MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_015966	GAC	2	6	2021782	2021787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303610
44002	NC_015966	TCC	2	6	2021807	2021812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303610
44003	NC_015966	CGC	2	6	2021853	2021858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303610
44004	NC_015966	CGACCG	2	12	2021886	2021897	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345303610
44005	NC_015966	CTGC	2	8	2021973	2021980	0 %	25 %	25 %	50 %	345303610
44006	NC_015966	TCC	2	6	2021999	2022004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303610
44007	NC_015966	CTA	2	6	2022006	2022011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303610
44008	NC_015966	AG	3	6	2022037	2022042	50 %	0 %	50 %	0 %	345303610
44009	NC_015966	CGT	2	6	2022144	2022149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303611
44010	NC_015966	GC	3	6	2022156	2022161	0 %	0 %	50 %	50 %	345303611
44011	NC_015966	AGC	2	6	2022176	2022181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303611
44012	NC_015966	CGG	2	6	2022204	2022209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303611
44013	NC_015966	TGC	2	6	2022244	2022249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303611
44014	NC_015966	CAA	2	6	2022332	2022337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303611
44015	NC_015966	TGG	2	6	2022361	2022366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303611
44016	NC_015966	TGC	2	6	2022418	2022423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303611
44017	NC_015966	CTG	2	6	2022432	2022437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303611
44018	NC_015966	CG	3	6	2022477	2022482	0 %	0 %	50 %	50 %	345303611
44019	NC_015966	CTG	3	9	2022507	2022515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303611
44020	NC_015966	GCT	2	6	2022521	2022526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303611
44021	NC_015966	GCC	2	6	2022528	2022533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303611
44022	NC_015966	CGT	2	6	2022551	2022556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303611
44023	NC_015966	CTGGGG	2	12	2022591	2022602	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	345303611
44024	NC_015966	CTG	3	9	2022654	2022662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303611
44025	NC_015966	TGC	2	6	2022682	2022687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303611
44026	NC_015966	CTG	2	6	2022732	2022737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303611
44027	NC_015966	GCC	3	9	2022738	2022746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303611
44028	NC_015966	CCG	3	9	2022758	2022766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303611
44029	NC_015966	CGC	3	9	2022798	2022806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303611
44030	NC_015966	GC	3	6	2022819	2022824	0 %	0 %	50 %	50 %	345303611
44031	NC_015966	GAG	2	6	2022837	2022842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303611
44032	NC_015966	CGCC	2	8	2022850	2022857	0 %	0 %	25 %	75 %	345303611
44033	NC_015966	C	6	6	2022870	2022875	0 %	0 %	0 %	100 %	345303611
44034	NC_015966	CAC	2	6	2022908	2022913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303611
44035	NC_015966	CCG	2	6	2023006	2023011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303611
44036	NC_015966	GAA	2	6	2023053	2023058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303611
44037	NC_015966	ATCG	2	8	2023071	2023078	25 %	25 %	25 %	25 %	345303611
44038	NC_015966	CCA	2	6	2023096	2023101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303611
44039	NC_015966	TCC	2	6	2023109	2023114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303611
44040	NC_015966	CGC	2	6	2023123	2023128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303611
44041	NC_015966	CGAT	2	8	2023129	2023136	25 %	25 %	25 %	25 %	345303611
44042	NC_015966	GAA	2	6	2023179	2023184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303611
44043	NC_015966	CAA	2	6	2023193	2023198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303611
44044	NC_015966	ACA	2	6	2023228	2023233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303611
44045	NC_015966	TCG	2	6	2023258	2023263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303611
44046	NC_015966	GAC	2	6	2023335	2023340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303611
44047	NC_015966	TCA	2	6	2023615	2023620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303611
44048	NC_015966	TGA	2	6	2023663	2023668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303611
44049	NC_015966	GCA	2	6	2023691	2023696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303611
44050	NC_015966	CAT	2	6	2023751	2023756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303611
44051	NC_015966	GCA	2	6	2023846	2023851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303611
44052	NC_015966	CCG	2	6	2023865	2023870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303611
44053	NC_015966	AAG	2	6	2023876	2023881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303611
44054	NC_015966	GTG	2	6	2023926	2023931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303611
44055	NC_015966	ATC	2	6	2023932	2023937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303611
44056	NC_015966	TGA	3	9	2023954	2023962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303611
44057	NC_015966	CGGC	2	8	2023963	2023970	0 %	0 %	50 %	50 %	345303611
44058	NC_015966	CCA	2	6	2024119	2024124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303611
44059	NC_015966	TGG	2	6	2024170	2024175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303611
44060	NC_015966	ATG	2	6	2024196	2024201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303611
44061	NC_015966	CGTT	2	8	2024230	2024237	0 %	50 %	25 %	25 %	345303611
44062	NC_015966	TCGA	2	8	2024238	2024245	25 %	25 %	25 %	25 %	345303611
44063	NC_015966	AGC	2	6	2024278	2024283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303611
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44065	NC_015966	AGC	2	6	2024349	2024354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303611
44066	NC_015966	ACG	2	6	2024362	2024367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303611
44067	NC_015966	GAA	2	6	2024376	2024381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303611
44068	NC_015966	GCC	2	6	2024382	2024387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303611
44069	NC_015966	CAT	2	6	2024390	2024395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303611
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44071	NC_015966	CGC	2	6	2024459	2024464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303611
44072	NC_015966	GAA	2	6	2024484	2024489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303611
44073	NC_015966	CGC	2	6	2024526	2024531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303611
44074	NC_015966	CGA	2	6	2024558	2024563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303611
44075	NC_015966	CGCT	2	8	2024571	2024578	0 %	25 %	25 %	50 %	345303611
44076	NC_015966	CTT	2	6	2024584	2024589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303611
44077	NC_015966	CAT	2	6	2024606	2024611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303612
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44082	NC_015966	ACC	2	6	2024849	2024854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303612
44083	NC_015966	CGC	2	6	2024864	2024869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303612
44084	NC_015966	CCA	2	6	2024904	2024909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303612
44085	NC_015966	GGGC	2	8	2024914	2024921	0 %	0 %	75 %	25 %	345303612
44086	NC_015966	GCC	2	6	2024994	2024999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303612
44087	NC_015966	GTC	2	6	2025106	2025111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303613
44088	NC_015966	CGA	2	6	2025126	2025131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303613
44089	NC_015966	GCCG	2	8	2025232	2025239	0 %	0 %	50 %	50 %	345303613
44090	NC_015966	AGC	2	6	2025249	2025254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303613
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44094	NC_015966	CCAGGC	2	12	2025469	2025480	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345303613
44095	NC_015966	CCGG	2	8	2025547	2025554	0 %	0 %	50 %	50 %	345303613
44096	NC_015966	CGC	2	6	2025753	2025758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303613
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44099	NC_015966	CGG	2	6	2025792	2025797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303613
44100	NC_015966	CGG	2	6	2025882	2025887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303613
44101	NC_015966	GCC	2	6	2025903	2025908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303613
44102	NC_015966	GCA	2	6	2025931	2025936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303613
44103	NC_015966	CTG	3	9	2026132	2026140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303614
44104	NC_015966	TCA	2	6	2026295	2026300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303614
44105	NC_015966	GATCA	2	10	2026333	2026342	40 %	20 %	20 %	20 %	345303614
44106	NC_015966	TGG	2	6	2026388	2026393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303614
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44108	NC_015966	ACGGCC	2	12	2026597	2026608	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345303614
44109	NC_015966	GC	3	6	2026617	2026622	0 %	0 %	50 %	50 %	345303614
44110	NC_015966	CGC	2	6	2026645	2026650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303614
44111	NC_015966	GTG	2	6	2026711	2026716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303614
44112	NC_015966	GGT	2	6	2026740	2026745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303614
44113	NC_015966	CAGC	2	8	2026755	2026762	25 %	0 %	25 %	50 %	345303614
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44115	NC_015966	ACC	2	6	2026957	2026962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303615
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44117	NC_015966	TGG	2	6	2026996	2027001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303615
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44334	NC_015966	CGA	2	6	2036132	2036137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303625
44335	NC_015966	ATG	2	6	2036150	2036155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303625
44336	NC_015966	CCGG	2	8	2036167	2036174	0 %	0 %	50 %	50 %	345303625
44337	NC_015966	TTC	2	6	2036233	2036238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303625
44338	NC_015966	CGT	2	6	2036294	2036299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303625
44339	NC_015966	CGG	2	6	2036319	2036324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303625
44340	NC_015966	TCACGA	2	12	2036352	2036363	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345303625
44341	NC_015966	CCG	2	6	2036421	2036426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303625
44342	NC_015966	CAG	2	6	2036431	2036436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303625
44343	NC_015966	GGTC	2	8	2036445	2036452	0 %	25 %	50 %	25 %	345303625
44344	NC_015966	CTG	2	6	2036485	2036490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303625
44345	NC_015966	CAG	3	9	2036509	2036517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303625
44346	NC_015966	CACC	2	8	2036524	2036531	25 %	0 %	0 %	75 %	345303625
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44355	NC_015966	CTGCGC	2	12	2036842	2036853	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345303626
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44454	NC_015966	ACC	2	6	2041575	2041580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303631
44455	NC_015966	GAT	2	6	2041664	2041669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303631
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44457	NC_015966	CAG	2	6	2041706	2041711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303631
44458	NC_015966	A	6	6	2041727	2041732	100 %	0 %	0 %	0 %	345303631
44459	NC_015966	CG	3	6	2041828	2041833	0 %	0 %	50 %	50 %	345303631
44460	NC_015966	CTC	2	6	2041841	2041846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303631
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44463	NC_015966	CAT	2	6	2041901	2041906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303631
44464	NC_015966	CTT	2	6	2041942	2041947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303631
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44473	NC_015966	CTTT	2	8	2042168	2042175	0 %	75 %	0 %	25 %	345303632
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44481	NC_015966	GCC	2	6	2042447	2042452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303632
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44484	NC_015966	AGCG	2	8	2042516	2042523	25 %	0 %	50 %	25 %	345303632
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44491	NC_015966	GAC	2	6	2042680	2042685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303632
44492	NC_015966	CAG	2	6	2042701	2042706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303632
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