MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_015966	CGG	2	6	657327	657332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302452
14502	NC_015966	TTC	2	6	657385	657390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302452
14503	NC_015966	CGC	2	6	657395	657400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302452
14504	NC_015966	C	6	6	657452	657457	0 %	0 %	0 %	100 %	345302452
14505	NC_015966	GCC	2	6	657490	657495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302452
14506	NC_015966	GC	3	6	657497	657502	0 %	0 %	50 %	50 %	345302452
14507	NC_015966	GC	3	6	657537	657542	0 %	0 %	50 %	50 %	345302452
14508	NC_015966	GCG	2	6	657574	657579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302452
14509	NC_015966	CTG	2	6	658750	658755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302453
14510	NC_015966	GCC	2	6	658785	658790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302453
14511	NC_015966	GCT	2	6	658800	658805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302453
14512	NC_015966	TGC	2	6	658811	658816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302453
14513	NC_015966	GCG	2	6	658868	658873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302453
14514	NC_015966	GT	3	6	658911	658916	0 %	50 %	50 %	0 %	345302453
14515	NC_015966	ACG	2	6	658951	658956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302453
14516	NC_015966	GGAAG	2	10	658974	658983	40 %	0 %	60 %	0 %	345302453
14517	NC_015966	GCC	2	6	659059	659064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302453
14518	NC_015966	GCT	2	6	659067	659072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302453
14519	NC_015966	CGA	2	6	659094	659099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302453
14520	NC_015966	CAT	2	6	659103	659108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302453
14521	NC_015966	CGC	2	6	659109	659114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302453
14522	NC_015966	GGC	2	6	659119	659124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302453
14523	NC_015966	ATC	2	6	659147	659152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302453
14524	NC_015966	AGG	2	6	659195	659200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302453
14525	NC_015966	CG	3	6	659271	659276	0 %	0 %	50 %	50 %	345302454
14526	NC_015966	GCC	2	6	659295	659300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302454
14527	NC_015966	CGGG	2	8	659302	659309	0 %	0 %	75 %	25 %	345302454
14528	NC_015966	TCG	2	6	659314	659319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302454
14529	NC_015966	GAAG	2	8	659348	659355	50 %	0 %	50 %	0 %	345302454
14530	NC_015966	CGGA	2	8	659398	659405	25 %	0 %	50 %	25 %	345302454
14531	NC_015966	TGG	2	6	659470	659475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302454
14532	NC_015966	GAG	2	6	659478	659483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302454
14533	NC_015966	GGC	2	6	659556	659561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302454
14534	NC_015966	AGC	2	6	659565	659570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302454
14535	NC_015966	TCG	2	6	659626	659631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302454
14536	NC_015966	GGC	2	6	659633	659638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302454
14537	NC_015966	CG	3	6	659639	659644	0 %	0 %	50 %	50 %	345302454
14538	NC_015966	TGC	2	6	659692	659697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302454
14539	NC_015966	GGC	2	6	659735	659740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302454
14540	NC_015966	GCC	2	6	659759	659764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302454
14541	NC_015966	CGGC	2	8	659807	659814	0 %	0 %	50 %	50 %	345302454
14542	NC_015966	GCG	2	6	659821	659826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302454
14543	NC_015966	ACGGG	2	10	659847	659856	20 %	0 %	60 %	20 %	345302454
14544	NC_015966	GCT	2	6	659933	659938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302454
14545	NC_015966	ACG	2	6	659944	659949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302454
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14547	NC_015966	GCGT	2	8	659974	659981	0 %	25 %	50 %	25 %	345302454
14548	NC_015966	CGT	2	6	659984	659989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302454
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14550	NC_015966	GGC	2	6	660076	660081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302454
14551	NC_015966	CGG	2	6	660130	660135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302454
14552	NC_015966	GGC	2	6	660161	660166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302454
14553	NC_015966	GCC	2	6	660226	660231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302454
14554	NC_015966	GGC	2	6	660353	660358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302454
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14556	NC_015966	GCT	2	6	660416	660421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302454
14557	NC_015966	G	6	6	660422	660427	0 %	0 %	100 %	0 %	345302454
14558	NC_015966	TCGG	2	8	660433	660440	0 %	25 %	50 %	25 %	345302454
14559	NC_015966	GAC	2	6	660450	660455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302454
14560	NC_015966	GC	3	6	660493	660498	0 %	0 %	50 %	50 %	345302454
14561	NC_015966	GGT	2	6	660506	660511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302454
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14564	NC_015966	CGG	2	6	660689	660694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302454
14565	NC_015966	ACC	2	6	660739	660744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302454
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14567	NC_015966	CA	5	10	660789	660798	50 %	0 %	0 %	50 %	345302454
14568	NC_015966	CGA	2	6	660824	660829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302454
14569	NC_015966	GGC	3	9	660833	660841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302454
14570	NC_015966	GCGAA	2	10	660893	660902	40 %	0 %	40 %	20 %	345302454
14571	NC_015966	GGC	3	9	660903	660911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302454
14572	NC_015966	GCG	2	6	660941	660946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302454
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14586	NC_015966	GCTG	2	8	661589	661596	0 %	25 %	50 %	25 %	345302455
14587	NC_015966	GGC	3	9	661613	661621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302455
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14593	NC_015966	GGCC	2	8	661874	661881	0 %	0 %	50 %	50 %	345302455
14594	NC_015966	TGGC	2	8	661901	661908	0 %	25 %	50 %	25 %	345302455
14595	NC_015966	GCT	2	6	661925	661930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302455
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14599	NC_015966	CTG	2	6	662121	662126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302455
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14601	NC_015966	GAA	2	6	662148	662153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302455
14602	NC_015966	CGGG	2	8	662192	662199	0 %	0 %	75 %	25 %	345302455
14603	NC_015966	CTG	2	6	662222	662227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302455
14604	NC_015966	TGC	2	6	662242	662247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302455
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14606	NC_015966	GCT	2	6	662306	662311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302455
14607	NC_015966	GCGT	2	8	662320	662327	0 %	25 %	50 %	25 %	345302455
14608	NC_015966	GCT	2	6	662375	662380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302455
14609	NC_015966	GGC	2	6	662381	662386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302455
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14611	NC_015966	CTG	2	6	662415	662420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302455
14612	NC_015966	CCTGA	2	10	662438	662447	20 %	20 %	20 %	40 %	345302455
14613	NC_015966	GCTG	2	8	662536	662543	0 %	25 %	50 %	25 %	345302456
14614	NC_015966	GTGCAG	2	12	662544	662555	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345302456
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14616	NC_015966	GC	3	6	662725	662730	0 %	0 %	50 %	50 %	345302456
14617	NC_015966	CTGG	2	8	662807	662814	0 %	25 %	50 %	25 %	345302456
14618	NC_015966	CAAT	2	8	662839	662846	50 %	25 %	0 %	25 %	345302456
14619	NC_015966	CGA	2	6	662857	662862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302456
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