MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
65001	NC_015966	CGC	2	6	2989184	2989189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304436
65002	NC_015966	ACG	2	6	2989211	2989216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304436
65003	NC_015966	GATT	2	8	2989229	2989236	25 %	50 %	25 %	0 %	345304436
65004	NC_015966	GCT	3	9	2989526	2989534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304437
65005	NC_015966	GATCC	2	10	2989563	2989572	20 %	20 %	20 %	40 %	345304437
65006	NC_015966	TTAC	2	8	2989618	2989625	25 %	50 %	0 %	25 %	345304437
65007	NC_015966	GAC	2	6	2989626	2989631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304437
65008	NC_015966	CA	3	6	2989641	2989646	50 %	0 %	0 %	50 %	345304437
65009	NC_015966	TCG	2	6	2989648	2989653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304437
65010	NC_015966	CGT	2	6	2989685	2989690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304437
65011	NC_015966	GGC	2	6	2989806	2989811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304437
65012	NC_015966	CCG	2	6	2989816	2989821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304437
65013	NC_015966	CGC	2	6	2989838	2989843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304437
65014	NC_015966	GCC	2	6	2989865	2989870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304437
65015	NC_015966	CGT	2	6	2989898	2989903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304437
65016	NC_015966	GCCG	2	8	2989922	2989929	0 %	0 %	50 %	50 %	345304437
65017	NC_015966	CTG	2	6	2989958	2989963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304437
65018	NC_015966	CCAC	2	8	2989990	2989997	25 %	0 %	0 %	75 %	345304437
65019	NC_015966	GCC	2	6	2990010	2990015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304437
65020	NC_015966	TCT	2	6	2990023	2990028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304437
65021	NC_015966	CGA	2	6	2990042	2990047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304437
65022	NC_015966	CGG	2	6	2990093	2990098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304437
65023	NC_015966	ACG	2	6	2990101	2990106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304437
65024	NC_015966	GCGG	2	8	2990147	2990154	0 %	0 %	75 %	25 %	345304437
65025	NC_015966	GGCC	2	8	2990189	2990196	0 %	0 %	50 %	50 %	345304437
65026	NC_015966	ACC	2	6	2990229	2990234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304437
65027	NC_015966	CGC	2	6	2990258	2990263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304437
65028	NC_015966	GCT	2	6	2990282	2990287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304437
65029	NC_015966	CTG	3	9	2990471	2990479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304438
65030	NC_015966	CTG	2	6	2990489	2990494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304438
65031	NC_015966	CGA	2	6	2990554	2990559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304438
65032	NC_015966	ATC	2	6	2990645	2990650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304438
65033	NC_015966	ATC	2	6	2990664	2990669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304438
65034	NC_015966	TGG	2	6	2990702	2990707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304438
65035	NC_015966	CTG	2	6	2990714	2990719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304438
65036	NC_015966	TGC	2	6	2990793	2990798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304438
65037	NC_015966	GCG	2	6	2990840	2990845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304438
65038	NC_015966	GGC	2	6	2990893	2990898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304438
65039	NC_015966	CG	3	6	2990912	2990917	0 %	0 %	50 %	50 %	345304438
65040	NC_015966	ACT	2	6	2990991	2990996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304438
65041	NC_015966	TCT	2	6	2991045	2991050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304438
65042	NC_015966	TCCG	2	8	2991052	2991059	0 %	25 %	25 %	50 %	345304438
65043	NC_015966	CTA	2	6	2991109	2991114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304438
65044	NC_015966	GAG	2	6	2991164	2991169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304438
65045	NC_015966	CG	3	6	2991175	2991180	0 %	0 %	50 %	50 %	345304438
65046	NC_015966	GCTG	2	8	2991198	2991205	0 %	25 %	50 %	25 %	345304438
65047	NC_015966	CGCA	2	8	2991206	2991213	25 %	0 %	25 %	50 %	345304438
65048	NC_015966	CAA	2	6	2991220	2991225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345304438
65049	NC_015966	CCGC	2	8	2991447	2991454	0 %	0 %	25 %	75 %	345304438
65050	NC_015966	ACTT	2	8	2991467	2991474	25 %	50 %	0 %	25 %	345304438
65051	NC_015966	ACG	2	6	2991510	2991515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304438
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65053	NC_015966	CGA	2	6	2992006	2992011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304439
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65055	NC_015966	GAC	2	6	2992067	2992072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304439
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65101	NC_015966	ACTGG	2	10	2993942	2993951	20 %	20 %	40 %	20 %	345304441
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65107	NC_015966	GGCC	2	8	2994038	2994045	0 %	0 %	50 %	50 %	345304441
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65111	NC_015966	TGGG	2	8	2994405	2994412	0 %	25 %	75 %	0 %	345304441
65112	NC_015966	G	6	6	2994455	2994460	0 %	0 %	100 %	0 %	345304441
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65461	NC_015966	CAC	3	9	3009171	3009179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304453
65462	NC_015966	CTT	2	6	3009191	3009196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304453
65463	NC_015966	CAC	2	6	3009207	3009212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304453
65464	NC_015966	CGT	2	6	3009218	3009223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304453
65465	NC_015966	GCCG	2	8	3009306	3009313	0 %	0 %	50 %	50 %	345304453
65466	NC_015966	CGC	2	6	3009404	3009409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304453
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65482	NC_015966	CG	3	6	3010343	3010348	0 %	0 %	50 %	50 %	345304453
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65491	NC_015966	CGGG	2	8	3010969	3010976	0 %	0 %	75 %	25 %	345304454
65492	NC_015966	T	6	6	3011009	3011014	0 %	100 %	0 %	0 %	345304454
65493	NC_015966	CAG	2	6	3011016	3011021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304454
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65499	NC_015966	GCA	2	6	3011398	3011403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304455
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