MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015966	GCG	2	6	111707	111712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301988
2502	NC_015966	GTC	2	6	111716	111721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301988
2503	NC_015966	GGT	2	6	111733	111738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301988
2504	NC_015966	GCTTCG	2	12	111771	111782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301989
2505	NC_015966	GGC	2	6	111788	111793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301989
2506	NC_015966	GCC	2	6	111798	111803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301989
2507	NC_015966	GGC	2	6	111861	111866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301989
2508	NC_015966	CGG	2	6	111872	111877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301989
2509	NC_015966	CGC	2	6	111898	111903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301989
2510	NC_015966	CAG	2	6	111911	111916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301989
2511	NC_015966	CGC	2	6	111932	111937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301989
2512	NC_015966	CACC	2	8	111946	111953	25 %	0 %	0 %	75 %	345301989
2513	NC_015966	GGT	2	6	111975	111980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301989
2514	NC_015966	CGC	2	6	112056	112061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301989
2515	NC_015966	GC	3	6	112060	112065	0 %	0 %	50 %	50 %	345301989
2516	NC_015966	GACG	2	8	112084	112091	25 %	0 %	50 %	25 %	345301989
2517	NC_015966	CGG	2	6	112105	112110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301989
2518	NC_015966	GGCGCG	2	12	112145	112156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301989
2519	NC_015966	GCA	2	6	112159	112164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301989
2520	NC_015966	CGA	2	6	112171	112176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301989
2521	NC_015966	GCG	2	6	112194	112199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301989
2522	NC_015966	GAT	2	6	112267	112272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301989
2523	NC_015966	CGT	2	6	112318	112323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301989
2524	NC_015966	ACG	2	6	112326	112331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301989
2525	NC_015966	CGT	2	6	112339	112344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301989
2526	NC_015966	GCGG	2	8	112346	112353	0 %	0 %	75 %	25 %	345301989
2527	NC_015966	GCG	2	6	112375	112380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301989
2528	NC_015966	CGTC	2	8	112408	112415	0 %	25 %	25 %	50 %	345301989
2529	NC_015966	GCG	2	6	112424	112429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301989
2530	NC_015966	GCC	2	6	112430	112435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301989
2531	NC_015966	GTA	2	6	112493	112498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301989
2532	NC_015966	CGT	2	6	112528	112533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301989
2533	NC_015966	CG	3	6	112573	112578	0 %	0 %	50 %	50 %	345301989
2534	NC_015966	GGC	2	6	112637	112642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301989
2535	NC_015966	GCC	2	6	112668	112673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301989
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2537	NC_015966	GGC	2	6	112715	112720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301989
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2539	NC_015966	CAG	2	6	112817	112822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301989
2540	NC_015966	GCG	2	6	112823	112828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301989
2541	NC_015966	CGG	2	6	112852	112857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301989
2542	NC_015966	GCG	2	6	112874	112879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301989
2543	NC_015966	GGGC	2	8	112930	112937	0 %	0 %	75 %	25 %	345301990
2544	NC_015966	ATC	2	6	112975	112980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301990
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2550	NC_015966	GGTTGT	2	12	113426	113437	0 %	50 %	50 %	0 %	345301990
2551	NC_015966	GC	3	6	113466	113471	0 %	0 %	50 %	50 %	345301990
2552	NC_015966	GCG	2	6	113532	113537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301990
2553	NC_015966	GCCG	2	8	113613	113620	0 %	0 %	50 %	50 %	345301990
2554	NC_015966	GC	4	8	113631	113638	0 %	0 %	50 %	50 %	345301990
2555	NC_015966	TCG	2	6	113650	113655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301990
2556	NC_015966	AGT	2	6	113711	113716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301990
2557	NC_015966	AGC	2	6	113752	113757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301990
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2559	NC_015966	GCC	2	6	113806	113811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301990
2560	NC_015966	TCG	2	6	113833	113838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301990
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2562	NC_015966	GGC	2	6	113875	113880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301990
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2566	NC_015966	CGG	2	6	114002	114007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301991
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2568	NC_015966	CCGG	2	8	114077	114084	0 %	0 %	50 %	50 %	345301991
2569	NC_015966	GGC	2	6	114102	114107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301991
2570	NC_015966	GCG	2	6	114124	114129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301991
2571	NC_015966	CAG	2	6	114190	114195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301991
2572	NC_015966	CAG	2	6	114202	114207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301991
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2579	NC_015966	CAG	2	6	114373	114378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301991
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2581	NC_015966	GCCG	2	8	114430	114437	0 %	0 %	50 %	50 %	345301991
2582	NC_015966	GCA	2	6	114450	114455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301991
2583	NC_015966	GCA	3	9	114480	114488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301991
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2585	NC_015966	CGG	2	6	114527	114532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301991
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2591	NC_015966	TCG	2	6	114630	114635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301991
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2599	NC_015966	CTG	2	6	115021	115026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301992
2600	NC_015966	CTGGT	2	10	115090	115099	0 %	40 %	40 %	20 %	345301992
2601	NC_015966	CGA	2	6	115101	115106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301992
2602	NC_015966	TAC	2	6	115189	115194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301992
2603	NC_015966	TCA	2	6	115238	115243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301992
2604	NC_015966	CG	3	6	115301	115306	0 %	0 %	50 %	50 %	345301992
2605	NC_015966	CGT	2	6	115313	115318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301992
2606	NC_015966	GGCC	2	8	115373	115380	0 %	0 %	50 %	50 %	345301992
2607	NC_015966	CAT	2	6	115446	115451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301992
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2609	NC_015966	CA	3	6	115495	115500	50 %	0 %	0 %	50 %	345301992
2610	NC_015966	ACC	2	6	115511	115516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301992
2611	NC_015966	CCGC	2	8	115556	115563	0 %	0 %	25 %	75 %	345301992
2612	NC_015966	GAG	2	6	115600	115605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301992
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2619	NC_015966	CGG	2	6	116577	116582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301993
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2621	NC_015966	GGC	2	6	116642	116647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301993
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2623	NC_015966	G	6	6	116781	116786	0 %	0 %	100 %	0 %	345301993
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2742	NC_015966	GGA	2	6	122418	122423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302000
2743	NC_015966	GGC	2	6	122446	122451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302000
2744	NC_015966	GAA	2	6	122515	122520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302000
2745	NC_015966	GTG	2	6	122521	122526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302000
2746	NC_015966	TCT	2	6	122558	122563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302000
2747	NC_015966	TGC	2	6	122573	122578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302000
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2750	NC_015966	ACT	2	6	122708	122713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302000
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2844	NC_015966	G	8	8	126084	126091	0 %	0 %	100 %	0 %	345302003
2845	NC_015966	GTG	2	6	126094	126099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302003
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2850	NC_015966	CGTA	2	8	126234	126241	25 %	25 %	25 %	25 %	345302003
2851	NC_015966	GCC	2	6	126316	126321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302003
2852	NC_015966	GCCC	2	8	126437	126444	0 %	0 %	25 %	75 %	345302004
2853	NC_015966	CAG	2	6	126457	126462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302004
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2855	NC_015966	GAT	2	6	126517	126522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302004
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2857	NC_015966	GC	3	6	126561	126566	0 %	0 %	50 %	50 %	345302004
2858	NC_015966	GGC	2	6	126752	126757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302005
2859	NC_015966	GCG	2	6	126789	126794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302005
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2982	NC_015966	GTC	2	6	131031	131036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302009
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