MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_015966	CGGGAG	2	12	1600466	1600477	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	345303259
35002	NC_015966	GCC	2	6	1600503	1600508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303259
35003	NC_015966	AAC	2	6	1600517	1600522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345303259
35004	NC_015966	TCG	2	6	1600563	1600568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303259
35005	NC_015966	TGG	2	6	1600653	1600658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303259
35006	NC_015966	GAG	2	6	1600685	1600690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303259
35007	NC_015966	GAA	2	6	1600720	1600725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303259
35008	NC_015966	CGA	2	6	1600747	1600752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303259
35009	NC_015966	TCG	2	6	1600764	1600769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303259
35010	NC_015966	G	6	6	1600774	1600779	0 %	0 %	100 %	0 %	345303259
35011	NC_015966	GCTC	2	8	1600788	1600795	0 %	25 %	25 %	50 %	345303259
35012	NC_015966	GTG	2	6	1600830	1600835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303259
35013	NC_015966	ACG	2	6	1600856	1600861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303259
35014	NC_015966	GC	3	6	1600896	1600901	0 %	0 %	50 %	50 %	345303259
35015	NC_015966	CGC	2	6	1600907	1600912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303259
35016	NC_015966	ATC	2	6	1600922	1600927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303259
35017	NC_015966	GGA	2	6	1600945	1600950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303259
35018	NC_015966	GAA	2	6	1600966	1600971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303259
35019	NC_015966	CAC	2	6	1600994	1600999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345303259
35020	NC_015966	TCC	2	6	1601070	1601075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303259
35021	NC_015966	GAA	2	6	1601125	1601130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303259
35022	NC_015966	TCG	2	6	1601151	1601156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303259
35023	NC_015966	GGA	2	6	1601161	1601166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303259
35024	NC_015966	GGA	2	6	1601185	1601190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303259
35025	NC_015966	GGT	2	6	1601200	1601205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345303259
35026	NC_015966	GAG	2	6	1601222	1601227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303259
35027	NC_015966	GAA	2	6	1601251	1601256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303259
35028	NC_015966	GCT	2	6	1601257	1601262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303259
35029	NC_015966	GCA	2	6	1601305	1601310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303259
35030	NC_015966	ATG	2	6	1601357	1601362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303259
35031	NC_015966	CCGAGC	2	12	1601388	1601399	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345303259
35032	NC_015966	AGA	2	6	1601400	1601405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345303259
35033	NC_015966	CTC	2	6	1601408	1601413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303259
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35035	NC_015966	GGCC	2	8	1601497	1601504	0 %	0 %	50 %	50 %	345303259
35036	NC_015966	GACC	2	8	1601547	1601554	25 %	0 %	25 %	50 %	345303259
35037	NC_015966	GCC	2	6	1601664	1601669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303259
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35039	NC_015966	GAG	2	6	1601702	1601707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345303259
35040	NC_015966	GCG	2	6	1601731	1601736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303259
35041	NC_015966	CGT	2	6	1601749	1601754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303259
35042	NC_015966	GCT	2	6	1601755	1601760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303259
35043	NC_015966	CGA	2	6	1601761	1601766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303259
35044	NC_015966	CGA	2	6	1601815	1601820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303259
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35048	NC_015966	CGA	2	6	1602031	1602036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303259
35049	NC_015966	AGC	2	6	1602063	1602068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303259
35050	NC_015966	ATC	2	6	1602080	1602085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303259
35051	NC_015966	TGA	2	6	1602090	1602095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345303259
35052	NC_015966	GCGG	2	8	1602112	1602119	0 %	0 %	75 %	25 %	345303259
35053	NC_015966	GGC	2	6	1602151	1602156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303259
35054	NC_015966	TCG	2	6	1602168	1602173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303259
35055	NC_015966	CGG	2	6	1602212	1602217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303259
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35058	NC_015966	TCG	2	6	1602288	1602293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303259
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35061	NC_015966	GCC	2	6	1602350	1602355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303259
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35065	NC_015966	CTGCG	2	10	1602509	1602518	0 %	20 %	40 %	40 %	345303260
35066	NC_015966	GCA	2	6	1602544	1602549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303260
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35068	NC_015966	GC	3	6	1602632	1602637	0 %	0 %	50 %	50 %	345303260
35069	NC_015966	TCG	2	6	1602666	1602671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303260
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35075	NC_015966	CTG	2	6	1602959	1602964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303260
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35083	NC_015966	CT	3	6	1604166	1604171	0 %	50 %	0 %	50 %	345303261
35084	NC_015966	GCC	2	6	1604214	1604219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345303261
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35086	NC_015966	CCGT	2	8	1604335	1604342	0 %	25 %	25 %	50 %	345303261
35087	NC_015966	AGC	2	6	1604354	1604359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303261
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35089	NC_015966	CAGTA	2	10	1604390	1604399	40 %	20 %	20 %	20 %	345303261
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35094	NC_015966	ACGGC	2	10	1604686	1604695	20 %	0 %	40 %	40 %	345303261
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35098	NC_015966	CAG	2	6	1604823	1604828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303261
35099	NC_015966	CGCAG	2	10	1604941	1604950	20 %	0 %	40 %	40 %	345303261
35100	NC_015966	TGAT	2	8	1605031	1605038	25 %	50 %	25 %	0 %	345303261
35101	NC_015966	TGTC	2	8	1605113	1605120	0 %	50 %	25 %	25 %	345303261
35102	NC_015966	AGC	2	6	1605258	1605263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303261
35103	NC_015966	CCAC	2	8	1606220	1606227	25 %	0 %	0 %	75 %	345303262
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35105	NC_015966	CG	3	6	1606320	1606325	0 %	0 %	50 %	50 %	345303262
35106	NC_015966	CGAT	2	8	1606364	1606371	25 %	25 %	25 %	25 %	345303262
35107	NC_015966	TCG	2	6	1606482	1606487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303262
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35110	NC_015966	GCG	2	6	1606644	1606649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345303262
35111	NC_015966	TGCCC	2	10	1606650	1606659	0 %	20 %	20 %	60 %	345303262
35112	NC_015966	TTC	2	6	1606944	1606949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303263
35113	NC_015966	CAG	2	6	1606998	1607003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303263
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35115	NC_015966	CTT	2	6	1607064	1607069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345303263
35116	NC_015966	CTC	2	6	1607097	1607102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345303263
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35223	NC_015966	CTG	2	6	1611606	1611611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303265
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35227	NC_015966	CGT	2	6	1611890	1611895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345303265
35228	NC_015966	CAG	2	6	1611972	1611977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303265
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35462	NC_015966	GAC	2	6	1623244	1623249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303277
35463	NC_015966	TTG	2	6	1623305	1623310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345303277
35464	NC_015966	CAG	2	6	1623331	1623336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345303277
35465	NC_015966	TCA	2	6	1623480	1623485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345303277
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35481	NC_015966	ATCC	2	8	1625393	1625400	25 %	25 %	0 %	50 %	345303280
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