MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_015966	GCT	2	6	1977893	1977898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303572
43003	NC_015966	CTC	2	6	1978143	1978148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303573
43004	NC_015966	GAG	2	6	1978165	1978170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303573
43005	NC_015966	GTTG	2	8	1978184	1978191	0 %	50 %	50 %	0 %	345303573
43006	NC_015966	TCG	2	6	1978222	1978227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303573
43007	NC_015966	TCA	2	6	1978261	1978266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303573
43008	NC_015966	CTG	2	6	1978278	1978283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303573
43009	NC_015966	CGG	2	6	1978327	1978332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303573
43010	NC_015966	CGGC	2	8	1978340	1978347	0 %	0 %	50 %	50 %	345303573
43011	NC_015966	GAA	2	6	1978356	1978361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303573
43012	NC_015966	GCGGA	2	10	1978371	1978380	20 %	0 %	60 %	20 %	345303573
43013	NC_015966	GC	3	6	1978398	1978403	0 %	0 %	50 %	50 %	345303573
43014	NC_015966	GCC	3	9	1978405	1978413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303573
43015	NC_015966	CGGC	2	8	1978418	1978425	0 %	0 %	50 %	50 %	345303573
43016	NC_015966	GTC	2	6	1978434	1978439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303573
43017	NC_015966	CCA	2	6	1978442	1978447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303573
43018	NC_015966	TGC	2	6	1978495	1978500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303573
43019	NC_015966	CCG	2	6	1978523	1978528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303573
43020	NC_015966	TCC	2	6	1978567	1978572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303573
43021	NC_015966	AGGTC	2	10	1978577	1978586	20 %	20 %	40 %	20 %	345303573
43022	NC_015966	CGTA	2	8	1978624	1978631	25 %	25 %	25 %	25 %	345303573
43023	NC_015966	AAC	2	6	1978666	1978671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303573
43024	NC_015966	CGCC	2	8	1978682	1978689	0 %	0 %	25 %	75 %	345303573
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43028	NC_015966	CGA	2	6	1978799	1978804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303573
43029	NC_015966	CCGCT	2	10	1978867	1978876	0 %	20 %	20 %	60 %	345303573
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43032	NC_015966	T	6	6	1979047	1979052	0 %	100 %	0 %	0 %	345303573
43033	NC_015966	GGT	2	6	1979084	1979089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303574
43034	NC_015966	CTGACG	2	12	1979099	1979110	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345303574
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43043	NC_015966	GCCGG	2	10	1979371	1979380	0 %	0 %	60 %	40 %	345303574
43044	NC_015966	CG	3	6	1979389	1979394	0 %	0 %	50 %	50 %	345303574
43045	NC_015966	GCA	2	6	1979476	1979481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303574
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43054	NC_015966	CAG	2	6	1979786	1979791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303574
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43098	NC_015966	TCCG	2	8	1981492	1981499	0 %	25 %	25 %	50 %	345303576
43099	NC_015966	CCT	2	6	1981502	1981507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303576
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43102	NC_015966	CCGC	2	8	1981635	1981642	0 %	0 %	25 %	75 %	345303576
43103	NC_015966	GAT	2	6	1981647	1981652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303576
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43105	NC_015966	CGC	3	9	1981927	1981935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303576
43106	NC_015966	GCC	2	6	1981960	1981965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303576
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43108	NC_015966	TCT	2	6	1982033	1982038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303576
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43115	NC_015966	ATT	2	6	1984213	1984218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345303577
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43232	NC_015966	CGA	2	6	1991137	1991142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303583
43233	NC_015966	CGT	2	6	1991146	1991151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303583
43234	NC_015966	ACC	2	6	1991174	1991179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303583
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43236	NC_015966	CTG	2	6	1991318	1991323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303583
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43238	NC_015966	CGA	2	6	1991440	1991445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303583
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43245	NC_015966	GGC	2	6	1991680	1991685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303583
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43489	NC_015966	GC	3	6	2002144	2002149	0 %	0 %	50 %	50 %	345303591
43490	NC_015966	TGG	2	6	2002150	2002155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303591
43491	NC_015966	CTG	2	6	2002158	2002163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303591
43492	NC_015966	CGC	2	6	2002203	2002208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303591
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