MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_015966	GTG	2	6	406629	406634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302240
9002	NC_015966	ACGC	2	8	406687	406694	25 %	0 %	25 %	50 %	345302240
9003	NC_015966	CGGCCA	2	12	406731	406742	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345302240
9004	NC_015966	GCC	2	6	406795	406800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302240
9005	NC_015966	TGGCCG	2	12	406959	406970	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302241
9006	NC_015966	TGC	2	6	407007	407012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302241
9007	NC_015966	GCT	2	6	407041	407046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302241
9008	NC_015966	TGG	2	6	407052	407057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302241
9009	NC_015966	GGT	2	6	407104	407109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302241
9010	NC_015966	GCC	2	6	407119	407124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302241
9011	NC_015966	CGT	2	6	407243	407248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302241
9012	NC_015966	GCGG	2	8	407251	407258	0 %	0 %	75 %	25 %	345302241
9013	NC_015966	CTG	2	6	407285	407290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302241
9014	NC_015966	CGG	2	6	407294	407299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302241
9015	NC_015966	CGGG	2	8	407313	407320	0 %	0 %	75 %	25 %	345302241
9016	NC_015966	CAGCGC	2	12	407321	407332	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345302241
9017	NC_015966	GC	3	6	407344	407349	0 %	0 %	50 %	50 %	345302241
9018	NC_015966	CGTG	2	8	407353	407360	0 %	25 %	50 %	25 %	345302241
9019	NC_015966	CG	3	6	407364	407369	0 %	0 %	50 %	50 %	345302241
9020	NC_015966	GTG	2	6	407522	407527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302241
9021	NC_015966	GCA	2	6	407545	407550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302241
9022	NC_015966	CGC	2	6	407559	407564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302241
9023	NC_015966	CCGG	2	8	407578	407585	0 %	0 %	50 %	50 %	345302241
9024	NC_015966	GCCCG	2	10	407726	407735	0 %	0 %	40 %	60 %	345302241
9025	NC_015966	GCTG	2	8	407776	407783	0 %	25 %	50 %	25 %	345302241
9026	NC_015966	CGA	2	6	407788	407793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302241
9027	NC_015966	CCA	2	6	407796	407801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302241
9028	NC_015966	GAC	2	6	407869	407874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302241
9029	NC_015966	CGT	2	6	407875	407880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302241
9030	NC_015966	GCC	2	6	407894	407899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302241
9031	NC_015966	CCCG	2	8	407942	407949	0 %	0 %	25 %	75 %	345302241
9032	NC_015966	GCC	2	6	407999	408004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302241
9033	NC_015966	CTC	2	6	408031	408036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302242
9034	NC_015966	GCG	2	6	408061	408066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302242
9035	NC_015966	CGT	2	6	408077	408082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302242
9036	NC_015966	GCA	2	6	408114	408119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302242
9037	NC_015966	CGG	2	6	408149	408154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302242
9038	NC_015966	TCG	2	6	408155	408160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302242
9039	NC_015966	GGCG	2	8	408161	408168	0 %	0 %	75 %	25 %	345302242
9040	NC_015966	GCCG	2	8	408316	408323	0 %	0 %	50 %	50 %	345302242
9041	NC_015966	GATG	2	8	408348	408355	25 %	25 %	50 %	0 %	345302242
9042	NC_015966	CGG	2	6	408358	408363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302242
9043	NC_015966	GCA	2	6	408390	408395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302242
9044	NC_015966	GCC	2	6	408413	408418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302242
9045	NC_015966	GGC	2	6	408481	408486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302242
9046	NC_015966	CAC	2	6	408493	408498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302242
9047	NC_015966	CGC	2	6	408551	408556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302242
9048	NC_015966	CAA	2	6	408607	408612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302242
9049	NC_015966	GCC	2	6	408635	408640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302242
9050	NC_015966	CAG	2	6	408658	408663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302242
9051	NC_015966	CCAGG	2	10	408741	408750	20 %	0 %	40 %	40 %	345302243
9052	NC_015966	CCA	2	6	408812	408817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302243
9053	NC_015966	CGG	2	6	408920	408925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302243
9054	NC_015966	GACC	2	8	408944	408951	25 %	0 %	25 %	50 %	345302243
9055	NC_015966	ACC	2	6	408957	408962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302243
9056	NC_015966	ACC	2	6	409018	409023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302243
9057	NC_015966	CGG	2	6	409048	409053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302243
9058	NC_015966	CAC	2	6	409101	409106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302243
9059	NC_015966	CAG	2	6	409110	409115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302243
9060	NC_015966	AGC	2	6	409198	409203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302243
9061	NC_015966	CAG	3	9	409242	409250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302243
9062	NC_015966	GACG	2	8	409261	409268	25 %	0 %	50 %	25 %	345302243
9063	NC_015966	CG	3	6	409275	409280	0 %	0 %	50 %	50 %	345302243
9064	NC_015966	GGC	2	6	409284	409289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302243
9065	NC_015966	TGC	2	6	409491	409496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302244
9066	NC_015966	GAC	2	6	409590	409595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302244
9067	NC_015966	TTC	2	6	409632	409637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302244
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9069	NC_015966	CGA	2	6	409846	409851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302244
9070	NC_015966	TCA	2	6	409905	409910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302244
9071	NC_015966	TGG	2	6	409955	409960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302244
9072	NC_015966	CAGC	2	8	410014	410021	25 %	0 %	25 %	50 %	345302244
9073	NC_015966	GGT	2	6	410064	410069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302244
9074	NC_015966	TGC	2	6	410217	410222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302244
9075	NC_015966	CGA	2	6	410230	410235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302244
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9078	NC_015966	TGG	2	6	410336	410341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302244
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9081	NC_015966	TCGC	2	8	410553	410560	0 %	25 %	25 %	50 %	345302244
9082	NC_015966	GGA	2	6	410638	410643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302244
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9085	NC_015966	CGA	2	6	410725	410730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302244
9086	NC_015966	CAT	2	6	410780	410785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302244
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9088	NC_015966	CGG	2	6	410932	410937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302244
9089	NC_015966	ACG	2	6	410954	410959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302244
9090	NC_015966	GCT	2	6	410977	410982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302244
9091	NC_015966	CAA	2	6	411040	411045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302244
9092	NC_015966	ACG	2	6	411056	411061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302244
9093	NC_015966	AGC	2	6	411069	411074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302244
9094	NC_015966	GGC	2	6	411112	411117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302244
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9096	NC_015966	CG	3	6	411195	411200	0 %	0 %	50 %	50 %	345302244
9097	NC_015966	CGA	2	6	411256	411261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302244
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9102	NC_015966	AGA	2	6	411493	411498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302244
9103	NC_015966	GGTG	2	8	411588	411595	0 %	25 %	75 %	0 %	345302245
9104	NC_015966	GCT	3	9	411610	411618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302245
9105	NC_015966	CGG	2	6	411619	411624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302245
9106	NC_015966	GGC	2	6	411789	411794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302245
9107	NC_015966	CGA	2	6	411826	411831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302245
9108	NC_015966	CGA	2	6	411838	411843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302245
9109	NC_015966	AGC	3	9	411867	411875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302245
9110	NC_015966	ACT	2	6	411882	411887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302245
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9112	NC_015966	GAG	2	6	411938	411943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302245
9113	NC_015966	CGA	2	6	412231	412236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302246
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9115	NC_015966	CGA	2	6	412255	412260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302246
9116	NC_015966	GC	3	6	412301	412306	0 %	0 %	50 %	50 %	345302246
9117	NC_015966	GC	3	6	412322	412327	0 %	0 %	50 %	50 %	345302246
9118	NC_015966	G	6	6	412332	412337	0 %	0 %	100 %	0 %	345302246
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9120	NC_015966	GAC	2	6	412421	412426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302246
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9480	NC_015966	CGCC	2	8	429823	429830	0 %	0 %	25 %	75 %	345302264
9481	NC_015966	CGC	2	6	429882	429887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302264
9482	NC_015966	CAC	2	6	429890	429895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302264
9483	NC_015966	A	6	6	429991	429996	100 %	0 %	0 %	0 %	345302265
9484	NC_015966	CTG	2	6	430005	430010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302265
9485	NC_015966	A	6	6	430017	430022	100 %	0 %	0 %	0 %	345302265
9486	NC_015966	GAGCA	2	10	430047	430056	40 %	0 %	40 %	20 %	345302265
9487	NC_015966	AGG	2	6	430091	430096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302265
9488	NC_015966	ATC	2	6	430176	430181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302265
9489	NC_015966	AAC	2	6	430197	430202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302265
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