MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_015966	CAGGCC	2	12	474668	474679	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345302305
10503	NC_015966	GATC	2	8	474736	474743	25 %	25 %	25 %	25 %	345302305
10504	NC_015966	CCA	2	6	474826	474831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302305
10505	NC_015966	CCT	2	6	474862	474867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302305
10506	NC_015966	CGGC	2	8	475053	475060	0 %	0 %	50 %	50 %	345302305
10507	NC_015966	TCG	2	6	475134	475139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302305
10508	NC_015966	CAG	2	6	475200	475205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302305
10509	NC_015966	CGTG	2	8	475219	475226	0 %	25 %	50 %	25 %	345302305
10510	NC_015966	CGG	2	6	475227	475232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302305
10511	NC_015966	TCG	2	6	475236	475241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302305
10512	NC_015966	GCG	2	6	475250	475255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302305
10513	NC_015966	TTC	2	6	475268	475273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302305
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10515	NC_015966	ACGGCC	2	12	475338	475349	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345302305
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10517	NC_015966	AGC	2	6	475473	475478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302305
10518	NC_015966	GTC	2	6	475514	475519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302305
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10523	NC_015966	GTC	2	6	475649	475654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302305
10524	NC_015966	GCG	2	6	475712	475717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302305
10525	NC_015966	GCA	2	6	475732	475737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302305
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10529	NC_015966	CGG	2	6	475918	475923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302305
10530	NC_015966	GGC	2	6	475933	475938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302305
10531	NC_015966	CAG	3	9	475964	475972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302305
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10533	NC_015966	TGCG	2	8	476013	476020	0 %	25 %	50 %	25 %	345302305
10534	NC_015966	GCC	2	6	476022	476027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302305
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10538	NC_015966	CGGCG	2	10	476188	476197	0 %	0 %	60 %	40 %	345302305
10539	NC_015966	GCT	2	6	476206	476211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302305
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10542	NC_015966	TTC	2	6	476315	476320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302305
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10555	NC_015966	CGG	2	6	477738	477743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302306
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10561	NC_015966	GTT	2	6	477931	477936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302307
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10591	NC_015966	CTGG	2	8	479434	479441	0 %	25 %	50 %	25 %	345302308
10592	NC_015966	CG	3	6	479504	479509	0 %	0 %	50 %	50 %	345302308
10593	NC_015966	CTAC	2	8	479514	479521	25 %	25 %	0 %	50 %	345302308
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10619	NC_015966	CTG	2	6	481381	481386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302310
10620	NC_015966	CTG	2	6	481414	481419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302310
10621	NC_015966	CT	3	6	481441	481446	0 %	50 %	0 %	50 %	345302310
10622	NC_015966	CTG	2	6	481477	481482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302310
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10624	NC_015966	CTG	2	6	481528	481533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302310
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10627	NC_015966	GTTC	2	8	481727	481734	0 %	50 %	25 %	25 %	345302311
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10731	NC_015966	TGGG	2	8	486137	486144	0 %	25 %	75 %	0 %	345302314
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10734	NC_015966	GCC	2	6	486209	486214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302314
10735	NC_015966	GGTG	2	8	486238	486245	0 %	25 %	75 %	0 %	345302314
10736	NC_015966	GGC	2	6	486265	486270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302314
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10976	NC_015966	GC	3	6	497555	497560	0 %	0 %	50 %	50 %	345302327
10977	NC_015966	GAAGCC	2	12	497579	497590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302327
10978	NC_015966	GCA	2	6	497635	497640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302327
10979	NC_015966	GGT	2	6	497647	497652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302327
10980	NC_015966	GGGC	2	8	497662	497669	0 %	0 %	75 %	25 %	345302327
10981	NC_015966	TGG	3	9	497676	497684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302327
10982	NC_015966	CCGGCA	2	12	497691	497702	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345302327
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10984	NC_015966	GAG	2	6	497759	497764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302327
10985	NC_015966	TGC	2	6	497769	497774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302327
10986	NC_015966	CGCGC	2	10	497784	497793	0 %	0 %	40 %	60 %	345302327
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10988	NC_015966	GCT	2	6	497824	497829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302327
10989	NC_015966	GACG	2	8	497831	497838	25 %	0 %	50 %	25 %	345302327
10990	NC_015966	TCTG	2	8	497874	497881	0 %	50 %	25 %	25 %	345302327
10991	NC_015966	GCT	2	6	497884	497889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302327
10992	NC_015966	CGC	2	6	497950	497955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302327
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10997	NC_015966	GCCA	2	8	498053	498060	25 %	0 %	25 %	50 %	345302327
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10999	NC_015966	ACG	2	6	498186	498191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302327
11000	NC_015966	CTG	2	6	498194	498199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302327

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