MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015966	CAGCGC	2	12	453937	453948	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345302289
10002	NC_015966	GTT	2	6	453954	453959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302289
10003	NC_015966	GCT	2	6	453960	453965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302289
10004	NC_015966	CTG	2	6	454045	454050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302289
10005	NC_015966	CAG	2	6	454060	454065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302289
10006	NC_015966	CGC	2	6	454145	454150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302289
10007	NC_015966	GGC	2	6	454182	454187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302289
10008	NC_015966	TCAGGT	2	12	454224	454235	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	345302289
10009	NC_015966	GGC	2	6	454258	454263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302289
10010	NC_015966	GGC	2	6	454270	454275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302289
10011	NC_015966	CGG	2	6	454277	454282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302289
10012	NC_015966	ATC	2	6	454294	454299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302289
10013	NC_015966	CGG	2	6	454301	454306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302289
10014	NC_015966	CGG	2	6	454328	454333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302289
10015	NC_015966	CCG	2	6	454363	454368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302289
10016	NC_015966	GC	3	6	454388	454393	0 %	0 %	50 %	50 %	345302289
10017	NC_015966	TTC	2	6	454399	454404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302289
10018	NC_015966	GC	3	6	454415	454420	0 %	0 %	50 %	50 %	345302289
10019	NC_015966	TCG	2	6	454424	454429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302289
10020	NC_015966	CGG	2	6	454449	454454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302289
10021	NC_015966	AGA	2	6	454464	454469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302289
10022	NC_015966	GCC	2	6	454471	454476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302289
10023	NC_015966	GGCGT	2	10	454492	454501	0 %	20 %	60 %	20 %	345302289
10024	NC_015966	GC	3	6	454711	454716	0 %	0 %	50 %	50 %	345302290
10025	NC_015966	GACG	2	8	454756	454763	25 %	0 %	50 %	25 %	345302290
10026	NC_015966	GGT	2	6	454785	454790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302290
10027	NC_015966	GAA	2	6	454813	454818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302290
10028	NC_015966	GGCC	2	8	454819	454826	0 %	0 %	50 %	50 %	345302290
10029	NC_015966	TGC	2	6	454838	454843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302290
10030	NC_015966	CGG	2	6	454887	454892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302290
10031	NC_015966	GGC	2	6	454911	454916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302290
10032	NC_015966	CAG	2	6	454957	454962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302290
10033	NC_015966	GTG	2	6	454978	454983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302290
10034	NC_015966	GCA	2	6	455010	455015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302290
10035	NC_015966	GCC	2	6	455044	455049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302290
10036	NC_015966	ACG	2	6	455075	455080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302290
10037	NC_015966	ACG	2	6	455084	455089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302290
10038	NC_015966	CGA	2	6	455103	455108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302290
10039	NC_015966	AGG	2	6	455111	455116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302290
10040	NC_015966	AGC	2	6	455141	455146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302290
10041	NC_015966	CTC	2	6	455152	455157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302290
10042	NC_015966	GCT	2	6	455172	455177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302290
10043	NC_015966	GCC	2	6	455190	455195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302290
10044	NC_015966	GCT	2	6	455354	455359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302291
10045	NC_015966	CGG	2	6	455381	455386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302291
10046	NC_015966	CAT	2	6	455501	455506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302291
10047	NC_015966	GGT	2	6	455528	455533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302291
10048	NC_015966	CGA	2	6	455546	455551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302291
10049	NC_015966	GAT	2	6	455636	455641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302291
10050	NC_015966	CCG	2	6	455642	455647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302291
10051	NC_015966	GGC	2	6	455653	455658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302291
10052	NC_015966	TGG	2	6	455692	455697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302291
10053	NC_015966	CGAT	2	8	455716	455723	25 %	25 %	25 %	25 %	345302291
10054	NC_015966	CAA	2	6	455792	455797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302291
10055	NC_015966	AAC	2	6	455823	455828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302291
10056	NC_015966	CGG	3	9	455860	455868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302291
10057	NC_015966	CTT	2	6	455939	455944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302291
10058	NC_015966	CCATC	2	10	455972	455981	20 %	20 %	0 %	60 %	345302291
10059	NC_015966	CAT	2	6	455993	455998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302291
10060	NC_015966	ATC	2	6	456030	456035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302291
10061	NC_015966	GCGCAC	2	12	456050	456061	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345302291
10062	NC_015966	GC	3	6	456063	456068	0 %	0 %	50 %	50 %	345302291
10063	NC_015966	CCGG	2	8	456092	456099	0 %	0 %	50 %	50 %	345302291
10064	NC_015966	GCC	2	6	456318	456323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302291
10065	NC_015966	CAG	2	6	456363	456368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302291
10066	NC_015966	CGG	2	6	456379	456384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302291
10067	NC_015966	GGC	2	6	456430	456435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302291
10068	NC_015966	CGG	3	9	456476	456484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302291
10069	NC_015966	GTG	2	6	456531	456536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302291
10070	NC_015966	GGA	2	6	456563	456568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302291
10071	NC_015966	GTGC	2	8	456659	456666	0 %	25 %	50 %	25 %	345302291
10072	NC_015966	TCA	2	6	456667	456672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302291
10073	NC_015966	TGG	3	9	456742	456750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302291
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10075	NC_015966	GCG	2	6	456848	456853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302291
10076	NC_015966	TCG	2	6	456916	456921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302291
10077	NC_015966	GCAC	2	8	456960	456967	25 %	0 %	25 %	50 %	345302291
10078	NC_015966	GGA	2	6	456971	456976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302291
10079	NC_015966	GGC	2	6	456991	456996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302291
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10081	NC_015966	GGC	2	6	457168	457173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302291
10082	NC_015966	CGGG	2	8	457178	457185	0 %	0 %	75 %	25 %	345302291
10083	NC_015966	GTC	2	6	457188	457193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302291
10084	NC_015966	CAG	2	6	457206	457211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302291
10085	NC_015966	CA	3	6	457281	457286	50 %	0 %	0 %	50 %	345302291
10086	NC_015966	GAG	2	6	457308	457313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302291
10087	NC_015966	CAC	2	6	457325	457330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302291
10088	NC_015966	GC	3	6	457384	457389	0 %	0 %	50 %	50 %	345302291
10089	NC_015966	CGTGC	2	10	457416	457425	0 %	20 %	40 %	40 %	345302291
10090	NC_015966	GC	3	6	457431	457436	0 %	0 %	50 %	50 %	345302291
10091	NC_015966	GTG	2	6	457506	457511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302291
10092	NC_015966	CTG	3	9	457633	457641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302292
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10097	NC_015966	GGCT	2	8	457756	457763	0 %	25 %	50 %	25 %	345302292
10098	NC_015966	GGT	2	6	457764	457769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302292
10099	NC_015966	TGC	2	6	457823	457828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302292
10100	NC_015966	CCT	2	6	457904	457909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302292
10101	NC_015966	GCC	2	6	457975	457980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302292
10102	NC_015966	CAA	2	6	457992	457997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302292
10103	NC_015966	CAC	2	6	458031	458036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302292
10104	NC_015966	CGG	2	6	458169	458174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302292
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10106	NC_015966	C	6	6	458278	458283	0 %	0 %	0 %	100 %	345302292
10107	NC_015966	GCT	2	6	458305	458310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302292
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10112	NC_015966	CTG	2	6	458409	458414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302293
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10114	NC_015966	GCT	2	6	458477	458482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302293
10115	NC_015966	TGG	2	6	458485	458490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302293
10116	NC_015966	GTG	2	6	458511	458516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302293
10117	NC_015966	GCG	3	9	458528	458536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302293
10118	NC_015966	CGT	2	6	458726	458731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302294
10119	NC_015966	CTA	2	6	458768	458773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302294
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10221	NC_015966	TGGG	2	8	462212	462219	0 %	25 %	75 %	0 %	345302296
10222	NC_015966	G	6	6	462217	462222	0 %	0 %	100 %	0 %	345302296
10223	NC_015966	TTCA	2	8	462269	462276	25 %	50 %	0 %	25 %	345302296
10224	NC_015966	TTC	2	6	462290	462295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302296
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10230	NC_015966	ATC	2	6	462587	462592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302296
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10233	NC_015966	ACG	2	6	462648	462653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302296
10234	NC_015966	TGC	2	6	462699	462704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302296
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10236	NC_015966	ACA	2	6	462738	462743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302296
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10240	NC_015966	GC	4	8	462907	462914	0 %	0 %	50 %	50 %	345302296
10241	NC_015966	GTGCTC	2	12	462932	462943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302296
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10342	NC_015966	GAG	3	9	467587	467595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302301
10343	NC_015966	CTG	2	6	467599	467604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302301
10344	NC_015966	GGC	2	6	467610	467615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302301
10345	NC_015966	GCTGGT	2	12	467616	467627	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345302301
10346	NC_015966	TTTC	2	8	467692	467699	0 %	75 %	0 %	25 %	345302301
10347	NC_015966	TGGC	2	8	467701	467708	0 %	25 %	50 %	25 %	345302301
10348	NC_015966	GGC	3	9	467724	467732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302301
10349	NC_015966	GCG	2	6	467928	467933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302301
10350	NC_015966	ACA	2	6	467993	467998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302301
10351	NC_015966	CG	3	6	468000	468005	0 %	0 %	50 %	50 %	345302301
10352	NC_015966	GGC	2	6	468027	468032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302301
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10354	NC_015966	GGC	2	6	468132	468137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302301
10355	NC_015966	GCCC	2	8	468216	468223	0 %	0 %	25 %	75 %	345302301
10356	NC_015966	CGG	2	6	468246	468251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302301
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10358	NC_015966	GCT	2	6	468342	468347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302301
10359	NC_015966	GGA	2	6	468348	468353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302301
10360	NC_015966	CTG	2	6	468373	468378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302301
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10390	NC_015966	GATC	2	8	469526	469533	25 %	25 %	25 %	25 %	345302302
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10471	NC_015966	GCA	2	6	473226	473231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302304
10472	NC_015966	TCG	2	6	473312	473317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302304
10473	NC_015966	CGA	2	6	473331	473336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302304
10474	NC_015966	GCGT	2	8	473348	473355	0 %	25 %	50 %	25 %	345302304
10475	NC_015966	GCA	2	6	473382	473387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302304
10476	NC_015966	GGC	2	6	473394	473399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302304
10477	NC_015966	TGT	2	6	473439	473444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302304
10478	NC_015966	CCA	2	6	473448	473453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302304
10479	NC_015966	TCG	3	9	473504	473512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302304
10480	NC_015966	CCCAGG	2	12	473604	473615	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345302304
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10482	NC_015966	CAT	2	6	473716	473721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302304
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