MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_015966	CAG	2	6	360863	360868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302207
8002	NC_015966	TGG	2	6	360894	360899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302207
8003	NC_015966	GGC	2	6	360911	360916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302207
8004	NC_015966	CCA	3	9	360917	360925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302207
8005	NC_015966	GGTTCG	2	12	361408	361419	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345302208
8006	NC_015966	CGC	2	6	361433	361438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302208
8007	NC_015966	GC	3	6	361473	361478	0 %	0 %	50 %	50 %	345302208
8008	NC_015966	GCA	2	6	361502	361507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302208
8009	NC_015966	CTC	2	6	361527	361532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302208
8010	NC_015966	AGA	2	6	361538	361543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302208
8011	NC_015966	GAA	2	6	361572	361577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302208
8012	NC_015966	ATG	2	6	361588	361593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302208
8013	NC_015966	TCGTC	2	10	361610	361619	0 %	40 %	20 %	40 %	345302208
8014	NC_015966	GTC	2	6	361632	361637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302208
8015	NC_015966	ACC	2	6	361643	361648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302208
8016	NC_015966	TCG	2	6	361711	361716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302208
8017	NC_015966	GAA	2	6	361785	361790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302208
8018	NC_015966	CAT	2	6	361796	361801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302208
8019	NC_015966	CGA	2	6	361829	361834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302208
8020	NC_015966	GGC	2	6	361836	361841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302208
8021	NC_015966	GGT	2	6	361847	361852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302208
8022	NC_015966	CGG	2	6	361861	361866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302208
8023	NC_015966	TCGA	2	8	361963	361970	25 %	25 %	25 %	25 %	345302208
8024	NC_015966	CTT	2	6	362000	362005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302208
8025	NC_015966	GTT	2	6	362049	362054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302208
8026	NC_015966	CAG	2	6	362058	362063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302208
8027	NC_015966	GCG	2	6	362082	362087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302208
8028	NC_015966	GGT	2	6	362102	362107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302208
8029	NC_015966	GCC	2	6	362109	362114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302208
8030	NC_015966	CGTCGC	2	12	362126	362137	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345302208
8031	NC_015966	TGA	2	6	362141	362146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302208
8032	NC_015966	CCGG	2	8	362162	362169	0 %	0 %	50 %	50 %	345302208
8033	NC_015966	GTA	2	6	362238	362243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302208
8034	NC_015966	AGC	2	6	362258	362263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302208
8035	NC_015966	TGA	2	6	362273	362278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302208
8036	NC_015966	GCA	2	6	362312	362317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302208
8037	NC_015966	GCCG	2	8	362421	362428	0 %	0 %	50 %	50 %	345302208
8038	NC_015966	CGG	2	6	362439	362444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302208
8039	NC_015966	GGC	2	6	362464	362469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302208
8040	NC_015966	GGC	2	6	362512	362517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302208
8041	NC_015966	CGG	2	6	362535	362540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302208
8042	NC_015966	CG	3	6	362558	362563	0 %	0 %	50 %	50 %	345302208
8043	NC_015966	TTC	2	6	362571	362576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302208
8044	NC_015966	CTC	2	6	362649	362654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302209
8045	NC_015966	TC	3	6	362657	362662	0 %	50 %	0 %	50 %	345302209
8046	NC_015966	GTT	2	6	362748	362753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302209
8047	NC_015966	CAC	2	6	362763	362768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302209
8048	NC_015966	TGG	2	6	362773	362778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302209
8049	NC_015966	GGC	2	6	362806	362811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302209
8050	NC_015966	CG	3	6	362894	362899	0 %	0 %	50 %	50 %	345302209
8051	NC_015966	AGC	2	6	362917	362922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302209
8052	NC_015966	TGG	2	6	363013	363018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302209
8053	NC_015966	GCC	2	6	363066	363071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302209
8054	NC_015966	CGG	2	6	363136	363141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302209
8055	NC_015966	ACTTC	2	10	363194	363203	20 %	40 %	0 %	40 %	345302209
8056	NC_015966	AGG	2	6	363207	363212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302209
8057	NC_015966	CAG	2	6	363273	363278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302209
8058	NC_015966	GCC	2	6	363355	363360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302209
8059	NC_015966	GGC	2	6	363386	363391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302209
8060	NC_015966	GCTCT	2	10	363414	363423	0 %	40 %	20 %	40 %	345302209
8061	NC_015966	TGG	2	6	363428	363433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302209
8062	NC_015966	CCG	2	6	363451	363456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302209
8063	NC_015966	CAC	2	6	363471	363476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302209
8064	NC_015966	TCA	2	6	363491	363496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302209
8065	NC_015966	TGG	2	6	363542	363547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302209
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8067	NC_015966	GCGCC	2	10	363584	363593	0 %	0 %	40 %	60 %	345302209
8068	NC_015966	TCA	2	6	363626	363631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302209
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8070	NC_015966	TGG	2	6	363721	363726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302209
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8072	NC_015966	GCCG	2	8	363799	363806	0 %	0 %	50 %	50 %	345302209
8073	NC_015966	ACGG	2	8	363816	363823	25 %	0 %	50 %	25 %	345302209
8074	NC_015966	GCCA	2	8	363916	363923	25 %	0 %	25 %	50 %	345302209
8075	NC_015966	CGAG	2	8	364082	364089	25 %	0 %	50 %	25 %	345302209
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8081	NC_015966	GCCG	2	8	364308	364315	0 %	0 %	50 %	50 %	345302209
8082	NC_015966	GC	3	6	364316	364321	0 %	0 %	50 %	50 %	345302209
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8089	NC_015966	TCA	2	6	364870	364875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302210
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8109	NC_015966	GGT	2	6	365711	365716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302212
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8242	NC_015966	CGT	2	6	371952	371957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302217
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8484	NC_015966	GCA	2	6	383492	383497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302225
8485	NC_015966	CGG	2	6	383565	383570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302225
8486	NC_015966	CAC	2	6	383601	383606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302225
8487	NC_015966	CCA	2	6	383639	383644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302225
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8490	NC_015966	CAG	2	6	383745	383750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302225
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