MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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64002	NC_015966	CGA	2	6	2944198	2944203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304395
64003	NC_015966	GTC	2	6	2944214	2944219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304395
64004	NC_015966	GCTGGA	2	12	2944291	2944302	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345304395
64005	NC_015966	GCG	2	6	2944329	2944334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304395
64006	NC_015966	GGC	2	6	2944355	2944360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304395
64007	NC_015966	GCCG	2	8	2944393	2944400	0 %	0 %	50 %	50 %	345304395
64008	NC_015966	CGCT	2	8	2944448	2944455	0 %	25 %	25 %	50 %	345304395
64009	NC_015966	TCA	2	6	2944476	2944481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304395
64010	NC_015966	ACG	2	6	2944517	2944522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304395
64011	NC_015966	CTA	2	6	2944531	2944536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304395
64012	NC_015966	GAAG	2	8	2944558	2944565	50 %	0 %	50 %	0 %	345304395
64013	NC_015966	CGG	2	6	2944573	2944578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304395
64014	NC_015966	CAGC	2	8	2944627	2944634	25 %	0 %	25 %	50 %	345304395
64015	NC_015966	GCT	2	6	2944636	2944641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304395
64016	NC_015966	CTG	2	6	2944676	2944681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304395
64017	NC_015966	ACT	2	6	2944779	2944784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304395
64018	NC_015966	ACC	2	6	2944898	2944903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304396
64019	NC_015966	CTG	2	6	2944904	2944909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304396
64020	NC_015966	GCT	2	6	2944927	2944932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304396
64021	NC_015966	GTG	2	6	2944949	2944954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304396
64022	NC_015966	CTTCGT	2	12	2945029	2945040	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	345304396
64023	NC_015966	GAA	2	6	2945042	2945047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304396
64024	NC_015966	TCA	2	6	2945079	2945084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304396
64025	NC_015966	TCA	2	6	2945121	2945126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304396
64026	NC_015966	CAT	2	6	2945173	2945178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304396
64027	NC_015966	ATC	2	6	2945249	2945254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304396
64028	NC_015966	GC	3	6	2945260	2945265	0 %	0 %	50 %	50 %	345304396
64029	NC_015966	CG	3	6	2945322	2945327	0 %	0 %	50 %	50 %	345304396
64030	NC_015966	AAC	2	6	2945348	2945353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345304396
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64032	NC_015966	CAC	2	6	2945362	2945367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304396
64033	NC_015966	CGA	2	6	2945380	2945385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304396
64034	NC_015966	GGC	2	6	2945429	2945434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304396
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64041	NC_015966	ACG	2	6	2945598	2945603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304396
64042	NC_015966	ACG	2	6	2945613	2945618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304396
64043	NC_015966	CAT	2	6	2945653	2945658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304396
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64050	NC_015966	GCA	3	9	2946010	2946018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304396
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64052	NC_015966	TGC	2	6	2946054	2946059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304396
64053	NC_015966	CGG	2	6	2946082	2946087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304396
64054	NC_015966	CGGC	2	8	2946098	2946105	0 %	0 %	50 %	50 %	345304396
64055	NC_015966	CG	3	6	2946132	2946137	0 %	0 %	50 %	50 %	345304396
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64058	NC_015966	CGGAC	2	10	2946193	2946202	20 %	0 %	40 %	40 %	345304396
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64063	NC_015966	GGC	2	6	2946472	2946477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304396
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64463	NC_015966	CCCT	2	8	2965822	2965829	0 %	25 %	0 %	75 %	345304413
64464	NC_015966	CGTG	2	8	2965857	2965864	0 %	25 %	50 %	25 %	345304413
64465	NC_015966	GCC	2	6	2965936	2965941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304413
64466	NC_015966	CTG	2	6	2965975	2965980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304413
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64468	NC_015966	GCCT	2	8	2966021	2966028	0 %	25 %	25 %	50 %	345304413
64469	NC_015966	GCC	3	9	2966101	2966109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304413
64470	NC_015966	GTG	2	6	2966110	2966115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304413
64471	NC_015966	GCT	2	6	2966124	2966129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304413
64472	NC_015966	GGC	2	6	2966172	2966177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304413
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64483	NC_015966	CTG	3	9	2966512	2966520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304413
64484	NC_015966	CG	3	6	2966528	2966533	0 %	0 %	50 %	50 %	345304413
64485	NC_015966	ATC	2	6	2966557	2966562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304413
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64491	NC_015966	C	6	6	2966741	2966746	0 %	0 %	0 %	100 %	345304413
64492	NC_015966	GCCGG	2	10	2966890	2966899	0 %	0 %	60 %	40 %	345304414
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64494	NC_015966	CGC	2	6	2967027	2967032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304414
64495	NC_015966	GC	4	8	2967039	2967046	0 %	0 %	50 %	50 %	345304414
64496	NC_015966	GCTGCG	2	12	2967048	2967059	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345304414
64497	NC_015966	GCA	2	6	2967072	2967077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304414
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64499	NC_015966	GACG	2	8	2967121	2967128	25 %	0 %	50 %	25 %	345304414
64500	NC_015966	CG	3	6	2967127	2967132	0 %	0 %	50 %	50 %	345304414

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