MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_015966	GCT	2	6	315026	315031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302175
7002	NC_015966	CAC	2	6	315086	315091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302175
7003	NC_015966	TGC	2	6	315106	315111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302175
7004	NC_015966	CTG	2	6	315201	315206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302175
7005	NC_015966	TCT	2	6	315214	315219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302175
7006	NC_015966	TCA	2	6	315313	315318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302175
7007	NC_015966	GCC	2	6	315365	315370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302175
7008	NC_015966	GCG	2	6	315438	315443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302175
7009	NC_015966	GGC	2	6	315470	315475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302175
7010	NC_015966	GGC	2	6	315542	315547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302175
7011	NC_015966	GCT	2	6	315602	315607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302175
7012	NC_015966	TTCA	2	8	315615	315622	25 %	50 %	0 %	25 %	345302175
7013	NC_015966	GCT	2	6	315638	315643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302175
7014	NC_015966	CAT	2	6	315690	315695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302175
7015	NC_015966	CGC	2	6	315859	315864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302176
7016	NC_015966	TTG	2	6	315882	315887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302176
7017	NC_015966	GGC	2	6	315919	315924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302176
7018	NC_015966	GGC	2	6	315958	315963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302176
7019	NC_015966	ATC	2	6	315986	315991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302176
7020	NC_015966	GCT	2	6	315995	316000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302176
7021	NC_015966	CTG	2	6	316043	316048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302176
7022	NC_015966	AAGT	2	8	316055	316062	50 %	25 %	25 %	0 %	345302176
7023	NC_015966	CTG	2	6	316238	316243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302177
7024	NC_015966	TGC	2	6	316251	316256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302177
7025	NC_015966	GAG	2	6	316304	316309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302177
7026	NC_015966	CCG	2	6	316387	316392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302177
7027	NC_015966	AGCGC	2	10	316408	316417	20 %	0 %	40 %	40 %	345302177
7028	NC_015966	GAG	2	6	316436	316441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302177
7029	NC_015966	AGG	2	6	316458	316463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302177
7030	NC_015966	CAG	2	6	316490	316495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302177
7031	NC_015966	GCAGGC	2	12	316498	316509	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345302177
7032	NC_015966	CGA	2	6	316546	316551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302177
7033	NC_015966	GTG	2	6	316562	316567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302177
7034	NC_015966	GCC	2	6	316586	316591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302177
7035	NC_015966	GCG	2	6	316630	316635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302177
7036	NC_015966	TGG	2	6	316638	316643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302177
7037	NC_015966	GCAA	2	8	316667	316674	50 %	0 %	25 %	25 %	345302177
7038	NC_015966	GAA	2	6	316739	316744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302178
7039	NC_015966	TGC	2	6	316791	316796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302178
7040	NC_015966	AGA	2	6	316863	316868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302178
7041	NC_015966	A	7	7	316868	316874	100 %	0 %	0 %	0 %	345302178
7042	NC_015966	GGC	2	6	316896	316901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302178
7043	NC_015966	AGAAA	2	10	316939	316948	80 %	0 %	20 %	0 %	345302178
7044	NC_015966	CTG	2	6	316958	316963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302178
7045	NC_015966	GGC	2	6	316975	316980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302178
7046	NC_015966	GGCG	2	8	317053	317060	0 %	0 %	75 %	25 %	345302178
7047	NC_015966	GCA	2	6	317119	317124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302178
7048	NC_015966	CGG	2	6	317140	317145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302178
7049	NC_015966	GGT	3	9	317146	317154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302178
7050	NC_015966	ACG	2	6	317175	317180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302178
7051	NC_015966	CAG	2	6	317192	317197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302178
7052	NC_015966	GCG	2	6	317221	317226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302178
7053	NC_015966	GCA	2	6	317247	317252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302178
7054	NC_015966	GGC	2	6	317322	317327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302179
7055	NC_015966	GCG	2	6	317407	317412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302179
7056	NC_015966	GCG	2	6	317446	317451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302179
7057	NC_015966	CGT	2	6	317492	317497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302179
7058	NC_015966	CGA	2	6	317531	317536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302179
7059	NC_015966	CGCGT	2	10	317548	317557	0 %	20 %	40 %	40 %	345302179
7060	NC_015966	CGG	2	6	317639	317644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302179
7061	NC_015966	GAT	2	6	317744	317749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302179
7062	NC_015966	ATC	2	6	317778	317783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302179
7063	NC_015966	CGG	2	6	317806	317811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302179
7064	NC_015966	TCG	2	6	317815	317820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302179
7065	NC_015966	ATC	2	6	317826	317831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302179
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7068	NC_015966	TTC	2	6	318036	318041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302179
7069	NC_015966	TCG	2	6	318064	318069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302179
7070	NC_015966	ACG	2	6	318073	318078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302179
7071	NC_015966	GCT	3	9	318116	318124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302179
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7076	NC_015966	CGA	2	6	318212	318217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302179
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7078	NC_015966	GCC	2	6	318245	318250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302179
7079	NC_015966	GGC	2	6	318276	318281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302179
7080	NC_015966	GGCG	2	8	318314	318321	0 %	0 %	75 %	25 %	345302179
7081	NC_015966	CGA	2	6	318340	318345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302179
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7083	NC_015966	CCGG	2	8	318407	318414	0 %	0 %	50 %	50 %	345302179
7084	NC_015966	GTGG	2	8	318444	318451	0 %	25 %	75 %	0 %	345302179
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7086	NC_015966	CGGCG	2	10	318579	318588	0 %	0 %	60 %	40 %	345302179
7087	NC_015966	TCG	2	6	318595	318600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302179
7088	NC_015966	GAG	2	6	318639	318644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302179
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7090	NC_015966	CTGCGC	2	12	318738	318749	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345302179
7091	NC_015966	CGA	2	6	318794	318799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302179
7092	NC_015966	GCG	2	6	318853	318858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302179
7093	NC_015966	CTGAG	2	10	318872	318881	20 %	20 %	40 %	20 %	345302179
7094	NC_015966	GCA	2	6	318940	318945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302180
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7098	NC_015966	GGC	2	6	319114	319119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302180
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7101	NC_015966	GGCC	2	8	319228	319235	0 %	0 %	50 %	50 %	345302180
7102	NC_015966	ACT	2	6	319272	319277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302180
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7105	NC_015966	CCG	2	6	319475	319480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302180
7106	NC_015966	CAT	2	6	319498	319503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302180
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7108	NC_015966	CCGGC	2	10	319534	319543	0 %	0 %	40 %	60 %	345302180
7109	NC_015966	CTG	2	6	319634	319639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302180
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7111	NC_015966	GC	4	8	319662	319669	0 %	0 %	50 %	50 %	345302180
7112	NC_015966	TGG	2	6	319671	319676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302180
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7117	NC_015966	GCG	2	6	319785	319790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302180
7118	NC_015966	CCA	2	6	320134	320139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302181
7119	NC_015966	CGT	2	6	320195	320200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302181
7120	NC_015966	GCCG	2	8	320258	320265	0 %	0 %	50 %	50 %	345302181
7121	NC_015966	CGA	2	6	320288	320293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302181
7122	NC_015966	GC	3	6	320307	320312	0 %	0 %	50 %	50 %	345302181
7123	NC_015966	ACG	2	6	320334	320339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302181
7124	NC_015966	AAG	2	6	320382	320387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302181
7125	NC_015966	CCA	2	6	320408	320413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302181
7126	NC_015966	GGACT	2	10	320508	320517	20 %	20 %	40 %	20 %	345302181
7127	NC_015966	GCT	2	6	320557	320562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302181
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7129	NC_015966	GTC	2	6	320687	320692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302181
7130	NC_015966	GGC	2	6	320710	320715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302181
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7132	NC_015966	CGG	2	6	320855	320860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302181
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7134	NC_015966	ACC	2	6	320893	320898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302181
7135	NC_015966	GCCG	2	8	320933	320940	0 %	0 %	50 %	50 %	345302181
7136	NC_015966	GGC	2	6	320955	320960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302181
7137	NC_015966	TGC	2	6	320998	321003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302181
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7139	NC_015966	GCA	2	6	321134	321139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302181
7140	NC_015966	TCC	2	6	321184	321189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302181
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7142	NC_015966	GCGG	2	8	321218	321225	0 %	0 %	75 %	25 %	345302181
7143	NC_015966	GCT	2	6	321230	321235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302181
7144	NC_015966	CTG	2	6	321357	321362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302181
7145	NC_015966	ACC	2	6	321416	321421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302181
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7148	NC_015966	GCT	2	6	321497	321502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302181
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7151	NC_015966	GTG	2	6	321561	321566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302181
7152	NC_015966	CGGGCA	2	12	321574	321585	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345302181
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7161	NC_015966	CGA	2	6	321932	321937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302181
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7184	NC_015966	GCT	2	6	322655	322660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302181
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7226	NC_015966	GCA	2	6	324924	324929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302183
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7232	NC_015966	CG	3	6	325083	325088	0 %	0 %	50 %	50 %	345302183
7233	NC_015966	TCG	2	6	325097	325102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302183
7234	NC_015966	AGCC	2	8	325225	325232	25 %	0 %	25 %	50 %	345302184
7235	NC_015966	CCT	2	6	325244	325249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302184
7236	NC_015966	GC	3	6	325261	325266	0 %	0 %	50 %	50 %	345302184
7237	NC_015966	GCCG	2	8	325289	325296	0 %	0 %	50 %	50 %	345302184
7238	NC_015966	CGA	2	6	325352	325357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302184
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7240	NC_015966	TCG	2	6	325439	325444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302184
7241	NC_015966	GCG	2	6	325491	325496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302184
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7358	NC_015966	CGA	2	6	330032	330037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302188
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7360	NC_015966	CGA	2	6	330100	330105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302188
7361	NC_015966	TCG	2	6	330108	330113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302188
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7478	NC_015966	GC	3	6	335239	335244	0 %	0 %	50 %	50 %	345302191
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