MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_015966	GCC	2	6	812968	812973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302589
18002	NC_015966	GGC	2	6	813014	813019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302589
18003	NC_015966	TCC	2	6	813038	813043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302589
18004	NC_015966	CCT	2	6	813141	813146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302589
18005	NC_015966	CGT	2	6	813169	813174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302589
18006	NC_015966	TTC	2	6	813199	813204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302589
18007	NC_015966	GCC	2	6	813226	813231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302589
18008	NC_015966	CTT	2	6	813280	813285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302589
18009	NC_015966	GTA	2	6	813292	813297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302589
18010	NC_015966	TCG	2	6	813350	813355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302589
18011	NC_015966	CGG	2	6	813376	813381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302589
18012	NC_015966	GCCA	2	8	813404	813411	25 %	0 %	25 %	50 %	345302589
18013	NC_015966	TCA	2	6	813420	813425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302589
18014	NC_015966	GCCG	2	8	813430	813437	0 %	0 %	50 %	50 %	345302589
18015	NC_015966	TCC	2	6	813482	813487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302589
18016	NC_015966	GAA	2	6	813490	813495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302589
18017	NC_015966	T	6	6	813553	813558	0 %	100 %	0 %	0 %	345302589
18018	NC_015966	CAT	2	6	813668	813673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302590
18019	NC_015966	GAT	2	6	813749	813754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302590
18020	NC_015966	GGGC	2	8	813812	813819	0 %	0 %	75 %	25 %	345302590
18021	NC_015966	GTA	2	6	813869	813874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302590
18022	NC_015966	CCT	3	9	813877	813885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302590
18023	NC_015966	GAT	2	6	813956	813961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302590
18024	NC_015966	TCC	2	6	813981	813986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302590
18025	NC_015966	TCG	2	6	814050	814055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302590
18026	NC_015966	GCG	2	6	814076	814081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302590
18027	NC_015966	CGC	2	6	814096	814101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302590
18028	NC_015966	CTT	2	6	814141	814146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302590
18029	NC_015966	CGG	2	6	814147	814152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302590
18030	NC_015966	TTG	2	6	814191	814196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302590
18031	NC_015966	TGA	2	6	814201	814206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302590
18032	NC_015966	TTC	2	6	814226	814231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302590
18033	NC_015966	TTC	2	6	814238	814243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302590
18034	NC_015966	GCG	2	6	814250	814255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302590
18035	NC_015966	CGC	2	6	814294	814299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302590
18036	NC_015966	TCG	2	6	814341	814346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302590
18037	NC_015966	CCAG	2	8	814426	814433	25 %	0 %	25 %	50 %	345302590
18038	NC_015966	GTT	2	6	814544	814549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302590
18039	NC_015966	CGGT	2	8	814575	814582	0 %	25 %	50 %	25 %	345302590
18040	NC_015966	GT	3	6	814712	814717	0 %	50 %	50 %	0 %	345302590
18041	NC_015966	ATC	2	6	814746	814751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302590
18042	NC_015966	CGC	2	6	814780	814785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302590
18043	NC_015966	CCAG	2	8	814807	814814	25 %	0 %	25 %	50 %	345302590
18044	NC_015966	CTC	2	6	814967	814972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302591
18045	NC_015966	CGG	3	9	814979	814987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302591
18046	NC_015966	C	6	6	815031	815036	0 %	0 %	0 %	100 %	345302591
18047	NC_015966	GGC	2	6	815046	815051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302591
18048	NC_015966	CAG	2	6	815075	815080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302591
18049	NC_015966	GCGGA	2	10	815093	815102	20 %	0 %	60 %	20 %	345302591
18050	NC_015966	TCC	2	6	815115	815120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302591
18051	NC_015966	CCG	2	6	815132	815137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302591
18052	NC_015966	GCC	2	6	815202	815207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302591
18053	NC_015966	GACG	2	8	815213	815220	25 %	0 %	50 %	25 %	345302591
18054	NC_015966	CAC	2	6	815231	815236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302591
18055	NC_015966	TCC	2	6	815244	815249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302591
18056	NC_015966	GCG	2	6	815279	815284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302591
18057	NC_015966	TCG	2	6	815325	815330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302591
18058	NC_015966	GCC	2	6	815345	815350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302591
18059	NC_015966	CTT	2	6	815380	815385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302591
18060	NC_015966	CGA	2	6	815404	815409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302591
18061	NC_015966	CTT	2	6	815458	815463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302591
18062	NC_015966	CCA	2	6	815497	815502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302591
18063	NC_015966	GGT	2	6	815516	815521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302591
18064	NC_015966	CGTT	2	8	815607	815614	0 %	50 %	25 %	25 %	345302591
18065	NC_015966	GGCG	2	8	815718	815725	0 %	0 %	75 %	25 %	345302592
18066	NC_015966	TCT	2	6	815777	815782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302592
18067	NC_015966	GGGC	2	8	815823	815830	0 %	0 %	75 %	25 %	345302592
18068	NC_015966	CAC	2	6	815877	815882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302592
18069	NC_015966	AGC	2	6	815888	815893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302592
18070	NC_015966	GCC	2	6	815901	815906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302592
18071	NC_015966	CAC	2	6	815935	815940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302592
18072	NC_015966	ATC	2	6	816013	816018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302592
18073	NC_015966	CGT	2	6	816071	816076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302592
18074	NC_015966	CAT	2	6	816096	816101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302592
18075	NC_015966	GCA	2	6	816111	816116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302592
18076	NC_015966	GGCATG	2	12	816130	816141	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345302592
18077	NC_015966	CAG	2	6	816165	816170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302592
18078	NC_015966	GCCC	2	8	816308	816315	0 %	0 %	25 %	75 %	345302593
18079	NC_015966	CCA	2	6	816476	816481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302593
18080	NC_015966	CGG	2	6	816617	816622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302593
18081	NC_015966	GGAA	2	8	816646	816653	50 %	0 %	50 %	0 %	345302593
18082	NC_015966	GGT	2	6	816807	816812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302594
18083	NC_015966	TCG	2	6	816830	816835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302594
18084	NC_015966	TTC	2	6	816838	816843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302594
18085	NC_015966	GGC	2	6	816922	816927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302594
18086	NC_015966	GCC	2	6	816947	816952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302594
18087	NC_015966	ATCAGC	2	12	816974	816985	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345302594
18088	NC_015966	GCTG	2	8	816993	817000	0 %	25 %	50 %	25 %	345302594
18089	NC_015966	GTG	2	6	817106	817111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302594
18090	NC_015966	GACG	2	8	817135	817142	25 %	0 %	50 %	25 %	345302594
18091	NC_015966	GCA	2	6	817206	817211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302594
18092	NC_015966	CGA	2	6	817270	817275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302594
18093	NC_015966	CTT	2	6	817299	817304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302594
18094	NC_015966	GCT	2	6	817353	817358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302594
18095	NC_015966	G	7	7	817483	817489	0 %	0 %	100 %	0 %	345302594
18096	NC_015966	CGG	2	6	817542	817547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302594
18097	NC_015966	GC	3	6	817558	817563	0 %	0 %	50 %	50 %	345302594
18098	NC_015966	CAT	2	6	817576	817581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302594
18099	NC_015966	AGA	2	6	817587	817592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302594
18100	NC_015966	CGTG	2	8	817635	817642	0 %	25 %	50 %	25 %	345302594
18101	NC_015966	ATC	2	6	817649	817654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302594
18102	NC_015966	CGC	2	6	817679	817684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302594
18103	NC_015966	GCG	2	6	817801	817806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302594
18104	NC_015966	CCA	2	6	817845	817850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302594
18105	NC_015966	CGT	2	6	817851	817856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302594
18106	NC_015966	TCT	2	6	817866	817871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302594
18107	NC_015966	TCT	2	6	817928	817933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302594
18108	NC_015966	GGC	2	6	817969	817974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302594
18109	NC_015966	CCT	2	6	818007	818012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302594
18110	NC_015966	GCT	2	6	818144	818149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302595
18111	NC_015966	CTG	2	6	818261	818266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302595
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18114	NC_015966	GGT	2	6	818372	818377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302595
18115	NC_015966	GCG	2	6	818453	818458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302595
18116	NC_015966	TGGT	2	8	818475	818482	0 %	50 %	50 %	0 %	345302595
18117	NC_015966	TGA	2	6	818551	818556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302595
18118	NC_015966	GTC	2	6	818573	818578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302595
18119	NC_015966	CG	3	6	818584	818589	0 %	0 %	50 %	50 %	345302595
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18238	NC_015966	GTC	2	6	824385	824390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302602
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18332	NC_015966	GATC	2	8	828870	828877	25 %	25 %	25 %	25 %	345302606
18333	NC_015966	CTG	3	9	829015	829023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302607
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18337	NC_015966	TACGAT	2	12	829204	829215	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	345302607
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18340	NC_015966	TGC	3	9	829313	829321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302607
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18343	NC_015966	CTG	2	6	829372	829377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302607
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18348	NC_015966	GC	3	6	830118	830123	0 %	0 %	50 %	50 %	345302608
18349	NC_015966	CCGC	2	8	830129	830136	0 %	0 %	25 %	75 %	345302608
18350	NC_015966	ACA	3	9	830183	830191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302608
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18352	NC_015966	TC	3	6	830345	830350	0 %	50 %	0 %	50 %	345302608
18353	NC_015966	CCG	2	6	830366	830371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302608
18354	NC_015966	GGCGC	2	10	830411	830420	0 %	0 %	60 %	40 %	345302608
18355	NC_015966	CGA	2	6	830440	830445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302608
18356	NC_015966	GC	3	6	830469	830474	0 %	0 %	50 %	50 %	345302608
18357	NC_015966	AAAC	2	8	830487	830494	75 %	0 %	0 %	25 %	345302608
18358	NC_015966	GC	3	6	830550	830555	0 %	0 %	50 %	50 %	345302608
18359	NC_015966	GCC	2	6	830563	830568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302608
18360	NC_015966	T	7	7	830582	830588	0 %	100 %	0 %	0 %	345302608
18361	NC_015966	CCGG	2	8	830596	830603	0 %	0 %	50 %	50 %	345302608
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18363	NC_015966	GCT	2	6	830701	830706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302608
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18374	NC_015966	GGT	2	6	831743	831748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302609
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18385	NC_015966	GGGC	2	8	832122	832129	0 %	0 %	75 %	25 %	345302609
18386	NC_015966	CCAG	2	8	832235	832242	25 %	0 %	25 %	50 %	345302609
18387	NC_015966	TGC	2	6	832256	832261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302609
18388	NC_015966	CGA	2	6	832286	832291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302609
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18391	NC_015966	CCA	2	6	832511	832516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302609
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18393	NC_015966	GGCG	2	8	832571	832578	0 %	0 %	75 %	25 %	345302609
18394	NC_015966	CCAGA	2	10	832611	832620	40 %	0 %	20 %	40 %	345302609
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18460	NC_015966	CG	3	6	836315	836320	0 %	0 %	50 %	50 %	345302611
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18466	NC_015966	GC	3	6	836511	836516	0 %	0 %	50 %	50 %	345302611
18467	NC_015966	CTA	2	6	836523	836528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302611
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18471	NC_015966	G	6	6	836643	836648	0 %	0 %	100 %	0 %	345302611
18472	NC_015966	GGA	2	6	836658	836663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302611
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18474	NC_015966	GCC	2	6	836729	836734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302611
18475	NC_015966	GGA	3	9	836736	836744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302611
18476	NC_015966	GCG	2	6	836763	836768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302611
18477	NC_015966	AGG	2	6	836825	836830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302611
18478	NC_015966	CGAC	2	8	836844	836851	25 %	0 %	25 %	50 %	345302611
18479	NC_015966	CCG	2	6	836873	836878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302611
18480	NC_015966	CGT	2	6	836963	836968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302611
18481	NC_015966	AGC	2	6	836987	836992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302611
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18484	NC_015966	GAT	2	6	837066	837071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302611
18485	NC_015966	GCTC	2	8	837080	837087	0 %	25 %	25 %	50 %	345302611
18486	NC_015966	GCT	2	6	837105	837110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302611
18487	NC_015966	GCCG	2	8	837165	837172	0 %	0 %	50 %	50 %	345302611
18488	NC_015966	CTG	2	6	837178	837183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302611
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18499	NC_015966	CGGT	2	8	837643	837650	0 %	25 %	50 %	25 %	345302612
18500	NC_015966	TGC	3	9	837652	837660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302612

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