MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_015966	CGG	2	6	638343	638348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302436
14002	NC_015966	CGT	2	6	638409	638414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302436
14003	NC_015966	CCA	2	6	638442	638447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302436
14004	NC_015966	GCG	2	6	638467	638472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302436
14005	NC_015966	GCA	2	6	638478	638483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302436
14006	NC_015966	GCT	2	6	638572	638577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302436
14007	NC_015966	ACC	2	6	638650	638655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302436
14008	NC_015966	GC	3	6	638828	638833	0 %	0 %	50 %	50 %	345302436
14009	NC_015966	TTC	2	6	638842	638847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302436
14010	NC_015966	CGA	2	6	638865	638870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302436
14011	NC_015966	TTC	2	6	638905	638910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302436
14012	NC_015966	GCG	2	6	638914	638919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302436
14013	NC_015966	GAG	2	6	638929	638934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302436
14014	NC_015966	CTG	2	6	638935	638940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302436
14015	NC_015966	TTC	2	6	638965	638970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302436
14016	NC_015966	GCA	2	6	639447	639452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302437
14017	NC_015966	CTG	2	6	639461	639466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302437
14018	NC_015966	GGC	2	6	639493	639498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302437
14019	NC_015966	AGG	2	6	639525	639530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302437
14020	NC_015966	TGC	3	9	639588	639596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302437
14021	NC_015966	GGC	2	6	639643	639648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302437
14022	NC_015966	GGA	2	6	639658	639663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302437
14023	NC_015966	GGCC	2	8	639744	639751	0 %	0 %	50 %	50 %	345302437
14024	NC_015966	GCTGG	2	10	639754	639763	0 %	20 %	60 %	20 %	345302437
14025	NC_015966	CGG	2	6	639777	639782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302437
14026	NC_015966	GC	3	6	639815	639820	0 %	0 %	50 %	50 %	345302437
14027	NC_015966	GTG	2	6	639836	639841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302437
14028	NC_015966	TG	3	6	639860	639865	0 %	50 %	50 %	0 %	345302437
14029	NC_015966	TGC	2	6	639900	639905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302437
14030	NC_015966	TGC	2	6	639963	639968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302437
14031	NC_015966	GGCTTC	2	12	640014	640025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302437
14032	NC_015966	GGC	2	6	640042	640047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302437
14033	NC_015966	CGCC	2	8	640048	640055	0 %	0 %	25 %	75 %	345302437
14034	NC_015966	CTGC	2	8	640064	640071	0 %	25 %	25 %	50 %	345302437
14035	NC_015966	TCC	2	6	640137	640142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302437
14036	NC_015966	GCG	2	6	640147	640152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302437
14037	NC_015966	CG	3	6	640164	640169	0 %	0 %	50 %	50 %	345302437
14038	NC_015966	GC	3	6	640173	640178	0 %	0 %	50 %	50 %	345302437
14039	NC_015966	GAAC	2	8	640222	640229	50 %	0 %	25 %	25 %	345302437
14040	NC_015966	CGT	2	6	640255	640260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302437
14041	NC_015966	GCT	2	6	640279	640284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302437
14042	NC_015966	GGC	2	6	640315	640320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302437
14043	NC_015966	GCT	2	6	640321	640326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302437
14044	NC_015966	CCG	2	6	640375	640380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302437
14045	NC_015966	GCT	2	6	640384	640389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302437
14046	NC_015966	CCA	2	6	640420	640425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302437
14047	NC_015966	GGATCC	2	12	640492	640503	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345302437
14048	NC_015966	GGCC	2	8	640585	640592	0 %	0 %	50 %	50 %	345302437
14049	NC_015966	TCT	2	6	640599	640604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302437
14050	NC_015966	GCC	2	6	640612	640617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302437
14051	NC_015966	CTG	2	6	640659	640664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302437
14052	NC_015966	TCA	2	6	640667	640672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302437
14053	NC_015966	TGCGTG	2	12	640686	640697	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345302437
14054	NC_015966	GC	3	6	640705	640710	0 %	0 %	50 %	50 %	345302437
14055	NC_015966	GCT	2	6	640836	640841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302438
14056	NC_015966	GCT	2	6	640887	640892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302438
14057	NC_015966	CGG	2	6	640926	640931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302438
14058	NC_015966	CGT	2	6	640975	640980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302438
14059	NC_015966	CGG	2	6	641000	641005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302438
14060	NC_015966	GCC	2	6	641071	641076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302438
14061	NC_015966	TG	3	6	641119	641124	0 %	50 %	50 %	0 %	345302438
14062	NC_015966	GTG	3	9	641122	641130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302438
14063	NC_015966	AGA	2	6	641166	641171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302438
14064	NC_015966	GGC	2	6	641172	641177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302438
14065	NC_015966	GGC	2	6	641205	641210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302438
14066	NC_015966	GCT	2	6	641283	641288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302438
14067	NC_015966	G	6	6	641313	641318	0 %	0 %	100 %	0 %	345302438
14068	NC_015966	GCG	2	6	641335	641340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302438
14069	NC_015966	GGCG	2	8	641346	641353	0 %	0 %	75 %	25 %	345302438
14070	NC_015966	CTG	2	6	641497	641502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302438
14071	NC_015966	GCT	2	6	641595	641600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302438
14072	NC_015966	ACC	2	6	641629	641634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302438
14073	NC_015966	CCA	2	6	641645	641650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302439
14074	NC_015966	GAA	2	6	641656	641661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302439
14075	NC_015966	TCG	2	6	641705	641710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302439
14076	NC_015966	CCG	2	6	641731	641736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302439
14077	NC_015966	CTT	2	6	641760	641765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302439
14078	NC_015966	TGG	2	6	641777	641782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302439
14079	NC_015966	CGG	2	6	641843	641848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302439
14080	NC_015966	GCG	2	6	641868	641873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302439
14081	NC_015966	GGGC	2	8	641876	641883	0 %	0 %	75 %	25 %	345302439
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14084	NC_015966	GTG	2	6	641911	641916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302439
14085	NC_015966	ATC	2	6	641969	641974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302439
14086	NC_015966	GCTGG	2	10	642063	642072	0 %	20 %	60 %	20 %	345302439
14087	NC_015966	CT	3	6	642094	642099	0 %	50 %	0 %	50 %	345302439
14088	NC_015966	ATCG	2	8	642100	642107	25 %	25 %	25 %	25 %	345302439
14089	NC_015966	CAA	2	6	642108	642113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302439
14090	NC_015966	TCGC	2	8	642120	642127	0 %	25 %	25 %	50 %	345302439
14091	NC_015966	TGC	2	6	642176	642181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302439
14092	NC_015966	CTG	2	6	642244	642249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302439
14093	NC_015966	CCG	2	6	642300	642305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302439
14094	NC_015966	GCG	2	6	642315	642320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302439
14095	NC_015966	AGT	2	6	642348	642353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302439
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14099	NC_015966	GAA	2	6	642599	642604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302440
14100	NC_015966	GAG	2	6	642605	642610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302440
14101	NC_015966	CG	3	6	642675	642680	0 %	0 %	50 %	50 %	345302440
14102	NC_015966	CGT	2	6	642733	642738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302440
14103	NC_015966	ACT	2	6	642795	642800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302440
14104	NC_015966	GCT	2	6	642847	642852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302441
14105	NC_015966	CGGCAT	2	12	642934	642945	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345302441
14106	NC_015966	CTGC	2	8	642951	642958	0 %	25 %	25 %	50 %	345302441
14107	NC_015966	TGC	2	6	642962	642967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302441
14108	NC_015966	T	6	6	642985	642990	0 %	100 %	0 %	0 %	345302441
14109	NC_015966	CTG	2	6	643177	643182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302441
14110	NC_015966	TCT	2	6	643220	643225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302441
14111	NC_015966	CTG	2	6	643228	643233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302441
14112	NC_015966	CTGG	2	8	643245	643252	0 %	25 %	50 %	25 %	345302441
14113	NC_015966	GGGC	2	8	643277	643284	0 %	0 %	75 %	25 %	345302441
14114	NC_015966	GGC	2	6	643290	643295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302441
14115	NC_015966	ACC	2	6	643312	643317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302441
14116	NC_015966	CTGG	2	8	643380	643387	0 %	25 %	50 %	25 %	345302441
14117	NC_015966	GCG	2	6	643410	643415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302441
14118	NC_015966	TGT	2	6	643436	643441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302441
14119	NC_015966	GTG	2	6	643447	643452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302441
14120	NC_015966	GCC	2	6	643456	643461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302441
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14231	NC_015966	CG	3	6	647206	647211	0 %	0 %	50 %	50 %	345302443
14232	NC_015966	CCG	2	6	647212	647217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302443
14233	NC_015966	CTA	2	6	647257	647262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302443
14234	NC_015966	GAC	2	6	647294	647299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302443
14235	NC_015966	CCGGT	2	10	647300	647309	0 %	20 %	40 %	40 %	345302443
14236	NC_015966	CG	3	6	647376	647381	0 %	0 %	50 %	50 %	345302443
14237	NC_015966	CGTGC	2	10	647474	647483	0 %	20 %	40 %	40 %	345302443
14238	NC_015966	GAAG	2	8	647506	647513	50 %	0 %	50 %	0 %	345302443
14239	NC_015966	CTGG	2	8	647518	647525	0 %	25 %	50 %	25 %	345302443
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14344	NC_015966	TGG	2	6	651105	651110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302447
14345	NC_015966	TGC	2	6	651165	651170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302447
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14347	NC_015966	GGCT	2	8	651194	651201	0 %	25 %	50 %	25 %	345302447
14348	NC_015966	GGC	2	6	651235	651240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302447
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14353	NC_015966	CCG	2	6	651352	651357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302447
14354	NC_015966	GGC	2	6	651383	651388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302447
14355	NC_015966	ACG	2	6	651420	651425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302447
14356	NC_015966	CTG	2	6	651500	651505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302447
14357	NC_015966	CGT	2	6	651574	651579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302447
14358	NC_015966	GGC	2	6	651580	651585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302447
14359	NC_015966	TGG	2	6	651614	651619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302447
14360	NC_015966	CGT	2	6	651658	651663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302447
14361	NC_015966	GGA	2	6	651683	651688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302447
14362	NC_015966	GCC	2	6	651689	651694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302447
14363	NC_015966	GGCG	2	8	651696	651703	0 %	0 %	75 %	25 %	345302447
14364	NC_015966	GCTC	2	8	651745	651752	0 %	25 %	25 %	50 %	345302447
14365	NC_015966	CTGGCG	2	12	651770	651781	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302447
14366	NC_015966	TGG	3	9	651858	651866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302447
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14369	NC_015966	GCA	2	6	652057	652062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302448
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14371	NC_015966	GCC	2	6	652234	652239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302448
14372	NC_015966	CCG	2	6	652262	652267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302448
14373	NC_015966	CCG	2	6	652328	652333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302448
14374	NC_015966	ACC	2	6	652373	652378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302448
14375	NC_015966	G	6	6	652398	652403	0 %	0 %	100 %	0 %	345302448
14376	NC_015966	CGT	2	6	652417	652422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302448
14377	NC_015966	CG	3	6	652452	652457	0 %	0 %	50 %	50 %	345302448
14378	NC_015966	CGG	2	6	652463	652468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302448
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14380	NC_015966	CACG	2	8	652507	652514	25 %	0 %	25 %	50 %	345302448
14381	NC_015966	CCG	2	6	652526	652531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302448
14382	NC_015966	CG	3	6	652530	652535	0 %	0 %	50 %	50 %	345302448
14383	NC_015966	GTG	2	6	652787	652792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302448
14384	NC_015966	CGTGCG	2	12	652810	652821	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302448
14385	NC_015966	GGC	2	6	652849	652854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302448
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14387	NC_015966	ACC	2	6	652910	652915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302448
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14395	NC_015966	TGGC	2	8	653347	653354	0 %	25 %	50 %	25 %	345302449
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14403	NC_015966	TGC	2	6	653705	653710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302449
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14411	NC_015966	TTC	2	6	654064	654069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302450
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14426	NC_015966	GGA	2	6	654548	654553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302451
14427	NC_015966	GGC	2	6	654570	654575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302451
14428	NC_015966	CGG	2	6	654582	654587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302451
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14432	NC_015966	CTG	2	6	654741	654746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302451
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14444	NC_015966	GCC	2	6	655395	655400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302451
14445	NC_015966	GCT	2	6	655403	655408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302451
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14453	NC_015966	GCCG	2	8	655613	655620	0 %	0 %	50 %	50 %	345302451
14454	NC_015966	CGG	2	6	655622	655627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302451
14455	NC_015966	GGCT	2	8	655704	655711	0 %	25 %	50 %	25 %	345302451
14456	NC_015966	TGG	2	6	655756	655761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302451
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14458	NC_015966	TCG	2	6	655919	655924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302452
14459	NC_015966	GCG	2	6	655940	655945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302452
14460	NC_015966	GCG	2	6	655993	655998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302452
14461	NC_015966	ACG	2	6	656036	656041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302452
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14464	NC_015966	CGT	2	6	656145	656150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302452
14465	NC_015966	AGCC	2	8	656154	656161	25 %	0 %	25 %	50 %	345302452
14466	NC_015966	CTG	3	9	656176	656184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302452
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14469	NC_015966	CGGC	2	8	656366	656373	0 %	0 %	50 %	50 %	345302452
14470	NC_015966	GCC	2	6	656515	656520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302452
14471	NC_015966	TGC	2	6	656522	656527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302452
14472	NC_015966	GC	3	6	656536	656541	0 %	0 %	50 %	50 %	345302452
14473	NC_015966	GCG	2	6	656578	656583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302452
14474	NC_015966	GCC	2	6	656584	656589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302452
14475	NC_015966	GCT	2	6	656622	656627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302452
14476	NC_015966	GCT	3	9	656691	656699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302452
14477	NC_015966	GCGG	2	8	656712	656719	0 %	0 %	75 %	25 %	345302452
14478	NC_015966	TGC	2	6	656726	656731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302452
14479	NC_015966	TGC	2	6	656744	656749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302452
14480	NC_015966	GGGC	2	8	656754	656761	0 %	0 %	75 %	25 %	345302452
14481	NC_015966	CTG	2	6	656779	656784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302452
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