MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_015966	GCT	2	6	544364	544369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302361
12002	NC_015966	CGAC	2	8	544430	544437	25 %	0 %	25 %	50 %	345302361
12003	NC_015966	CGC	2	6	544452	544457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302361
12004	NC_015966	CGG	2	6	544490	544495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302361
12005	NC_015966	TAC	2	6	544557	544562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302361
12006	NC_015966	CGA	2	6	544574	544579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302361
12007	NC_015966	CGG	2	6	544802	544807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302361
12008	NC_015966	A	6	6	544865	544870	100 %	0 %	0 %	0 %	345302361
12009	NC_015966	CGCC	2	8	544876	544883	0 %	0 %	25 %	75 %	345302361
12010	NC_015966	GCA	2	6	544889	544894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302361
12011	NC_015966	CGG	2	6	544913	544918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302361
12012	NC_015966	GTG	2	6	545082	545087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302361
12013	NC_015966	TTC	2	6	545136	545141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302361
12014	NC_015966	GAA	2	6	545145	545150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302361
12015	NC_015966	GTG	2	6	545151	545156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302361
12016	NC_015966	CGG	2	6	545177	545182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302361
12017	NC_015966	CG	3	6	545209	545214	0 %	0 %	50 %	50 %	345302361
12018	NC_015966	CCG	2	6	545245	545250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302361
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12020	NC_015966	TGC	2	6	545272	545277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302361
12021	NC_015966	GCATG	2	10	545381	545390	20 %	20 %	40 %	20 %	345302361
12022	NC_015966	TGC	2	6	545460	545465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302361
12023	NC_015966	GCG	2	6	545573	545578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302361
12024	NC_015966	TGG	2	6	545662	545667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302361
12025	NC_015966	CATC	2	8	545679	545686	25 %	25 %	0 %	50 %	345302361
12026	NC_015966	GCCG	2	8	545743	545750	0 %	0 %	50 %	50 %	345302361
12027	NC_015966	GC	3	6	545769	545774	0 %	0 %	50 %	50 %	345302361
12028	NC_015966	CGA	2	6	545789	545794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302361
12029	NC_015966	GCG	2	6	545920	545925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302361
12030	NC_015966	GGCC	2	8	545959	545966	0 %	0 %	50 %	50 %	345302361
12031	NC_015966	CCG	2	6	545967	545972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302361
12032	NC_015966	CGG	2	6	546032	546037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302361
12033	NC_015966	GTCG	2	8	546063	546070	0 %	25 %	50 %	25 %	345302361
12034	NC_015966	CCG	2	6	546073	546078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302361
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12040	NC_015966	GCT	2	6	546352	546357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302362
12041	NC_015966	GC	3	6	546360	546365	0 %	0 %	50 %	50 %	345302362
12042	NC_015966	GC	3	6	546396	546401	0 %	0 %	50 %	50 %	345302362
12043	NC_015966	GC	3	6	546412	546417	0 %	0 %	50 %	50 %	345302362
12044	NC_015966	TCG	2	6	546459	546464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302362
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12046	NC_015966	TGC	2	6	546573	546578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302362
12047	NC_015966	TCG	2	6	546600	546605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302362
12048	NC_015966	CTG	2	6	546608	546613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302362
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12050	NC_015966	AACC	2	8	546766	546773	50 %	0 %	0 %	50 %	345302362
12051	NC_015966	GGAG	2	8	546789	546796	25 %	0 %	75 %	0 %	345302363
12052	NC_015966	GGA	2	6	546840	546845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302363
12053	NC_015966	TGG	2	6	546881	546886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302363
12054	NC_015966	GGC	2	6	546903	546908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302363
12055	NC_015966	CGT	2	6	546909	546914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302363
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12065	NC_015966	CGG	2	6	547349	547354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302363
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12069	NC_015966	GAG	2	6	547471	547476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302363
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12071	NC_015966	GCG	2	6	547521	547526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302363
12072	NC_015966	GGCG	2	8	547558	547565	0 %	0 %	75 %	25 %	345302363
12073	NC_015966	CAG	2	6	547633	547638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302363
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12082	NC_015966	CGAT	2	8	548024	548031	25 %	25 %	25 %	25 %	345302363
12083	NC_015966	TGC	2	6	548036	548041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302363
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12087	NC_015966	CGA	2	6	548109	548114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302363
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12093	NC_015966	CGA	2	6	548240	548245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302363
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12098	NC_015966	CCGG	2	8	548354	548361	0 %	0 %	50 %	50 %	345302363
12099	NC_015966	GCA	2	6	548430	548435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302363
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12102	NC_015966	CGA	2	6	548523	548528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302363
12103	NC_015966	GCT	3	9	548535	548543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302363
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12107	NC_015966	TGC	3	9	548741	548749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302363
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12109	NC_015966	GT	3	6	548809	548814	0 %	50 %	50 %	0 %	345302363
12110	NC_015966	CGG	2	6	548828	548833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302363
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12115	NC_015966	GCC	2	6	549381	549386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302364
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12119	NC_015966	GAT	2	6	549814	549819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302365
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12121	NC_015966	TTC	2	6	549914	549919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302365
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12123	NC_015966	TCC	2	6	549984	549989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302365
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12235	NC_015966	TGGCC	2	10	554721	554730	0 %	20 %	40 %	40 %	345302368
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12244	NC_015966	ATG	2	6	554987	554992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302368
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12351	NC_015966	CTGGAA	2	12	559757	559768	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345302372
12352	NC_015966	GTT	2	6	559795	559800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302372
12353	NC_015966	GGA	2	6	559834	559839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302372
12354	NC_015966	CGCT	2	8	559943	559950	0 %	25 %	25 %	50 %	345302372
12355	NC_015966	CGC	2	6	559970	559975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302372
12356	NC_015966	CGG	2	6	560041	560046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302372
12357	NC_015966	GTC	2	6	560108	560113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302372
12358	NC_015966	CGC	2	6	560283	560288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302373
12359	NC_015966	AGC	2	6	560319	560324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302373
12360	NC_015966	GCG	2	6	560401	560406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302373
12361	NC_015966	GGCG	2	8	560430	560437	0 %	0 %	75 %	25 %	345302373
12362	NC_015966	GAA	2	6	560507	560512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302373
12363	NC_015966	GATCTG	2	12	560513	560524	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345302373
12364	NC_015966	GGC	3	9	560593	560601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302373
12365	NC_015966	CAC	2	6	560642	560647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302373
12366	NC_015966	GGC	3	9	560728	560736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302373
12367	NC_015966	TGG	2	6	560745	560750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302373
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12369	NC_015966	TGC	2	6	560831	560836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302374
12370	NC_015966	CTG	2	6	560845	560850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302374
12371	NC_015966	GCCG	2	8	560858	560865	0 %	0 %	50 %	50 %	345302374
12372	NC_015966	CGG	2	6	560876	560881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302374
12373	NC_015966	CG	3	6	560890	560895	0 %	0 %	50 %	50 %	345302374
12374	NC_015966	CTG	2	6	560896	560901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302374
12375	NC_015966	GCCG	2	8	560994	561001	0 %	0 %	50 %	50 %	345302374
12376	NC_015966	GAC	2	6	561079	561084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302374
12377	NC_015966	CTATCG	2	12	561135	561146	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345302374
12378	NC_015966	GGC	2	6	561197	561202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302374
12379	NC_015966	TGC	2	6	561218	561223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302374
12380	NC_015966	GCA	2	6	561285	561290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302374
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12382	NC_015966	GTG	2	6	561340	561345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302374
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12386	NC_015966	CCG	2	6	561430	561435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302374
12387	NC_015966	GCA	3	9	561453	561461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302374
12388	NC_015966	GCGG	2	8	561465	561472	0 %	0 %	75 %	25 %	345302374
12389	NC_015966	GAC	2	6	561561	561566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302374
12390	NC_015966	CTA	2	6	561600	561605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302374
12391	NC_015966	CTA	2	6	561621	561626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302374
12392	NC_015966	TCGG	2	8	561665	561672	0 %	25 %	50 %	25 %	345302374
12393	NC_015966	CG	3	6	561691	561696	0 %	0 %	50 %	50 %	345302374
12394	NC_015966	GCG	2	6	561714	561719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302374
12395	NC_015966	GC	3	6	561784	561789	0 %	0 %	50 %	50 %	345302374
12396	NC_015966	CGA	2	6	561795	561800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302374
12397	NC_015966	GCT	2	6	561801	561806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302374
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12406	NC_015966	TGG	2	6	562253	562258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302374
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12414	NC_015966	ATG	2	6	562743	562748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302375
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12419	NC_015966	CGT	2	6	562904	562909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302375
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12429	NC_015966	GAAAG	2	10	563363	563372	60 %	0 %	40 %	0 %	345302375
12430	NC_015966	CAT	2	6	563405	563410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302375
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12440	NC_015966	CG	3	6	563893	563898	0 %	0 %	50 %	50 %	345302376
12441	NC_015966	GC	3	6	563924	563929	0 %	0 %	50 %	50 %	345302376
12442	NC_015966	TGC	2	6	563933	563938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302376
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12445	NC_015966	CGG	2	6	564007	564012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302376
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12449	NC_015966	GCGG	2	8	564150	564157	0 %	0 %	75 %	25 %	345302376
12450	NC_015966	GGC	2	6	564160	564165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302376
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12455	NC_015966	CCG	2	6	564445	564450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302376
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12458	NC_015966	TACC	2	8	564610	564617	25 %	25 %	0 %	50 %	345302376
12459	NC_015966	CTGG	2	8	564726	564733	0 %	25 %	50 %	25 %	345302376
12460	NC_015966	GGC	2	6	564765	564770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302376
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12464	NC_015966	GCT	2	6	564999	565004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302377
12465	NC_015966	CGCA	2	8	565007	565014	25 %	0 %	25 %	50 %	345302377
12466	NC_015966	GCT	2	6	565027	565032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302377
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12471	NC_015966	CTG	2	6	565214	565219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302377
12472	NC_015966	GAG	2	6	565220	565225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302377
12473	NC_015966	GTG	2	6	565244	565249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302377
12474	NC_015966	GCCG	2	8	565276	565283	0 %	0 %	50 %	50 %	345302377
12475	NC_015966	CG	3	6	565293	565298	0 %	0 %	50 %	50 %	345302377
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12478	NC_015966	ACG	2	6	565362	565367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302377
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12481	NC_015966	GTT	2	6	565504	565509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302377
12482	NC_015966	GCT	2	6	565534	565539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302377
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