MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_015966	GCC	2	6	614636	614641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302414
13502	NC_015966	AGC	2	6	614691	614696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302414
13503	NC_015966	T	6	6	614711	614716	0 %	100 %	0 %	0 %	345302414
13504	NC_015966	CAC	2	6	614738	614743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302414
13505	NC_015966	CAC	2	6	614795	614800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302414
13506	NC_015966	GGC	3	9	614936	614944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302414
13507	NC_015966	GGT	2	6	614987	614992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302414
13508	NC_015966	CGT	2	6	615149	615154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302414
13509	NC_015966	GGC	2	6	615204	615209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302414
13510	NC_015966	GCG	3	9	615210	615218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302414
13511	NC_015966	CG	3	6	615265	615270	0 %	0 %	50 %	50 %	345302414
13512	NC_015966	GGT	2	6	615560	615565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302415
13513	NC_015966	GGC	2	6	615566	615571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302415
13514	NC_015966	TTC	2	6	615572	615577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302415
13515	NC_015966	GCA	2	6	615628	615633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302415
13516	NC_015966	AGT	2	6	615655	615660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302415
13517	NC_015966	GGTG	2	8	615682	615689	0 %	25 %	75 %	0 %	345302415
13518	NC_015966	TCGAT	2	10	615712	615721	20 %	40 %	20 %	20 %	345302415
13519	NC_015966	ATC	2	6	615749	615754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302415
13520	NC_015966	ACG	2	6	615771	615776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302415
13521	NC_015966	AAG	2	6	615789	615794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302415
13522	NC_015966	CAG	2	6	615878	615883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302415
13523	NC_015966	TCG	2	6	615895	615900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302415
13524	NC_015966	TCGG	2	8	615921	615928	0 %	25 %	50 %	25 %	345302415
13525	NC_015966	CGT	2	6	616033	616038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302415
13526	NC_015966	TGA	2	6	616039	616044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302415
13527	NC_015966	GTC	2	6	616058	616063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302415
13528	NC_015966	TCA	2	6	616117	616122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302415
13529	NC_015966	GTC	2	6	616124	616129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302415
13530	NC_015966	TTGC	2	8	616148	616155	0 %	50 %	25 %	25 %	345302415
13531	NC_015966	GC	3	6	616190	616195	0 %	0 %	50 %	50 %	345302415
13532	NC_015966	GGT	2	6	616199	616204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302415
13533	NC_015966	CA	3	6	616331	616336	50 %	0 %	0 %	50 %	345302415
13534	NC_015966	GC	3	6	616405	616410	0 %	0 %	50 %	50 %	345302415
13535	NC_015966	CAT	2	6	616411	616416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302415
13536	NC_015966	CAG	2	6	616424	616429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302415
13537	NC_015966	AGA	2	6	616453	616458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302415
13538	NC_015966	GGT	2	6	616514	616519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302415
13539	NC_015966	CAG	2	6	616520	616525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302415
13540	NC_015966	GCC	2	6	616527	616532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302415
13541	NC_015966	CTG	2	6	616574	616579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302415
13542	NC_015966	CAG	2	6	616592	616597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302415
13543	NC_015966	ATC	2	6	617375	617380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302416
13544	NC_015966	GCG	2	6	617423	617428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302416
13545	NC_015966	TGA	2	6	617447	617452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302416
13546	NC_015966	CG	3	6	617507	617512	0 %	0 %	50 %	50 %	345302416
13547	NC_015966	GTC	2	6	617562	617567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302416
13548	NC_015966	TGC	2	6	617623	617628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302416
13549	NC_015966	ACC	2	6	617680	617685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302416
13550	NC_015966	CG	4	8	617689	617696	0 %	0 %	50 %	50 %	345302416
13551	NC_015966	CCA	2	6	617735	617740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302416
13552	NC_015966	CATGC	2	10	617942	617951	20 %	20 %	20 %	40 %	345302417
13553	NC_015966	GCT	2	6	618052	618057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302417
13554	NC_015966	GAA	2	6	618074	618079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302417
13555	NC_015966	TGA	2	6	618183	618188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302417
13556	NC_015966	TTC	2	6	618191	618196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302417
13557	NC_015966	GCT	2	6	618259	618264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302417
13558	NC_015966	GGC	2	6	618322	618327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302417
13559	NC_015966	GGC	2	6	618355	618360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302417
13560	NC_015966	GGC	2	6	618367	618372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302417
13561	NC_015966	CGG	2	6	618384	618389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302417
13562	NC_015966	GC	3	6	618428	618433	0 %	0 %	50 %	50 %	345302417
13563	NC_015966	TCG	2	6	618453	618458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302417
13564	NC_015966	GGC	3	9	618496	618504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302417
13565	NC_015966	GC	3	6	618503	618508	0 %	0 %	50 %	50 %	345302417
13566	NC_015966	GGC	2	6	618586	618591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302417
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13568	NC_015966	GCC	2	6	618655	618660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302417
13569	NC_015966	GGC	2	6	618667	618672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302417
13570	NC_015966	GC	3	6	618676	618681	0 %	0 %	50 %	50 %	345302417
13571	NC_015966	GCTG	2	8	618744	618751	0 %	25 %	50 %	25 %	345302417
13572	NC_015966	TGG	2	6	618792	618797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302417
13573	NC_015966	GCT	2	6	618823	618828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302417
13574	NC_015966	TGGACA	2	12	618888	618899	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345302417
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13577	NC_015966	GGT	2	6	618964	618969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302417
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13579	NC_015966	TGC	2	6	618990	618995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302417
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13584	NC_015966	GTC	2	6	619239	619244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302417
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13587	NC_015966	TGG	2	6	619353	619358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302417
13588	NC_015966	CGG	2	6	619359	619364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302417
13589	NC_015966	GAGGCG	2	12	619394	619405	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	345302417
13590	NC_015966	GC	3	6	619409	619414	0 %	0 %	50 %	50 %	345302417
13591	NC_015966	GGT	2	6	619423	619428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302417
13592	NC_015966	GGC	2	6	619468	619473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302417
13593	NC_015966	GCTGGC	2	12	619507	619518	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302417
13594	NC_015966	GCG	2	6	619519	619524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302417
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13601	NC_015966	G	7	7	619687	619693	0 %	0 %	100 %	0 %	345302417
13602	NC_015966	GCC	2	6	619765	619770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302417
13603	NC_015966	GAG	2	6	619778	619783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302417
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13609	NC_015966	G	6	6	619953	619958	0 %	0 %	100 %	0 %	345302417
13610	NC_015966	AGG	2	6	619959	619964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302417
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13614	NC_015966	TCG	2	6	620165	620170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302417
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13619	NC_015966	AGT	2	6	620360	620365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302418
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13973	NC_015966	GCG	2	6	637088	637093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302435
13974	NC_015966	GCC	2	6	637129	637134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302435
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13981	NC_015966	GACCG	2	10	637374	637383	20 %	0 %	40 %	40 %	345302435
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