MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_015966	GCCAGA	2	12	678805	678816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302472
15002	NC_015966	CGG	2	6	678821	678826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302472
15003	NC_015966	ACGCTC	2	12	678855	678866	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345302472
15004	NC_015966	GGGC	2	8	678896	678903	0 %	0 %	75 %	25 %	345302472
15005	NC_015966	GCC	2	6	678909	678914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302472
15006	NC_015966	TGG	2	6	678952	678957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302472
15007	NC_015966	GGT	2	6	679058	679063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302472
15008	NC_015966	GCC	2	6	679083	679088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302472
15009	NC_015966	TC	3	6	679100	679105	0 %	50 %	0 %	50 %	345302472
15010	NC_015966	TCTGG	2	10	679115	679124	0 %	40 %	40 %	20 %	345302472
15011	NC_015966	GCT	2	6	679133	679138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302472
15012	NC_015966	GCC	2	6	679226	679231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302472
15013	NC_015966	GCT	2	6	679256	679261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302472
15014	NC_015966	TGC	2	6	679297	679302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302472
15015	NC_015966	CTG	2	6	679308	679313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302472
15016	NC_015966	GCC	2	6	679346	679351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302472
15017	NC_015966	TGG	2	6	679375	679380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302472
15018	NC_015966	GCT	2	6	679382	679387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302472
15019	NC_015966	GCG	2	6	679413	679418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302472
15020	NC_015966	GGCC	2	8	679473	679480	0 %	0 %	50 %	50 %	345302472
15021	NC_015966	GCC	2	6	679519	679524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302472
15022	NC_015966	CGGCTC	2	12	679587	679598	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345302472
15023	NC_015966	CGA	2	6	679604	679609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302472
15024	NC_015966	GCT	2	6	679706	679711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302472
15025	NC_015966	AC	3	6	679718	679723	50 %	0 %	0 %	50 %	345302472
15026	NC_015966	GGCT	2	8	679726	679733	0 %	25 %	50 %	25 %	345302472
15027	NC_015966	GAA	2	6	679740	679745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302472
15028	NC_015966	TGGC	2	8	679788	679795	0 %	25 %	50 %	25 %	345302472
15029	NC_015966	GCA	3	9	679796	679804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302472
15030	NC_015966	CG	3	6	679806	679811	0 %	0 %	50 %	50 %	345302472
15031	NC_015966	ACC	2	6	679815	679820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302472
15032	NC_015966	CCG	2	6	679828	679833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302472
15033	NC_015966	CTG	2	6	679926	679931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302473
15034	NC_015966	GCTG	2	8	679981	679988	0 %	25 %	50 %	25 %	345302473
15035	NC_015966	CGG	2	6	680002	680007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302473
15036	NC_015966	GTG	2	6	680013	680018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302473
15037	NC_015966	TGG	2	6	680035	680040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302473
15038	NC_015966	CGC	2	6	680085	680090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302473
15039	NC_015966	CTG	2	6	680127	680132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302473
15040	NC_015966	GGCGCT	2	12	680141	680152	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302473
15041	NC_015966	GGC	2	6	680171	680176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302473
15042	NC_015966	ATC	2	6	680184	680189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302473
15043	NC_015966	TGC	2	6	680233	680238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302473
15044	NC_015966	TGC	3	9	680341	680349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302473
15045	NC_015966	GCG	2	6	680353	680358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302473
15046	NC_015966	TGC	2	6	680380	680385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302473
15047	NC_015966	GCT	2	6	680411	680416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302473
15048	NC_015966	GCTAC	2	10	680429	680438	20 %	20 %	20 %	40 %	345302473
15049	NC_015966	AGC	2	6	680459	680464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302473
15050	NC_015966	CGG	2	6	680479	680484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302473
15051	NC_015966	CTG	2	6	680532	680537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302473
15052	NC_015966	GCC	2	6	680538	680543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302473
15053	NC_015966	CTG	3	9	680658	680666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302473
15054	NC_015966	CGCTGG	2	12	680698	680709	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302473
15055	NC_015966	GCG	2	6	680757	680762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302473
15056	NC_015966	GCC	2	6	680763	680768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302473
15057	NC_015966	TGGG	2	8	680769	680776	0 %	25 %	75 %	0 %	345302473
15058	NC_015966	CGG	2	6	680856	680861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302473
15059	NC_015966	GC	3	6	680917	680922	0 %	0 %	50 %	50 %	345302473
15060	NC_015966	GTC	2	6	681016	681021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302473
15061	NC_015966	GCG	2	6	681041	681046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302474
15062	NC_015966	AGC	2	6	681048	681053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
15063	NC_015966	AGAA	2	8	681057	681064	75 %	0 %	25 %	0 %	345302474
15064	NC_015966	CGC	2	6	681070	681075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302474
15065	NC_015966	GAC	2	6	681086	681091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
15066	NC_015966	AGC	2	6	681117	681122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
15067	NC_015966	GGCG	2	8	681124	681131	0 %	0 %	75 %	25 %	345302474
15068	NC_015966	CAG	2	6	681164	681169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
15069	NC_015966	ACC	2	6	681183	681188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302474
15070	NC_015966	CGA	2	6	681241	681246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
15071	NC_015966	CAG	2	6	681305	681310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
15072	NC_015966	GGCT	2	8	681347	681354	0 %	25 %	50 %	25 %	345302474
15073	NC_015966	CAG	4	12	681362	681373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
15074	NC_015966	AGC	2	6	681405	681410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
15075	NC_015966	CAG	2	6	681413	681418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
15076	NC_015966	GCA	2	6	681439	681444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
15077	NC_015966	GAAC	2	8	681464	681471	50 %	0 %	25 %	25 %	345302474
15078	NC_015966	CAG	2	6	681473	681478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
15079	NC_015966	GGCGA	2	10	681513	681522	20 %	0 %	60 %	20 %	345302474
15080	NC_015966	ACGA	2	8	681528	681535	50 %	0 %	25 %	25 %	345302474
15081	NC_015966	CGC	2	6	681568	681573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302474
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15083	NC_015966	CAG	2	6	681641	681646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
15084	NC_015966	GCC	2	6	681660	681665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302474
15085	NC_015966	AGC	2	6	681690	681695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
15086	NC_015966	GAA	2	6	681700	681705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302474
15087	NC_015966	CCG	2	6	681825	681830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302474
15088	NC_015966	CAG	2	6	681833	681838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
15089	NC_015966	CCG	2	6	681898	681903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302474
15090	NC_015966	AGC	2	6	681921	681926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
15091	NC_015966	CAC	3	9	681932	681940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302474
15092	NC_015966	CCA	2	6	681979	681984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302474
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15094	NC_015966	AGC	2	6	682005	682010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
15095	NC_015966	CAG	2	6	682011	682016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302474
15096	NC_015966	GCAG	2	8	682071	682078	25 %	0 %	50 %	25 %	345302475
15097	NC_015966	GCA	2	6	682080	682085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302475
15098	NC_015966	GGCC	2	8	682095	682102	0 %	0 %	50 %	50 %	345302475
15099	NC_015966	CGGC	2	8	682167	682174	0 %	0 %	50 %	50 %	345302475
15100	NC_015966	GAT	2	6	682191	682196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302475
15101	NC_015966	GCA	2	6	682200	682205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302475
15102	NC_015966	GCCG	2	8	682228	682235	0 %	0 %	50 %	50 %	345302475
15103	NC_015966	ACG	2	6	682238	682243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302475
15104	NC_015966	GCA	2	6	682263	682268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302475
15105	NC_015966	TCG	2	6	682274	682279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302475
15106	NC_015966	CCA	2	6	682338	682343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302475
15107	NC_015966	TCG	2	6	682385	682390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302475
15108	NC_015966	GCC	3	9	682436	682444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302475
15109	NC_015966	GCT	2	6	682490	682495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302475
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15111	NC_015966	CGA	2	6	682656	682661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302475
15112	NC_015966	CGGC	2	8	682710	682717	0 %	0 %	50 %	50 %	345302475
15113	NC_015966	TCG	2	6	682724	682729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302475
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15116	NC_015966	GCA	2	6	682766	682771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302475
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15118	NC_015966	TCG	2	6	682850	682855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302475
15119	NC_015966	GCCG	2	8	682889	682896	0 %	0 %	50 %	50 %	345302475
15120	NC_015966	CAG	3	9	682921	682929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302475
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15475	NC_015966	GTA	2	6	699128	699133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302492
15476	NC_015966	GCG	2	6	699188	699193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302492
15477	NC_015966	CGG	2	6	699280	699285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302492
15478	NC_015966	TCG	3	9	699324	699332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302492
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