MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015966	GAA	3	9	152117	152125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302026
3502	NC_015966	CGG	2	6	152173	152178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302027
3503	NC_015966	CGTCTG	2	12	152179	152190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302027
3504	NC_015966	GC	3	6	152283	152288	0 %	0 %	50 %	50 %	345302027
3505	NC_015966	ACG	2	6	152297	152302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302027
3506	NC_015966	GGC	2	6	152430	152435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302027
3507	NC_015966	GC	3	6	152444	152449	0 %	0 %	50 %	50 %	345302027
3508	NC_015966	GCT	2	6	152487	152492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302027
3509	NC_015966	GTG	2	6	152533	152538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302027
3510	NC_015966	GGCC	2	8	152567	152574	0 %	0 %	50 %	50 %	345302027
3511	NC_015966	GTG	2	6	152596	152601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302027
3512	NC_015966	CGGC	2	8	152603	152610	0 %	0 %	50 %	50 %	345302027
3513	NC_015966	GC	3	6	152636	152641	0 %	0 %	50 %	50 %	345302027
3514	NC_015966	CGG	2	6	152670	152675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302027
3515	NC_015966	CGG	2	6	152694	152699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302027
3516	NC_015966	CCA	2	6	152703	152708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302027
3517	NC_015966	GTGCGC	2	12	152719	152730	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302027
3518	NC_015966	GCGCGA	2	12	152793	152804	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345302027
3519	NC_015966	GCG	3	9	152811	152819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302027
3520	NC_015966	GGC	2	6	152844	152849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302028
3521	NC_015966	GGC	2	6	152895	152900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302028
3522	NC_015966	CGC	2	6	152901	152906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302028
3523	NC_015966	GCC	2	6	152956	152961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302028
3524	NC_015966	GCA	2	6	152966	152971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302028
3525	NC_015966	GGCGT	2	10	153079	153088	0 %	20 %	60 %	20 %	345302028
3526	NC_015966	GGCG	2	8	153098	153105	0 %	0 %	75 %	25 %	345302028
3527	NC_015966	GCC	2	6	153121	153126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302028
3528	NC_015966	GCC	2	6	153136	153141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302028
3529	NC_015966	CGG	2	6	153179	153184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302028
3530	NC_015966	GC	3	6	153210	153215	0 %	0 %	50 %	50 %	345302028
3531	NC_015966	GTCG	2	8	153232	153239	0 %	25 %	50 %	25 %	345302028
3532	NC_015966	CAC	2	6	153294	153299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302028
3533	NC_015966	CG	3	6	153402	153407	0 %	0 %	50 %	50 %	345302028
3534	NC_015966	CAG	2	6	153462	153467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302028
3535	NC_015966	ATGA	2	8	153618	153625	50 %	25 %	25 %	0 %	345302028
3536	NC_015966	GCG	2	6	153626	153631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302028
3537	NC_015966	CAG	2	6	153657	153662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302028
3538	NC_015966	GAAGCG	2	12	153716	153727	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	345302029
3539	NC_015966	CCG	2	6	153780	153785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302029
3540	NC_015966	AGC	3	9	153813	153821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302029
3541	NC_015966	GCC	2	6	153827	153832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302029
3542	NC_015966	TCA	2	6	153934	153939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302029
3543	NC_015966	TCG	2	6	153945	153950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302029
3544	NC_015966	GCC	2	6	154059	154064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302029
3545	NC_015966	GCC	3	9	154107	154115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302029
3546	NC_015966	GCG	3	9	154402	154410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302029
3547	NC_015966	CAG	2	6	154439	154444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302029
3548	NC_015966	CGT	2	6	154532	154537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302030
3549	NC_015966	GGC	2	6	154545	154550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302030
3550	NC_015966	CCG	2	6	154568	154573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302030
3551	NC_015966	CGA	2	6	154611	154616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302030
3552	NC_015966	GCC	2	6	154654	154659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302030
3553	NC_015966	ACC	2	6	154685	154690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302030
3554	NC_015966	GC	3	6	154873	154878	0 %	0 %	50 %	50 %	345302031
3555	NC_015966	GCC	2	6	154895	154900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302031
3556	NC_015966	CTG	2	6	154936	154941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302031
3557	NC_015966	TCG	2	6	155210	155215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302031
3558	NC_015966	GCA	2	6	155217	155222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302031
3559	NC_015966	AGCGCC	2	12	155279	155290	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345302031
3560	NC_015966	TGC	2	6	155378	155383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302031
3561	NC_015966	GCCA	2	8	155405	155412	25 %	0 %	25 %	50 %	345302031
3562	NC_015966	GCG	2	6	155457	155462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302031
3563	NC_015966	TCG	2	6	155489	155494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302031
3564	NC_015966	GACA	2	8	155594	155601	50 %	0 %	25 %	25 %	345302032
3565	NC_015966	CGG	2	6	155697	155702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302032
3566	NC_015966	CCG	2	6	155713	155718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302032
3567	NC_015966	CCGG	2	8	155754	155761	0 %	0 %	50 %	50 %	345302032
3568	NC_015966	CCG	2	6	155778	155783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302032
3569	NC_015966	GCTGGC	2	12	155820	155831	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302032
3570	NC_015966	GTG	2	6	155860	155865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302032
3571	NC_015966	ACG	2	6	155891	155896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302032
3572	NC_015966	GAC	2	6	155904	155909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302032
3573	NC_015966	GCC	2	6	155911	155916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302032
3574	NC_015966	GCC	2	6	155938	155943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302032
3575	NC_015966	GCC	2	6	155950	155955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302032
3576	NC_015966	TGC	2	6	155957	155962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302032
3577	NC_015966	G	6	6	156011	156016	0 %	0 %	100 %	0 %	345302032
3578	NC_015966	CGG	2	6	156021	156026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302032
3579	NC_015966	CGT	2	6	156027	156032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302032
3580	NC_015966	GGC	2	6	156033	156038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302032
3581	NC_015966	GC	3	6	156065	156070	0 %	0 %	50 %	50 %	345302032
3582	NC_015966	CGG	2	6	156074	156079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302032
3583	NC_015966	GAG	2	6	156133	156138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302032
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3585	NC_015966	CGG	2	6	156172	156177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302032
3586	NC_015966	CCCG	2	8	156188	156195	0 %	0 %	25 %	75 %	345302032
3587	NC_015966	GCG	2	6	156222	156227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302032
3588	NC_015966	GCC	2	6	156283	156288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302032
3589	NC_015966	GTC	2	6	156356	156361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302032
3590	NC_015966	GGA	2	6	156394	156399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302033
3591	NC_015966	ACC	2	6	156412	156417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302033
3592	NC_015966	ACC	2	6	156484	156489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302033
3593	NC_015966	GCC	2	6	156556	156561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302033
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3597	NC_015966	GAGC	2	8	156816	156823	25 %	0 %	50 %	25 %	345302033
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3600	NC_015966	CCA	2	6	156932	156937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302033
3601	NC_015966	TG	3	6	156946	156951	0 %	50 %	50 %	0 %	345302033
3602	NC_015966	CAG	2	6	156966	156971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302033
3603	NC_015966	GGGC	2	8	157084	157091	0 %	0 %	75 %	25 %	345302034
3604	NC_015966	CGG	2	6	157125	157130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302034
3605	NC_015966	GGC	2	6	157162	157167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302034
3606	NC_015966	CGC	2	6	157179	157184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302034
3607	NC_015966	CCA	2	6	157215	157220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302034
3608	NC_015966	CGTGC	2	10	157252	157261	0 %	20 %	40 %	40 %	345302034
3609	NC_015966	CG	3	6	157278	157283	0 %	0 %	50 %	50 %	345302034
3610	NC_015966	TGG	2	6	157305	157310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302034
3611	NC_015966	CG	3	6	157383	157388	0 %	0 %	50 %	50 %	345302034
3612	NC_015966	CAC	2	6	157402	157407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302034
3613	NC_015966	TTG	2	6	157472	157477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302034
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3615	NC_015966	CTG	2	6	157567	157572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302034
3616	NC_015966	CACG	2	8	157587	157594	25 %	0 %	25 %	50 %	345302034
3617	NC_015966	AGC	2	6	157682	157687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302034
3618	NC_015966	TGA	2	6	157752	157757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302034
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3621	NC_015966	GCAG	2	8	157970	157977	25 %	0 %	50 %	25 %	345302035
3622	NC_015966	GCGT	2	8	157980	157987	0 %	25 %	50 %	25 %	345302035
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3982	NC_015966	CTG	2	6	180522	180527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302050
3983	NC_015966	GAG	2	6	180546	180551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302050
3984	NC_015966	CGC	2	6	180604	180609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302050
3985	NC_015966	GCT	2	6	180704	180709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302050
3986	NC_015966	GCT	2	6	180725	180730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302050
3987	NC_015966	CGC	2	6	180785	180790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302050
3988	NC_015966	CGA	2	6	180791	180796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302050
3989	NC_015966	GATC	2	8	181031	181038	25 %	25 %	25 %	25 %	345302050
3990	NC_015966	GAA	2	6	181062	181067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302050
3991	NC_015966	CG	3	6	181095	181100	0 %	0 %	50 %	50 %	345302050
3992	NC_015966	CA	3	6	181130	181135	50 %	0 %	0 %	50 %	345302050
3993	NC_015966	TCG	2	6	181141	181146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302050
3994	NC_015966	ATG	2	6	181149	181154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302050
3995	NC_015966	GGC	2	6	181155	181160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302050
3996	NC_015966	CAC	2	6	181193	181198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302050
3997	NC_015966	GAACG	2	10	181229	181238	40 %	0 %	40 %	20 %	345302050
3998	NC_015966	CCA	2	6	181255	181260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302050
3999	NC_015966	CAA	2	6	181270	181275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302050
4000	NC_015966	CGA	2	6	181421	181426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302051

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