MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

< Previous12...3334353637383940414243...140141Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_015966	CG	3	6	837727	837732	0 %	0 %	50 %	50 %	345302612
18503	NC_015966	GCG	3	9	837730	837738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302612
18504	NC_015966	TCG	2	6	837741	837746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302612
18505	NC_015966	GAA	2	6	837825	837830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302612
18506	NC_015966	AGC	2	6	837865	837870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302612
18507	NC_015966	TGG	2	6	837901	837906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302612
18508	NC_015966	GGA	2	6	837924	837929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302612
18509	NC_015966	GGC	2	6	837942	837947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302612
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18511	NC_015966	GCT	2	6	838025	838030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302612
18512	NC_015966	CGC	2	6	838092	838097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302612
18513	NC_015966	GCC	2	6	838111	838116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302612
18514	NC_015966	CTG	2	6	838137	838142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302612
18515	NC_015966	CAT	2	6	838157	838162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302612
18516	NC_015966	CTG	2	6	838218	838223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302612
18517	NC_015966	CGT	2	6	838280	838285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302612
18518	NC_015966	CG	3	6	838354	838359	0 %	0 %	50 %	50 %	345302612
18519	NC_015966	CGC	2	6	838465	838470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302612
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18525	NC_015966	GCT	2	6	838772	838777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302612
18526	NC_015966	TCT	2	6	838801	838806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302612
18527	NC_015966	CGG	2	6	838819	838824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302612
18528	NC_015966	CTGC	2	8	838826	838833	0 %	25 %	25 %	50 %	345302612
18529	NC_015966	TCA	2	6	838846	838851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302612
18530	NC_015966	A	6	6	838876	838881	100 %	0 %	0 %	0 %	345302612
18531	NC_015966	CGG	2	6	838925	838930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302612
18532	NC_015966	GC	3	6	838969	838974	0 %	0 %	50 %	50 %	345302612
18533	NC_015966	TCG	2	6	839015	839020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302612
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18539	NC_015966	ACG	2	6	839268	839273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302612
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18541	NC_015966	TGCGC	2	10	839288	839297	0 %	20 %	40 %	40 %	345302612
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18543	NC_015966	TGGC	2	8	839436	839443	0 %	25 %	50 %	25 %	345302612
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18546	NC_015966	CGG	2	6	839610	839615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302612
18547	NC_015966	CA	3	6	839645	839650	50 %	0 %	0 %	50 %	345302612
18548	NC_015966	GCAG	2	8	839659	839666	25 %	0 %	50 %	25 %	345302612
18549	NC_015966	CGT	2	6	839690	839695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302612
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18554	NC_015966	GGT	3	9	839780	839788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302612
18555	NC_015966	CTG	2	6	839804	839809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302612
18556	NC_015966	CGGC	2	8	839810	839817	0 %	0 %	50 %	50 %	345302612
18557	NC_015966	GCA	3	9	839849	839857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302612
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18598	NC_015966	CCAGG	2	10	841508	841517	20 %	0 %	40 %	40 %	345302613
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18616	NC_015966	CGG	2	6	842262	842267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302614
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18976	NC_015966	G	7	7	858154	858160	0 %	0 %	100 %	0 %	345302630
18977	NC_015966	GCT	2	6	858201	858206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302630
18978	NC_015966	GATTG	2	10	858207	858216	20 %	40 %	40 %	0 %	345302630
18979	NC_015966	GGC	2	6	858321	858326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302630
18980	NC_015966	GTG	3	9	858409	858417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302630
18981	NC_015966	TGC	2	6	858539	858544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302630
18982	NC_015966	CTG	2	6	858601	858606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302630
18983	NC_015966	GCT	2	6	858636	858641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302630
18984	NC_015966	GGT	3	9	858645	858653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302630
18985	NC_015966	CGGT	2	8	858691	858698	0 %	25 %	50 %	25 %	345302630
18986	NC_015966	GTG	2	6	858703	858708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302630
18987	NC_015966	GTT	2	6	858786	858791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302630
18988	NC_015966	CAT	2	6	858831	858836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302630
18989	NC_015966	CTGGCG	2	12	858856	858867	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302630
18990	NC_015966	GC	3	6	858872	858877	0 %	0 %	50 %	50 %	345302630
18991	NC_015966	GTGGG	2	10	858895	858904	0 %	20 %	80 %	0 %	345302630
18992	NC_015966	GGC	2	6	858921	858926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302630
18993	NC_015966	GGT	2	6	859005	859010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302630
18994	NC_015966	TCA	2	6	859016	859021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302630
18995	NC_015966	TTG	2	6	859320	859325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302631
18996	NC_015966	GCT	2	6	859334	859339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302631
18997	NC_015966	GCG	2	6	859353	859358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302631
18998	NC_015966	CTG	2	6	859359	859364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302631
18999	NC_015966	GCC	2	6	859386	859391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302631
19000	NC_015966	GCT	2	6	859430	859435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302631

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