2043155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303633
44507	NC_015966	CCA	2	6	2043159	2043164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303633
44508	NC_015966	TAC	2	6	2043201	2043206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303633
44509	NC_015966	TGC	2	6	2043299	2043304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303633
44510	NC_015966	CGA	2	6	2043315	2043320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303633
44511	NC_015966	GTT	2	6	2043400	2043405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303633
44512	NC_015966	CGT	2	6	2043456	2043461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303633
44513	NC_015966	GTA	2	6	2043499	2043504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303633
44514	NC_015966	CGC	2	6	2043537	2043542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303633
44515	NC_015966	GTC	2	6	2043565	2043570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303633
44516	NC_015966	GGC	2	6	2043619	2043624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303633
44517	NC_015966	CAC	2	6	2043793	2043798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303633
44518	NC_015966	CAT	2	6	2043810	2043815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303633
44519	NC_015966	CCG	2	6	2043938	2043943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303633
44520	NC_015966	CTC	2	6	2043994	2043999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303633
44521	NC_015966	CTG	3	9	2044072	2044080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303633
44522	NC_015966	CGT	2	6	2044336	2044341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303634
44523	NC_015966	TGGTAT	2	12	2044349	2044360	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	345303634
44524	NC_015966	TGC	2	6	2044361	2044366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303634
44525	NC_015966	CTG	2	6	2044406	2044411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303634
44526	NC_015966	C	6	6	2044468	2044473	0 %	0 %	0 %	100 %	345303634
44527	NC_015966	CCG	2	6	2044508	2044513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303634
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44529	NC_015966	GCA	2	6	2044539	2044544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303634
44530	NC_015966	CCGC	2	8	2044565	2044572	0 %	0 %	25 %	75 %	345303634
44531	NC_015966	CGG	2	6	2044588	2044593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303634
44532	NC_015966	CGT	2	6	2044689	2044694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303634
44533	NC_015966	GCCG	2	8	2044704	2044711	0 %	0 %	50 %	50 %	345303634
44534	NC_015966	CGG	2	6	2044719	2044724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303634
44535	NC_015966	CCG	2	6	2044784	2044789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303634
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44537	NC_015966	ACG	2	6	2044928	2044933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303634
44538	NC_015966	TTC	2	6	2044942	2044947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303634
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44540	NC_015966	GGCT	2	8	2045077	2045084	0 %	25 %	50 %	25 %	345303634
44541	NC_015966	GAA	2	6	2045116	2045121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303634
44542	NC_015966	GCC	2	6	2045231	2045236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303634
44543	NC_015966	CGACGG	2	12	2045334	2045345	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345303634
44544	NC_015966	CAG	2	6	2045419	2045424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303634
44545	NC_015966	CAT	2	6	2045502	2045507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303634
44546	NC_015966	CGG	3	9	2045508	2045516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303634
44547	NC_015966	ATG	2	6	2045530	2045535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303634
44548	NC_015966	CGC	2	6	2045556	2045561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303634
44549	NC_015966	CTA	2	6	2045577	2045582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303634
44550	NC_015966	TCG	2	6	2045624	2045629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303634
44551	NC_015966	TGGA	2	8	2045653	2045660	25 %	25 %	50 %	0 %	345303634
44552	NC_015966	GCA	2	6	2045666	2045671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303634
44553	NC_015966	TTC	2	6	2045704	2045709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303634
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44556	NC_015966	GCT	2	6	2045853	2045858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303634
44557	NC_015966	CTG	2	6	2045875	2045880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303634
44558	NC_015966	GC	3	6	2045898	2045903	0 %	0 %	50 %	50 %	345303634
44559	NC_015966	ACCCCT	2	12	2045939	2045950	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	345303634
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44561	NC_015966	GGC	2	6	2046070	2046075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303634
44562	NC_015966	GACGTG	2	12	2046169	2046180	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345303634
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44565	NC_015966	GC	3	6	2046297	2046302	0 %	0 %	50 %	50 %	345303634
44566	NC_015966	CCGG	2	8	2046304	2046311	0 %	0 %	50 %	50 %	345303634
44567	NC_015966	TCGG	2	8	2046331	2046338	0 %	25 %	50 %	25 %	345303635
44568	NC_015966	GCACGC	2	12	2046359	2046370	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345303635
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44573	NC_015966	GAC	2	6	2046657	2046662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303635
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44575	NC_015966	GCG	2	6	2046695	2046700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303635
44576	NC_015966	GCC	2	6	2046712	2046717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303635
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44578	NC_015966	GCT	3	9	2046728	2046736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303635
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44583	NC_015966	GCC	2	6	2046978	2046983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303636
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44587	NC_015966	CGA	2	6	2047048	2047053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303636
44588	NC_015966	CGA	2	6	2047094	2047099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303636
44589	NC_015966	C	6	6	2047112	2047117	0 %	0 %	0 %	100 %	345303636
44590	NC_015966	CGAA	2	8	2047138	2047145	50 %	0 %	25 %	25 %	345303636
44591	NC_015966	GAT	2	6	2047160	2047165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303636
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44595	NC_015966	CCAG	2	8	2047342	2047349	25 %	0 %	25 %	50 %	345303636
44596	NC_015966	GGTG	2	8	2047416	2047423	0 %	25 %	75 %	0 %	345303637
44597	NC_015966	GTA	2	6	2047430	2047435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303637
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44601	NC_015966	CCG	2	6	2047593	2047598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303637
44602	NC_015966	GCG	2	6	2047778	2047783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303637
44603	NC_015966	CCG	2	6	2047790	2047795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303637
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44605	NC_015966	TCC	2	6	2047809	2047814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303637
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44608	NC_015966	GC	4	8	2047906	2047913	0 %	0 %	50 %	50 %	345303637
44609	NC_015966	CA	3	6	2047936	2047941	50 %	0 %	0 %	50 %	345303637
44610	NC_015966	CAG	2	6	2047943	2047948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303637
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44613	NC_015966	AGCC	2	8	2048210	2048217	25 %	0 %	25 %	50 %	345303638
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44615	NC_015966	CTC	2	6	2048246	2048251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303638
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44728	NC_015966	CG	3	6	2053402	2053407	0 %	0 %	50 %	50 %	345303642
44729	NC_015966	CGC	2	6	2053458	2053463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303642
44730	NC_015966	CCGAT	2	10	2053470	2053479	20 %	20 %	20 %	40 %	345303642
44731	NC_015966	GGC	2	6	2053514	2053519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303642
44732	NC_015966	CCA	2	6	2053540	2053545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303642
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44734	NC_015966	CGC	2	6	2053609	2053614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303642
44735	NC_015966	GCG	2	6	2053641	2053646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303642
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44743	NC_015966	ACGT	2	8	2053906	2053913	25 %	25 %	25 %	25 %	345303642
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44750	NC_015966	CGCC	2	8	2054455	2054462	0 %	0 %	25 %	75 %	345303643
44751	NC_015966	TACC	2	8	2054473	2054480	25 %	25 %	0 %	50 %	345303643
44752	NC_015966	TTTTC	2	10	2054488	2054497	0 %	80 %	0 %	20 %	345303643
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44757	NC_015966	TTC	2	6	2054697	2054702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303643
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44761	NC_015966	TCG	2	6	2054886	2054891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303643
44762	NC_015966	ACC	2	6	2054912	2054917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303643
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44827	NC_015966	CGG	2	6	2057777	2057782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303645
44828	NC_015966	CAG	3	9	2057956	2057964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303646
44829	NC_015966	GCTG	2	8	2058009	2058016	0 %	25 %	50 %	25 %	345303646
44830	NC_015966	CAG	3	9	2058040	2058048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303646
44831	NC_015966	A	6	6	2058085	2058090	100 %	0 %	0 %	0 %	345303646
44832	NC_015966	CGG	2	6	2058115	2058120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303646
44833	NC_015966	AGC	2	6	2058134	2058139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303646
44834	NC_015966	GACT	2	8	2058152	2058159	25 %	25 %	25 %	25 %	345303646
44835	NC_015966	AGC	2	6	2058182	2058187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303646
44836	NC_015966	TGG	2	6	2058213	2058218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303646
44837	NC_015966	CAC	2	6	2058220	2058225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303646
44838	NC_015966	CAG	2	6	2058229	2058234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303646
44839	NC_015966	GGC	2	6	2058238	2058243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303646
44840	NC_015966	CAG	2	6	2058253	2058258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303646
44841	NC_015966	GCC	2	6	2058280	2058285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303646
44842	NC_015966	GTC	2	6	2058292	2058297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303646
44843	NC_015966	CGC	2	6	2058328	2058333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303646
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44961	NC_015966	GAT	2	6	2064806	2064811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303653
44962	NC_015966	GGC	2	6	2064813	2064818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303653
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44998	NC_015966	CGGCG	2	10	2066558	2066567	0 %	0 %	60 %	40 %	345303654
44999	NC_015966	CTG	2	6	2066579	2066584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303654
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