MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015966	CGT	2	6	294133	294138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302153
6502	NC_015966	AGT	2	6	294139	294144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302153
6503	NC_015966	CGC	2	6	294145	294150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302153
6504	NC_015966	CCT	2	6	294154	294159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302153
6505	NC_015966	GGGCA	2	10	294164	294173	20 %	0 %	60 %	20 %	345302153
6506	NC_015966	GGC	2	6	294176	294181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302153
6507	NC_015966	GCA	2	6	294217	294222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302153
6508	NC_015966	GCT	2	6	294226	294231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302153
6509	NC_015966	CTG	2	6	294245	294250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302153
6510	NC_015966	GGC	2	6	294317	294322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302153
6511	NC_015966	GC	3	6	294370	294375	0 %	0 %	50 %	50 %	345302153
6512	NC_015966	GCA	2	6	294433	294438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302153
6513	NC_015966	G	6	6	294476	294481	0 %	0 %	100 %	0 %	345302153
6514	NC_015966	CTT	2	6	294484	294489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302153
6515	NC_015966	CAG	3	9	294491	294499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302153
6516	NC_015966	GGC	2	6	294511	294516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302153
6517	NC_015966	GTT	2	6	294520	294525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302153
6518	NC_015966	GAG	2	6	294546	294551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302153
6519	NC_015966	CGG	2	6	294595	294600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302153
6520	NC_015966	TGA	2	6	294631	294636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302153
6521	NC_015966	TCGA	2	8	294683	294690	25 %	25 %	25 %	25 %	345302153
6522	NC_015966	TCG	2	6	294691	294696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302153
6523	NC_015966	TGC	2	6	294735	294740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302153
6524	NC_015966	CAGGTC	2	12	294746	294757	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345302153
6525	NC_015966	AGC	2	6	294786	294791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302153
6526	NC_015966	GCG	2	6	294804	294809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302153
6527	NC_015966	CAG	2	6	294890	294895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302153
6528	NC_015966	CAG	2	6	294899	294904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302153
6529	NC_015966	CAG	2	6	294929	294934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302153
6530	NC_015966	GC	3	6	294948	294953	0 %	0 %	50 %	50 %	345302153
6531	NC_015966	CGT	2	6	294973	294978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302153
6532	NC_015966	GCA	2	6	294979	294984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302153
6533	NC_015966	CAG	2	6	295088	295093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302153
6534	NC_015966	CG	3	6	295102	295107	0 %	0 %	50 %	50 %	345302153
6535	NC_015966	CAG	2	6	295112	295117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302153
6536	NC_015966	TCG	2	6	295126	295131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302153
6537	NC_015966	AGC	2	6	295134	295139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302153
6538	NC_015966	ACG	2	6	295149	295154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302153
6539	NC_015966	GCC	2	6	295155	295160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302153
6540	NC_015966	GTC	2	6	295163	295168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302153
6541	NC_015966	CAG	2	6	295178	295183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302153
6542	NC_015966	GGCT	2	8	295186	295193	0 %	25 %	50 %	25 %	345302153
6543	NC_015966	CGGT	3	12	295218	295229	0 %	25 %	50 %	25 %	345302153
6544	NC_015966	GTG	3	9	295236	295244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302153
6545	NC_015966	GC	4	8	295300	295307	0 %	0 %	50 %	50 %	345302154
6546	NC_015966	CGCA	2	8	295328	295335	25 %	0 %	25 %	50 %	345302154
6547	NC_015966	GCC	2	6	295367	295372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302154
6548	NC_015966	TGTGGC	2	12	295428	295439	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345302154
6549	NC_015966	GCG	2	6	295478	295483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302154
6550	NC_015966	CGCC	2	8	295508	295515	0 %	0 %	25 %	75 %	345302154
6551	NC_015966	CCG	2	6	295563	295568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302154
6552	NC_015966	A	6	6	295723	295728	100 %	0 %	0 %	0 %	345302154
6553	NC_015966	CGTG	2	8	295731	295738	0 %	25 %	50 %	25 %	345302154
6554	NC_015966	GA	3	6	295742	295747	50 %	0 %	50 %	0 %	345302154
6555	NC_015966	ATC	2	6	295757	295762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302154
6556	NC_015966	CAACG	2	10	295808	295817	40 %	0 %	20 %	40 %	345302155
6557	NC_015966	CTT	2	6	295851	295856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302155
6558	NC_015966	GCC	2	6	295933	295938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302155
6559	NC_015966	GCC	2	6	295954	295959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302155
6560	NC_015966	GTA	2	6	296056	296061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302155
6561	NC_015966	TGC	2	6	296094	296099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302155
6562	NC_015966	AGC	2	6	296111	296116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302155
6563	NC_015966	TCA	2	6	296127	296132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302155
6564	NC_015966	CTG	2	6	296158	296163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302155
6565	NC_015966	CGG	2	6	296193	296198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302155
6566	NC_015966	GCG	2	6	296207	296212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302155
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6568	NC_015966	GCG	2	6	296238	296243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302155
6569	NC_015966	CCA	2	6	296295	296300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302155
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6571	NC_015966	AGC	2	6	296327	296332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302155
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6578	NC_015966	CAG	3	9	296734	296742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302155
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6588	NC_015966	CAG	2	6	297365	297370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302156
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6590	NC_015966	ACG	2	6	297468	297473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302156
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6593	NC_015966	GAA	2	6	297793	297798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302157
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6595	NC_015966	TACG	2	8	297985	297992	25 %	25 %	25 %	25 %	345302158
6596	NC_015966	CG	3	6	297991	297996	0 %	0 %	50 %	50 %	345302158
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6599	NC_015966	CAG	2	6	298170	298175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302158
6600	NC_015966	CG	3	6	298178	298183	0 %	0 %	50 %	50 %	345302158
6601	NC_015966	GCC	2	6	298193	298198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302158
6602	NC_015966	GCC	2	6	298216	298221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302158
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6604	NC_015966	CACGGC	2	12	298281	298292	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345302158
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6607	NC_015966	GAT	2	6	298380	298385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302158
6608	NC_015966	GGGA	2	8	298463	298470	25 %	0 %	75 %	0 %	345302158
6609	NC_015966	CG	3	6	298481	298486	0 %	0 %	50 %	50 %	345302158
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6742	NC_015966	GGCC	2	8	303734	303741	0 %	0 %	50 %	50 %	345302161
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6745	NC_015966	CTG	2	6	303870	303875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302161
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6859	NC_015966	CCGG	2	8	308518	308525	0 %	0 %	50 %	50 %	345302167
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6982	NC_015966	GCT	2	6	314491	314496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302174
6983	NC_015966	GGA	2	6	314498	314503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302174
6984	NC_015966	GT	3	6	314511	314516	0 %	50 %	50 %	0 %	345302174
6985	NC_015966	GATT	2	8	314526	314533	25 %	50 %	25 %	0 %	345302174
6986	NC_015966	AACG	2	8	314568	314575	50 %	0 %	25 %	25 %	345302174
6987	NC_015966	CGT	2	6	314633	314638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302175
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7000	NC_015966	CGC	2	6	315020	315025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302175

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