MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_015966	CTC	2	6	859470	859475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302631
19002	NC_015966	GGC	2	6	859520	859525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302631
19003	NC_015966	TGC	2	6	859564	859569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302631
19004	NC_015966	TGG	2	6	859570	859575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302631
19005	NC_015966	TGC	2	6	859597	859602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302631
19006	NC_015966	CGC	2	6	859621	859626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302631
19007	NC_015966	CTG	2	6	859629	859634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302631
19008	NC_015966	TGC	2	6	859687	859692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302631
19009	NC_015966	CG	3	6	859695	859700	0 %	0 %	50 %	50 %	345302631
19010	NC_015966	GC	3	6	859735	859740	0 %	0 %	50 %	50 %	345302631
19011	NC_015966	GCT	2	6	859844	859849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302631
19012	NC_015966	ACA	2	6	860008	860013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302631
19013	NC_015966	CGGC	2	8	860100	860107	0 %	0 %	50 %	50 %	345302631
19014	NC_015966	CTG	2	6	860142	860147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302631
19015	NC_015966	GCG	2	6	860159	860164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302631
19016	NC_015966	GTG	2	6	860184	860189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302631
19017	NC_015966	CGG	2	6	860198	860203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302631
19018	NC_015966	CGGC	2	8	860206	860213	0 %	0 %	50 %	50 %	345302631
19019	NC_015966	GGA	2	6	860225	860230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302631
19020	NC_015966	ACG	2	6	860269	860274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302631
19021	NC_015966	AGC	2	6	860296	860301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302631
19022	NC_015966	CGA	2	6	860303	860308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302631
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19024	NC_015966	GCT	2	6	860357	860362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302631
19025	NC_015966	CGG	2	6	860405	860410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302631
19026	NC_015966	CGA	2	6	860450	860455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302631
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19028	NC_015966	GCT	2	6	860581	860586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302632
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19030	NC_015966	GTT	2	6	860604	860609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302632
19031	NC_015966	GCA	2	6	860722	860727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302632
19032	NC_015966	TTTTC	2	10	860735	860744	0 %	80 %	0 %	20 %	345302632
19033	NC_015966	CAG	2	6	860755	860760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302632
19034	NC_015966	GGC	2	6	860815	860820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302632
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19036	NC_015966	TGG	2	6	860904	860909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302632
19037	NC_015966	CTA	2	6	861066	861071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302633
19038	NC_015966	ACG	2	6	861131	861136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302633
19039	NC_015966	CGA	2	6	861198	861203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302633
19040	NC_015966	GCT	2	6	861225	861230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302633
19041	NC_015966	GCGG	2	8	861234	861241	0 %	0 %	75 %	25 %	345302633
19042	NC_015966	CGA	2	6	861263	861268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302633
19043	NC_015966	CCA	2	6	861278	861283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302633
19044	NC_015966	TCG	2	6	861305	861310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302633
19045	NC_015966	CAC	2	6	861411	861416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302633
19046	NC_015966	GCC	3	9	861455	861463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302633
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19048	NC_015966	GCT	2	6	861519	861524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302633
19049	NC_015966	GCCGC	2	10	861753	861762	0 %	0 %	40 %	60 %	345302633
19050	NC_015966	GCCCG	2	10	861802	861811	0 %	0 %	40 %	60 %	345302633
19051	NC_015966	GCG	2	6	861846	861851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302633
19052	NC_015966	AGC	2	6	861863	861868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302633
19053	NC_015966	GGTC	2	8	861894	861901	0 %	25 %	50 %	25 %	345302633
19054	NC_015966	GAC	2	6	861904	861909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302633
19055	NC_015966	GCC	2	6	861912	861917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302633
19056	NC_015966	CTC	2	6	861939	861944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302633
19057	NC_015966	ACC	2	6	861967	861972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302633
19058	NC_015966	TGC	2	6	862112	862117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302633
19059	NC_015966	ATCGT	2	10	862121	862130	20 %	40 %	20 %	20 %	345302633
19060	NC_015966	GGT	3	9	862131	862139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302633
19061	NC_015966	GC	3	6	862204	862209	0 %	0 %	50 %	50 %	345302633
19062	NC_015966	TCGCC	2	10	862226	862235	0 %	20 %	20 %	60 %	345302633
19063	NC_015966	GAG	2	6	862282	862287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302633
19064	NC_015966	CTG	2	6	862288	862293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302633
19065	NC_015966	CAA	2	6	862296	862301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302633
19066	NC_015966	TGA	2	6	862373	862378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302633
19067	NC_015966	ACT	2	6	862412	862417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302633
19068	NC_015966	AGG	2	6	862472	862477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302633
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19070	NC_015966	CGC	2	6	862516	862521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302634
19071	NC_015966	CGCC	2	8	862531	862538	0 %	0 %	25 %	75 %	345302634
19072	NC_015966	ACC	2	6	862590	862595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302634
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19075	NC_015966	TGG	3	9	862722	862730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302634
19076	NC_015966	CTG	2	6	862751	862756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302634
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19078	NC_015966	TCG	2	6	862813	862818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302634
19079	NC_015966	CGA	2	6	862867	862872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302634
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19083	NC_015966	GTC	2	6	862976	862981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302634
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19085	NC_015966	CGAG	2	8	863023	863030	25 %	0 %	50 %	25 %	345302634
19086	NC_015966	GTG	2	6	863049	863054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302634
19087	NC_015966	TCG	3	9	863076	863084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302634
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19089	NC_015966	CGTG	2	8	863134	863141	0 %	25 %	50 %	25 %	345302634
19090	NC_015966	GCTG	2	8	863146	863153	0 %	25 %	50 %	25 %	345302634
19091	NC_015966	TGG	2	6	863308	863313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302634
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19099	NC_015966	GCGG	2	8	863699	863706	0 %	0 %	75 %	25 %	345302634
19100	NC_015966	GGCC	2	8	863809	863816	0 %	0 %	50 %	50 %	345302634
19101	NC_015966	CTG	2	6	863849	863854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302634
19102	NC_015966	GCC	2	6	863907	863912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302634
19103	NC_015966	TGG	2	6	863941	863946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302634
19104	NC_015966	GCGAA	2	10	863958	863967	40 %	0 %	40 %	20 %	345302634
19105	NC_015966	GCC	3	9	863978	863986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302634
19106	NC_015966	CAC	2	6	864011	864016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302634
19107	NC_015966	CCG	2	6	864060	864065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302634
19108	NC_015966	ACC	2	6	864114	864119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302634
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19115	NC_015966	GGC	2	6	864817	864822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302636
19116	NC_015966	CGCCT	2	10	864862	864871	0 %	20 %	20 %	60 %	345302636
19117	NC_015966	GCCG	2	8	864892	864899	0 %	0 %	50 %	50 %	345302636
19118	NC_015966	GCA	2	6	864903	864908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302636
19119	NC_015966	GACC	2	8	864972	864979	25 %	0 %	25 %	50 %	345302636
19120	NC_015966	CGC	2	6	865035	865040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302636
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19122	NC_015966	GCA	2	6	865149	865154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302636
19123	NC_015966	CGC	2	6	865368	865373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302636
19124	NC_015966	GGC	2	6	865417	865422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302636
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19128	NC_015966	GGGA	2	8	865672	865679	25 %	0 %	75 %	0 %	345302636
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19232	NC_015966	GC	4	8	870605	870612	0 %	0 %	50 %	50 %	345302640
19233	NC_015966	CGC	2	6	870657	870662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302640
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19238	NC_015966	CAGGCG	2	12	870914	870925	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345302640
19239	NC_015966	CGTGC	2	10	870989	870998	0 %	20 %	40 %	40 %	345302640
19240	NC_015966	GGT	2	6	871000	871005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302640
19241	NC_015966	GGA	2	6	871024	871029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302640
19242	NC_015966	AGA	2	6	871081	871086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302640
19243	NC_015966	CG	3	6	871096	871101	0 %	0 %	50 %	50 %	345302640
19244	NC_015966	GGA	2	6	871195	871200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302640
19245	NC_015966	GCG	2	6	871229	871234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302640
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19251	NC_015966	CCG	2	6	871532	871537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302641
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19342	NC_015966	CTG	2	6	875360	875365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302645
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19350	NC_015966	CGATC	2	10	875596	875605	20 %	20 %	20 %	40 %	345302645
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19355	NC_015966	TGC	2	6	875973	875978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302646
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19482	NC_015966	GT	4	8	882071	882078	0 %	50 %	50 %	0 %	345302650
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