MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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65502	NC_015966	CCT	2	6	3011671	3011676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304455
65503	NC_015966	ACC	2	6	3011679	3011684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304455
65504	NC_015966	CGC	2	6	3011690	3011695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304455
65505	NC_015966	TCG	2	6	3011700	3011705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304455
65506	NC_015966	GTA	2	6	3011741	3011746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304455
65507	NC_015966	CG	3	6	3011833	3011838	0 %	0 %	50 %	50 %	345304455
65508	NC_015966	CGA	2	6	3011843	3011848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304455
65509	NC_015966	CTGC	2	8	3012165	3012172	0 %	25 %	25 %	50 %	345304456
65510	NC_015966	CGG	2	6	3012231	3012236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304456
65511	NC_015966	CAC	2	6	3012272	3012277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304456
65512	NC_015966	GCC	2	6	3012359	3012364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304456
65513	NC_015966	CAGC	2	8	3012368	3012375	25 %	0 %	25 %	50 %	345304456
65514	NC_015966	GCT	2	6	3012431	3012436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304456
65515	NC_015966	GCT	2	6	3012446	3012451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304456
65516	NC_015966	CGG	2	6	3012497	3012502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304456
65517	NC_015966	CTGCGC	2	12	3012570	3012581	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345304456
65518	NC_015966	GCT	2	6	3012611	3012616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304456
65519	NC_015966	CAC	3	9	3012623	3012631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304456
65520	NC_015966	ACG	2	6	3012637	3012642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304456
65521	NC_015966	CAG	2	6	3012729	3012734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304456
65522	NC_015966	CTG	2	6	3012786	3012791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304456
65523	NC_015966	GCC	2	6	3012811	3012816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304456
65524	NC_015966	GAA	2	6	3012858	3012863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304456
65525	NC_015966	GTC	2	6	3012873	3012878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304456
65526	NC_015966	GC	3	6	3012946	3012951	0 %	0 %	50 %	50 %	345304456
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65532	NC_015966	CGG	2	6	3013316	3013321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304457
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65534	NC_015966	CGC	2	6	3013341	3013346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304457
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65537	NC_015966	CCGG	2	8	3013442	3013449	0 %	0 %	50 %	50 %	345304457
65538	NC_015966	GGA	2	6	3013506	3013511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304457
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65540	NC_015966	GC	3	6	3013552	3013557	0 %	0 %	50 %	50 %	345304457
65541	NC_015966	CAG	2	6	3013613	3013618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304458
65542	NC_015966	GGC	2	6	3013625	3013630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304458
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65544	NC_015966	GCAG	2	8	3013807	3013814	25 %	0 %	50 %	25 %	345304458
65545	NC_015966	CACG	2	8	3013840	3013847	25 %	0 %	25 %	50 %	345304458
65546	NC_015966	GC	3	6	3013856	3013861	0 %	0 %	50 %	50 %	345304458
65547	NC_015966	CGGC	2	8	3013894	3013901	0 %	0 %	50 %	50 %	345304458
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65551	NC_015966	GGA	2	6	3014170	3014175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304458
65552	NC_015966	GCG	2	6	3014216	3014221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304458
65553	NC_015966	TGT	2	6	3014235	3014240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345304458
65554	NC_015966	ATACAC	2	12	3014297	3014308	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	345304458
65555	NC_015966	C	6	6	3014358	3014363	0 %	0 %	0 %	100 %	345304458
65556	NC_015966	TCG	2	6	3014385	3014390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304458
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65558	NC_015966	GCT	2	6	3014440	3014445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304458
65559	NC_015966	TCG	2	6	3014508	3014513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304458
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65563	NC_015966	CA	3	6	3014814	3014819	50 %	0 %	0 %	50 %	345304458
65564	NC_015966	GGCC	2	8	3014824	3014831	0 %	0 %	50 %	50 %	345304458
65565	NC_015966	GGCC	2	8	3014857	3014864	0 %	0 %	50 %	50 %	345304458
65566	NC_015966	CAC	2	6	3014876	3014881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304458
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65569	NC_015966	TCG	2	6	3014984	3014989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304459
65570	NC_015966	CCT	2	6	3015096	3015101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304459
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65572	NC_015966	TGG	3	9	3015147	3015155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304459
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65582	NC_015966	TTC	2	6	3015546	3015551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304460
65583	NC_015966	GCA	2	6	3015573	3015578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304460
65584	NC_015966	GGC	2	6	3015579	3015584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304460
65585	NC_015966	CAG	2	6	3015600	3015605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304460
65586	NC_015966	CCA	2	6	3015657	3015662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304460
65587	NC_015966	CGGGCC	2	12	3015669	3015680	0 %	0 %	50 %	50 %	345304460
65588	NC_015966	TGA	2	6	3015685	3015690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304460
65589	NC_015966	GCC	2	6	3015745	3015750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304460
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65591	NC_015966	GAC	2	6	3015957	3015962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304460
65592	NC_015966	GTCG	2	8	3015965	3015972	0 %	25 %	50 %	25 %	345304460
65593	NC_015966	CGC	2	6	3016021	3016026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304460
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65598	NC_015966	CGA	2	6	3016244	3016249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304460
65599	NC_015966	CTG	2	6	3016316	3016321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304461
65600	NC_015966	CAG	2	6	3016400	3016405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304461
65601	NC_015966	GCG	2	6	3016447	3016452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304461
65602	NC_015966	GCG	2	6	3016582	3016587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304461
65603	NC_015966	CAC	3	9	3016589	3016597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304461
65604	NC_015966	GCCGGA	2	12	3016668	3016679	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345304461
65605	NC_015966	A	6	6	3016685	3016690	100 %	0 %	0 %	0 %	345304461
65606	NC_015966	GCA	2	6	3016726	3016731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304461
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65608	NC_015966	CCGTC	2	10	3016847	3016856	0 %	20 %	20 %	60 %	345304461
65609	NC_015966	CGC	2	6	3016863	3016868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304461
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65615	NC_015966	TTG	2	6	3017095	3017100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345304461
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