MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015966	GCTT	2	8	519247	519254	0 %	50 %	25 %	25 %	345302345
11502	NC_015966	GGC	2	6	519292	519297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302346
11503	NC_015966	GCG	2	6	519405	519410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302346
11504	NC_015966	CGAC	2	8	519418	519425	25 %	0 %	25 %	50 %	345302346
11505	NC_015966	GAC	2	6	519434	519439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302346
11506	NC_015966	TCG	2	6	519447	519452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302346
11507	NC_015966	GTG	2	6	519470	519475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302346
11508	NC_015966	CGAC	2	8	519495	519502	25 %	0 %	25 %	50 %	345302346
11509	NC_015966	TACCTG	2	12	519518	519529	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345302346
11510	NC_015966	GAA	2	6	519536	519541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302346
11511	NC_015966	CGG	2	6	519544	519549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302346
11512	NC_015966	GC	3	6	519593	519598	0 %	0 %	50 %	50 %	345302346
11513	NC_015966	GAC	2	6	519619	519624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302346
11514	NC_015966	GTG	2	6	519713	519718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302346
11515	NC_015966	TGG	2	6	519774	519779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302346
11516	NC_015966	TGG	2	6	519849	519854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302346
11517	NC_015966	TAC	2	6	519956	519961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302346
11518	NC_015966	ACTGG	2	10	520013	520022	20 %	20 %	40 %	20 %	345302347
11519	NC_015966	GGC	2	6	520031	520036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302347
11520	NC_015966	TGG	2	6	520065	520070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302347
11521	NC_015966	CGC	2	6	520077	520082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302347
11522	NC_015966	ACC	3	9	520089	520097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302347
11523	NC_015966	ATT	2	6	520099	520104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345302347
11524	NC_015966	GCG	2	6	520198	520203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302347
11525	NC_015966	TAC	2	6	520284	520289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302347
11526	NC_015966	GCG	2	6	520325	520330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302347
11527	NC_015966	CG	4	8	520341	520348	0 %	0 %	50 %	50 %	345302347
11528	NC_015966	GCT	2	6	520436	520441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302347
11529	NC_015966	TGGG	2	8	520476	520483	0 %	25 %	75 %	0 %	345302347
11530	NC_015966	G	7	7	520526	520532	0 %	0 %	100 %	0 %	345302347
11531	NC_015966	GGT	2	6	520541	520546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302347
11532	NC_015966	GTT	2	6	520571	520576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302347
11533	NC_015966	GT	3	6	520588	520593	0 %	50 %	50 %	0 %	345302347
11534	NC_015966	TCA	2	6	520594	520599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302347
11535	NC_015966	G	6	6	520622	520627	0 %	0 %	100 %	0 %	345302347
11536	NC_015966	GC	3	6	520650	520655	0 %	0 %	50 %	50 %	345302347
11537	NC_015966	TGA	2	6	520720	520725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302347
11538	NC_015966	GGC	2	6	520790	520795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302347
11539	NC_015966	GC	3	6	520822	520827	0 %	0 %	50 %	50 %	345302347
11540	NC_015966	GAT	2	6	520880	520885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302347
11541	NC_015966	GACG	2	8	520925	520932	25 %	0 %	50 %	25 %	345302347
11542	NC_015966	TGG	2	6	520972	520977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302347
11543	NC_015966	GTT	2	6	520982	520987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302347
11544	NC_015966	TGG	2	6	521008	521013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302347
11545	NC_015966	G	6	6	521016	521021	0 %	0 %	100 %	0 %	345302347
11546	NC_015966	GTC	2	6	521039	521044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302347
11547	NC_015966	GTC	2	6	521048	521053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302347
11548	NC_015966	CGG	2	6	521155	521160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302347
11549	NC_015966	TGG	3	9	521161	521169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302347
11550	NC_015966	GCC	2	6	521264	521269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302347
11551	NC_015966	CGG	2	6	521275	521280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302347
11552	NC_015966	CTG	2	6	521286	521291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302347
11553	NC_015966	GTG	2	6	521490	521495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302347
11554	NC_015966	GT	3	6	521497	521502	0 %	50 %	50 %	0 %	345302347
11555	NC_015966	GTT	2	6	521504	521509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302347
11556	NC_015966	GCC	2	6	521519	521524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302347
11557	NC_015966	GGA	2	6	521525	521530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302347
11558	NC_015966	CGG	2	6	521563	521568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302347
11559	NC_015966	GGT	3	9	521621	521629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302347
11560	NC_015966	CGATT	2	10	521782	521791	20 %	40 %	20 %	20 %	345302348
11561	NC_015966	GCG	2	6	521850	521855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302348
11562	NC_015966	GCT	2	6	521972	521977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302348
11563	NC_015966	GGA	2	6	522005	522010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302348
11564	NC_015966	ACG	2	6	522087	522092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302348
11565	NC_015966	GGC	2	6	522152	522157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302348
11566	NC_015966	ACGT	2	8	522198	522205	25 %	25 %	25 %	25 %	345302348
11567	NC_015966	GGC	2	6	522248	522253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302348
11568	NC_015966	GACG	2	8	522329	522336	25 %	0 %	50 %	25 %	345302348
11569	NC_015966	GC	4	8	522358	522365	0 %	0 %	50 %	50 %	345302348
11570	NC_015966	GAC	2	6	522399	522404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302348
11571	NC_015966	GCG	2	6	522429	522434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302348
11572	NC_015966	ATC	2	6	522474	522479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302348
11573	NC_015966	GCAC	2	8	522484	522491	25 %	0 %	25 %	50 %	345302348
11574	NC_015966	CGCC	2	8	522523	522530	0 %	0 %	25 %	75 %	345302348
11575	NC_015966	CGA	2	6	522554	522559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302348
11576	NC_015966	GGA	2	6	522617	522622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302348
11577	NC_015966	GCA	2	6	522659	522664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302348
11578	NC_015966	GC	3	6	522689	522694	0 %	0 %	50 %	50 %	345302348
11579	NC_015966	CCG	2	6	522715	522720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302348
11580	NC_015966	GCTG	2	8	522739	522746	0 %	25 %	50 %	25 %	345302348
11581	NC_015966	CGG	2	6	522750	522755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302348
11582	NC_015966	CGG	2	6	522824	522829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302348
11583	NC_015966	GCC	2	6	522849	522854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302348
11584	NC_015966	CGG	2	6	522872	522877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302348
11585	NC_015966	GGC	2	6	522951	522956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302348
11586	NC_015966	GGC	2	6	522989	522994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302348
11587	NC_015966	CA	3	6	523121	523126	50 %	0 %	0 %	50 %	345302348
11588	NC_015966	GGA	2	6	523145	523150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302348
11589	NC_015966	TG	3	6	523189	523194	0 %	50 %	50 %	0 %	345302348
11590	NC_015966	GTG	3	9	523206	523214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302348
11591	NC_015966	CTG	2	6	523407	523412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302348
11592	NC_015966	GGC	2	6	523442	523447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302348
11593	NC_015966	CG	3	6	523480	523485	0 %	0 %	50 %	50 %	345302348
11594	NC_015966	AGC	2	6	523516	523521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302348
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11596	NC_015966	CCG	2	6	523551	523556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302348
11597	NC_015966	GCT	2	6	523730	523735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302348
11598	NC_015966	TTC	2	6	523810	523815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302349
11599	NC_015966	GCG	2	6	523849	523854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302349
11600	NC_015966	GGA	2	6	524100	524105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302349
11601	NC_015966	GGC	2	6	524157	524162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302349
11602	NC_015966	CGA	2	6	524205	524210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302349
11603	NC_015966	GTC	2	6	524214	524219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302349
11604	NC_015966	GGT	2	6	524244	524249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302349
11605	NC_015966	GCC	2	6	524290	524295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302349
11606	NC_015966	GGC	2	6	524325	524330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302349
11607	NC_015966	CCA	2	6	524351	524356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302349
11608	NC_015966	ATG	2	6	524371	524376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302349
11609	NC_015966	G	6	6	524972	524977	0 %	0 %	100 %	0 %	345302350
11610	NC_015966	CTG	2	6	524978	524983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302350
11611	NC_015966	GACG	2	8	525074	525081	25 %	0 %	50 %	25 %	345302350
11612	NC_015966	GAAGTC	2	12	525122	525133	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345302350
11613	NC_015966	ATC	2	6	525149	525154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302350
11614	NC_015966	GGT	2	6	525256	525261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302350
11615	NC_015966	CGG	2	6	525283	525288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302350
11616	NC_015966	CGCT	2	8	525289	525296	0 %	25 %	25 %	50 %	345302350
11617	NC_015966	GGC	2	6	525325	525330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302350
11618	NC_015966	ACC	2	6	525345	525350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302350
11619	NC_015966	AGCCG	2	10	525391	525400	20 %	0 %	40 %	40 %	345302350
11620	NC_015966	TACG	2	8	525433	525440	25 %	25 %	25 %	25 %	345302350
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11980	NC_015966	ACG	2	6	543162	543167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302360
11981	NC_015966	GTG	2	6	543185	543190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302360
11982	NC_015966	TGG	2	6	543281	543286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302360
11983	NC_015966	TAG	2	6	543294	543299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302360
11984	NC_015966	CGCCCG	2	12	543547	543558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302360
11985	NC_015966	AG	3	6	543622	543627	50 %	0 %	50 %	0 %	345302360
11986	NC_015966	TGG	2	6	543711	543716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302360
11987	NC_015966	ACG	2	6	543795	543800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302360
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11990	NC_015966	CGATGG	2	12	543880	543891	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345302360
11991	NC_015966	GCT	2	6	543907	543912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302360
11992	NC_015966	GGAC	2	8	543916	543923	25 %	0 %	50 %	25 %	345302360
11993	NC_015966	GTACC	2	10	543973	543982	20 %	20 %	20 %	40 %	345302360
11994	NC_015966	GTC	2	6	543999	544004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302360
11995	NC_015966	CTAT	2	8	544087	544094	25 %	50 %	0 %	25 %	345302360
11996	NC_015966	CCAT	2	8	544204	544211	25 %	25 %	0 %	50 %	345302360
11997	NC_015966	CTG	2	6	544238	544243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302361
11998	NC_015966	CTG	3	9	544260	544268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302361
11999	NC_015966	GCCTTC	2	12	544335	544346	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	345302361
12000	NC_015966	CCG	2	6	544347	544352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302361

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