MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_015966	TCC	2	6	1648789	1648794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303304
36002	NC_015966	TCCAGT	2	12	1648822	1648833	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345303304
36003	NC_015966	TCG	2	6	1648834	1648839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303304
36004	NC_015966	GTA	2	6	1648887	1648892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303304
36005	NC_015966	CGCGC	2	10	1648907	1648916	0 %	0 %	40 %	60 %	345303304
36006	NC_015966	CGGC	2	8	1648961	1648968	0 %	0 %	50 %	50 %	345303304
36007	NC_015966	CGCACA	2	12	1648997	1649008	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	345303304
36008	NC_015966	GCA	2	6	1649024	1649029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303304
36009	NC_015966	GCC	2	6	1649077	1649082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303304
36010	NC_015966	GAT	2	6	1649093	1649098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303304
36011	NC_015966	CTT	2	6	1649111	1649116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303304
36012	NC_015966	CGCA	2	8	1649155	1649162	25 %	0 %	25 %	50 %	345303304
36013	NC_015966	ATA	2	6	1649191	1649196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345303304
36014	NC_015966	CTG	2	6	1649665	1649670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303305
36015	NC_015966	GCT	2	6	1649697	1649702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303305
36016	NC_015966	CGG	2	6	1649714	1649719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303305
36017	NC_015966	GAC	2	6	1649785	1649790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303305
36018	NC_015966	CAC	2	6	1649791	1649796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303305
36019	NC_015966	CCG	2	6	1649843	1649848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303305
36020	NC_015966	CTG	2	6	1649938	1649943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303305
36021	NC_015966	TGA	2	6	1649946	1649951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303305
36022	NC_015966	TCG	2	6	1649954	1649959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303305
36023	NC_015966	GGT	2	6	1649977	1649982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303305
36024	NC_015966	CG	3	6	1649993	1649998	0 %	0 %	50 %	50 %	345303305
36025	NC_015966	AGC	2	6	1650014	1650019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303305
36026	NC_015966	CGATC	2	10	1650028	1650037	20 %	20 %	20 %	40 %	345303305
36027	NC_015966	GCCGG	2	10	1650082	1650091	0 %	0 %	60 %	40 %	345303305
36028	NC_015966	TTG	2	6	1650185	1650190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303305
36029	NC_015966	TCC	2	6	1650242	1650247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303305
36030	NC_015966	GACC	2	8	1650300	1650307	25 %	0 %	25 %	50 %	345303305
36031	NC_015966	CAG	2	6	1650358	1650363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303305
36032	NC_015966	ACA	2	6	1650402	1650407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303305
36033	NC_015966	AGC	3	9	1650419	1650427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303305
36034	NC_015966	ATCC	2	8	1650507	1650514	25 %	25 %	0 %	50 %	345303306
36035	NC_015966	TGCG	2	8	1650529	1650536	0 %	25 %	50 %	25 %	345303306
36036	NC_015966	GC	3	6	1650543	1650548	0 %	0 %	50 %	50 %	345303306
36037	NC_015966	GCG	2	6	1650564	1650569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303306
36038	NC_015966	GCC	2	6	1650570	1650575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303306
36039	NC_015966	CTG	2	6	1650576	1650581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303306
36040	NC_015966	CCG	2	6	1650607	1650612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303306
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36050	NC_015966	GCT	2	6	1650911	1650916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303306
36051	NC_015966	ACG	2	6	1650967	1650972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303306
36052	NC_015966	GCT	2	6	1650974	1650979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303306
36053	NC_015966	GAC	2	6	1651001	1651006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303306
36054	NC_015966	AGC	2	6	1651030	1651035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303306
36055	NC_015966	GC	3	6	1651037	1651042	0 %	0 %	50 %	50 %	345303306
36056	NC_015966	GCGG	2	8	1651180	1651187	0 %	0 %	75 %	25 %	345303306
36057	NC_015966	ACC	2	6	1651245	1651250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303306
36058	NC_015966	GGCC	2	8	1651301	1651308	0 %	0 %	50 %	50 %	345303306
36059	NC_015966	GATC	2	8	1651328	1651335	25 %	25 %	25 %	25 %	345303306
36060	NC_015966	CGA	2	6	1651484	1651489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303306
36061	NC_015966	CGA	2	6	1651556	1651561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303306
36062	NC_015966	CTG	2	6	1651584	1651589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303306
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36066	NC_015966	TAC	2	6	1652081	1652086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303307
36067	NC_015966	GTCG	2	8	1652179	1652186	0 %	25 %	50 %	25 %	345303307
36068	NC_015966	GTC	2	6	1652240	1652245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303307
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36100	NC_015966	CGC	2	6	1653754	1653759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303309
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36107	NC_015966	CGA	2	6	1654018	1654023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303310
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36111	NC_015966	GC	4	8	1654252	1654259	0 %	0 %	50 %	50 %	345303310
36112	NC_015966	TTCC	2	8	1654358	1654365	0 %	50 %	0 %	50 %	345303310
36113	NC_015966	CAGCGC	2	12	1654424	1654435	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345303310
36114	NC_015966	GCT	2	6	1654504	1654509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303310
36115	NC_015966	GCG	2	6	1654561	1654566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303310
36116	NC_015966	GCC	2	6	1654588	1654593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303310
36117	NC_015966	GCG	2	6	1654604	1654609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303310
36118	NC_015966	GACG	3	12	1654709	1654720	25 %	0 %	50 %	25 %	345303310
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36120	NC_015966	CT	3	6	1654808	1654813	0 %	50 %	0 %	50 %	345303310
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36122	NC_015966	CG	3	6	1654901	1654906	0 %	0 %	50 %	50 %	345303310
36123	NC_015966	GCT	2	6	1654912	1654917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303310
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36134	NC_015966	GTA	2	6	1655361	1655366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303311
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36144	NC_015966	CGT	2	6	1655828	1655833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303311
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36215	NC_015966	ACG	2	6	1658857	1658862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303314
36216	NC_015966	CGG	2	6	1659020	1659025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303314
36217	NC_015966	TGA	2	6	1659070	1659075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303314
36218	NC_015966	CTGG	2	8	1659077	1659084	0 %	25 %	50 %	25 %	345303314
36219	NC_015966	ACA	2	6	1659088	1659093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303314
36220	NC_015966	ATG	2	6	1659129	1659134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303314
36221	NC_015966	TGC	2	6	1659169	1659174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303314
36222	NC_015966	GCT	2	6	1659179	1659184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303314
36223	NC_015966	CAC	2	6	1659195	1659200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303314
36224	NC_015966	GAC	2	6	1659213	1659218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303314
36225	NC_015966	ACG	2	6	1659235	1659240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303314
36226	NC_015966	CAG	2	6	1659285	1659290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303314
36227	NC_015966	CTT	2	6	1659365	1659370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303314
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36229	NC_015966	ACG	2	6	1659403	1659408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303314
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36332	NC_015966	CA	3	6	1664460	1664465	50 %	0 %	0 %	50 %	345303320
36333	NC_015966	CCTGTT	2	12	1664499	1664510	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	345303320
36334	NC_015966	GGGCGC	2	12	1664565	1664576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303320
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36336	NC_015966	CAT	2	6	1664697	1664702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303320
36337	NC_015966	CCTG	2	8	1664763	1664770	0 %	25 %	25 %	50 %	345303320
36338	NC_015966	TTC	2	6	1664785	1664790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303320
36339	NC_015966	CG	4	8	1664860	1664867	0 %	0 %	50 %	50 %	345303320
36340	NC_015966	CAC	2	6	1664872	1664877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303320
36341	NC_015966	T	6	6	1664917	1664922	0 %	100 %	0 %	0 %	345303320
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36343	NC_015966	CGC	3	9	1665016	1665024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303320
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36458	NC_015966	TGA	2	6	1669820	1669825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303323
36459	NC_015966	GTC	2	6	1669842	1669847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303323
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