MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015966	CAG	2	6	498221	498226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302327
11002	NC_015966	GGC	2	6	498250	498255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302327
11003	NC_015966	GCC	2	6	498261	498266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302327
11004	NC_015966	TCG	2	6	498273	498278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302327
11005	NC_015966	GCC	2	6	498329	498334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302327
11006	NC_015966	CGA	2	6	498361	498366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302327
11007	NC_015966	ATC	2	6	498506	498511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302327
11008	NC_015966	CGG	2	6	498512	498517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302327
11009	NC_015966	AGCG	2	8	498548	498555	25 %	0 %	50 %	25 %	345302327
11010	NC_015966	CGGC	2	8	498569	498576	0 %	0 %	50 %	50 %	345302327
11011	NC_015966	GAT	2	6	498625	498630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302327
11012	NC_015966	AGC	2	6	498686	498691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302327
11013	NC_015966	CCG	2	6	498724	498729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302327
11014	NC_015966	CGG	2	6	498751	498756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302327
11015	NC_015966	GCT	2	6	498808	498813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302327
11016	NC_015966	GCC	2	6	498833	498838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302327
11017	NC_015966	TGC	2	6	498849	498854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302327
11018	NC_015966	CGC	2	6	498954	498959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302327
11019	NC_015966	GCT	2	6	498991	498996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302327
11020	NC_015966	ACT	2	6	499053	499058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302327
11021	NC_015966	GCG	2	6	499157	499162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302327
11022	NC_015966	CCG	2	6	499235	499240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302327
11023	NC_015966	CGA	2	6	499251	499256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302327
11024	NC_015966	TCA	2	6	499293	499298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302327
11025	NC_015966	TTC	2	6	499317	499322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302327
11026	NC_015966	CGA	2	6	499357	499362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302327
11027	NC_015966	CG	4	8	499394	499401	0 %	0 %	50 %	50 %	345302327
11028	NC_015966	CCAGCC	2	12	499464	499475	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	345302327
11029	NC_015966	GAA	2	6	499496	499501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302327
11030	NC_015966	GGA	2	6	499525	499530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302327
11031	NC_015966	CTT	2	6	499539	499544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302327
11032	NC_015966	GAG	2	6	499648	499653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302328
11033	NC_015966	CGA	2	6	499704	499709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302328
11034	NC_015966	CAT	2	6	499716	499721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302328
11035	NC_015966	TGA	2	6	499745	499750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302328
11036	NC_015966	CTG	2	6	499753	499758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302328
11037	NC_015966	GCG	2	6	499835	499840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302328
11038	NC_015966	CGCC	2	8	499869	499876	0 %	0 %	25 %	75 %	345302328
11039	NC_015966	TGA	2	6	499889	499894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302328
11040	NC_015966	ACA	2	6	500012	500017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302328
11041	NC_015966	CCG	2	6	500098	500103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302329
11042	NC_015966	CGA	2	6	500132	500137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302329
11043	NC_015966	CTCGT	2	10	500176	500185	0 %	40 %	20 %	40 %	345302329
11044	NC_015966	CTG	2	6	500215	500220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302329
11045	NC_015966	ACCAGC	2	12	500324	500335	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	345302329
11046	NC_015966	CGC	2	6	500355	500360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302329
11047	NC_015966	TCT	2	6	500432	500437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302329
11048	NC_015966	ACC	2	6	500741	500746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302329
11049	NC_015966	AGA	2	6	500747	500752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302329
11050	NC_015966	GTA	2	6	500779	500784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302329
11051	NC_015966	GTC	3	9	500805	500813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302329
11052	NC_015966	GGT	2	6	500833	500838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302329
11053	NC_015966	TAG	2	6	500900	500905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302329
11054	NC_015966	GCA	2	6	500910	500915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302329
11055	NC_015966	TCG	2	6	500927	500932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302329
11056	NC_015966	ACC	2	6	500981	500986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302329
11057	NC_015966	CCG	2	6	501143	501148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302329
11058	NC_015966	AGC	3	9	501161	501169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302329
11059	NC_015966	AGC	2	6	501176	501181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302329
11060	NC_015966	GCA	2	6	501195	501200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302329
11061	NC_015966	CCA	2	6	501336	501341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302330
11062	NC_015966	CCA	2	6	501429	501434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302330
11063	NC_015966	CGC	2	6	501446	501451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302330
11064	NC_015966	ACG	2	6	501468	501473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302330
11065	NC_015966	GCC	2	6	501486	501491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302330
11066	NC_015966	CCAGC	2	10	501496	501505	20 %	0 %	20 %	60 %	345302330
11067	NC_015966	CAC	2	6	501512	501517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302330
11068	NC_015966	GCGCC	2	10	501550	501559	0 %	0 %	40 %	60 %	345302330
11069	NC_015966	TCC	2	6	501575	501580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302330
11070	NC_015966	CAC	2	6	501589	501594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302330
11071	NC_015966	GC	3	6	501640	501645	0 %	0 %	50 %	50 %	345302330
11072	NC_015966	TTCG	2	8	501661	501668	0 %	50 %	25 %	25 %	345302330
11073	NC_015966	CAG	2	6	501679	501684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302330
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11075	NC_015966	AGC	2	6	501821	501826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302330
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11078	NC_015966	GCA	2	6	502097	502102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302331
11079	NC_015966	GCA	2	6	502106	502111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302331
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11084	NC_015966	GCA	2	6	502202	502207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302331
11085	NC_015966	GCC	2	6	502222	502227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302331
11086	NC_015966	GCC	2	6	502233	502238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302331
11087	NC_015966	GGC	2	6	502274	502279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302331
11088	NC_015966	GC	3	6	502284	502289	0 %	0 %	50 %	50 %	345302331
11089	NC_015966	CGC	2	6	502300	502305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302331
11090	NC_015966	GCT	2	6	502325	502330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302331
11091	NC_015966	GCG	2	6	502353	502358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302331
11092	NC_015966	GTCGGC	2	12	502417	502428	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302331
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11101	NC_015966	GAG	2	6	502889	502894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302332
11102	NC_015966	GTG	2	6	502907	502912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302332
11103	NC_015966	GCC	2	6	502913	502918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302332
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11107	NC_015966	GT	4	8	503078	503085	0 %	50 %	50 %	0 %	345302332
11108	NC_015966	CGAC	2	8	503220	503227	25 %	0 %	25 %	50 %	345302332
11109	NC_015966	CG	3	6	503257	503262	0 %	0 %	50 %	50 %	345302332
11110	NC_015966	TTC	2	6	503264	503269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302332
11111	NC_015966	GGT	2	6	503305	503310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302332
11112	NC_015966	GC	3	6	503366	503371	0 %	0 %	50 %	50 %	345302332
11113	NC_015966	AAC	2	6	503393	503398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302332
11114	NC_015966	AGC	2	6	503412	503417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302332
11115	NC_015966	AGC	2	6	503430	503435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302332
11116	NC_015966	GCT	2	6	503491	503496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302332
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11118	NC_015966	TGA	2	6	503514	503519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302332
11119	NC_015966	CAT	2	6	503521	503526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302332
11120	NC_015966	CG	3	6	503550	503555	0 %	0 %	50 %	50 %	345302332
11121	NC_015966	CGG	2	6	503641	503646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302332
11122	NC_015966	TGC	2	6	503658	503663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302332
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11153	NC_015966	G	6	6	504895	504900	0 %	0 %	100 %	0 %	345302333
11154	NC_015966	TGG	2	6	504906	504911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302333
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11223	NC_015966	CAC	2	6	507426	507431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302337
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11225	NC_015966	GT	3	6	507544	507549	0 %	50 %	50 %	0 %	345302337
11226	NC_015966	CAG	2	6	507657	507662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302337
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11231	NC_015966	CCAG	2	8	507734	507741	25 %	0 %	25 %	50 %	345302337
11232	NC_015966	GCC	2	6	507777	507782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302337
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11475	NC_015966	GGC	2	6	518259	518264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302345
11476	NC_015966	GAA	2	6	518274	518279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302345
11477	NC_015966	GCC	2	6	518286	518291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302345
11478	NC_015966	GCG	2	6	518315	518320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302345
11479	NC_015966	CGG	2	6	518356	518361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302345
11480	NC_015966	GGC	2	6	518362	518367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302345
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11483	NC_015966	ATC	2	6	518487	518492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302345
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