MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
62001	NC_015966	GTCGCG	2	12	2852066	2852077	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345304310
62002	NC_015966	CACGGT	2	12	2852078	2852089	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345304310
62003	NC_015966	GCCG	2	8	2852161	2852168	0 %	0 %	50 %	50 %	345304310
62004	NC_015966	TCG	2	6	2852181	2852186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304310
62005	NC_015966	CAC	2	6	2852312	2852317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304310
62006	NC_015966	CTT	2	6	2852338	2852343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304310
62007	NC_015966	CGT	2	6	2852344	2852349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304310
62008	NC_015966	AGC	2	6	2852361	2852366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304310
62009	NC_015966	CCA	2	6	2852401	2852406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304310
62010	NC_015966	GCC	2	6	2852476	2852481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304310
62011	NC_015966	CCT	2	6	2852518	2852523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304310
62012	NC_015966	CCGG	2	8	2852611	2852618	0 %	0 %	50 %	50 %	345304310
62013	NC_015966	TTCC	2	8	2852651	2852658	0 %	50 %	0 %	50 %	345304310
62014	NC_015966	CGA	2	6	2852813	2852818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304310
62015	NC_015966	TTC	2	6	2852885	2852890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304310
62016	NC_015966	CGTG	2	8	2852908	2852915	0 %	25 %	50 %	25 %	345304310
62017	NC_015966	ATG	2	6	2852991	2852996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304310
62018	NC_015966	GCC	2	6	2853046	2853051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304310
62019	NC_015966	CCGTT	2	10	2853068	2853077	0 %	40 %	20 %	40 %	345304310
62020	NC_015966	GTC	2	6	2853152	2853157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304310
62021	NC_015966	CGC	2	6	2853224	2853229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304310
62022	NC_015966	CGA	2	6	2853238	2853243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304310
62023	NC_015966	GCT	2	6	2853280	2853285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304310
62024	NC_015966	GCC	2	6	2853333	2853338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304310
62025	NC_015966	CGC	2	6	2853378	2853383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304310
62026	NC_015966	TGG	2	6	2853421	2853426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304310
62027	NC_015966	CGA	2	6	2853472	2853477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304311
62028	NC_015966	CGC	2	6	2853586	2853591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304311
62029	NC_015966	GC	3	6	2853631	2853636	0 %	0 %	50 %	50 %	345304311
62030	NC_015966	CTGC	2	8	2853657	2853664	0 %	25 %	25 %	50 %	345304311
62031	NC_015966	CG	3	6	2853671	2853676	0 %	0 %	50 %	50 %	345304311
62032	NC_015966	GGCCGA	2	12	2853677	2853688	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345304311
62033	NC_015966	GCG	2	6	2853710	2853715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304311
62034	NC_015966	CGG	2	6	2853749	2853754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304311
62035	NC_015966	GGT	2	6	2853979	2853984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304312
62036	NC_015966	GAT	3	9	2853991	2853999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304312
62037	NC_015966	CAG	2	6	2854021	2854026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304312
62038	NC_015966	CGGC	2	8	2854028	2854035	0 %	0 %	50 %	50 %	345304312
62039	NC_015966	GTC	2	6	2854063	2854068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304312
62040	NC_015966	GATG	2	8	2854091	2854098	25 %	25 %	50 %	0 %	345304312
62041	NC_015966	CAGA	2	8	2854105	2854112	50 %	0 %	25 %	25 %	345304312
62042	NC_015966	GCCG	2	8	2854117	2854124	0 %	0 %	50 %	50 %	345304312
62043	NC_015966	GC	3	6	2854154	2854159	0 %	0 %	50 %	50 %	345304312
62044	NC_015966	CGA	2	6	2854164	2854169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304312
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62046	NC_015966	C	6	6	2854183	2854188	0 %	0 %	0 %	100 %	345304312
62047	NC_015966	GAT	2	6	2854210	2854215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304312
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62049	NC_015966	GGC	2	6	2854288	2854293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304312
62050	NC_015966	CGGC	2	8	2854299	2854306	0 %	0 %	50 %	50 %	345304312
62051	NC_015966	CGG	2	6	2854349	2854354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304312
62052	NC_015966	GGC	2	6	2854366	2854371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304312
62053	NC_015966	ACCC	2	8	2854396	2854403	25 %	0 %	0 %	75 %	345304312
62054	NC_015966	CG	3	6	2854410	2854415	0 %	0 %	50 %	50 %	345304312
62055	NC_015966	CGTG	2	8	2854513	2854520	0 %	25 %	50 %	25 %	345304312
62056	NC_015966	AAC	2	6	2854900	2854905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345304313
62057	NC_015966	CCTCCA	2	12	2854997	2855008	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	345304313
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62059	NC_015966	GAT	2	6	2855048	2855053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304313
62060	NC_015966	CCT	2	6	2855066	2855071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304313
62061	NC_015966	GCT	2	6	2855081	2855086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304313
62062	NC_015966	TCC	2	6	2855167	2855172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304313
62063	NC_015966	GAT	2	6	2855180	2855185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304313
62064	NC_015966	GCTTC	2	10	2855189	2855198	0 %	40 %	20 %	40 %	345304313
62065	NC_015966	CTC	2	6	2855232	2855237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304313
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62067	NC_015966	CGC	2	6	2855298	2855303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304313
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62069	NC_015966	AGC	2	6	2855910	2855915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304314
62070	NC_015966	TTCG	2	8	2855918	2855925	0 %	50 %	25 %	25 %	345304314
62071	NC_015966	CTG	2	6	2855933	2855938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304314
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62074	NC_015966	GAT	2	6	2856004	2856009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304314
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62079	NC_015966	CG	3	6	2856270	2856275	0 %	0 %	50 %	50 %	345304314
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62083	NC_015966	CGA	2	6	2856382	2856387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304314
62084	NC_015966	CCAGCG	2	12	2856403	2856414	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345304314
62085	NC_015966	TCC	3	9	2856435	2856443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304314
62086	NC_015966	CGA	2	6	2856452	2856457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304314
62087	NC_015966	GGCG	2	8	2856470	2856477	0 %	0 %	75 %	25 %	345304314
62088	NC_015966	GCG	2	6	2856482	2856487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304314
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62095	NC_015966	GTCG	2	8	2856677	2856684	0 %	25 %	50 %	25 %	345304314
62096	NC_015966	GGC	2	6	2856882	2856887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304314
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62098	NC_015966	TGC	4	12	2857410	2857421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304315
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62100	NC_015966	CGCTG	2	10	2857558	2857567	0 %	20 %	40 %	40 %	345304315
62101	NC_015966	TCGG	2	8	2857593	2857600	0 %	25 %	50 %	25 %	345304315
62102	NC_015966	TCG	2	6	2857611	2857616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304315
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62104	NC_015966	GCT	2	6	2857675	2857680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304315
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62109	NC_015966	TCT	2	6	2857962	2857967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304315
62110	NC_015966	CG	3	6	2857994	2857999	0 %	0 %	50 %	50 %	345304315
62111	NC_015966	TCG	2	6	2858040	2858045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304315
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62113	NC_015966	CGC	2	6	2858098	2858103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304315
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62115	NC_015966	GAA	2	6	2858278	2858283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304316
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62222	NC_015966	AGCC	2	8	2862626	2862633	25 %	0 %	25 %	50 %	345304321
62223	NC_015966	TCG	2	6	2862645	2862650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304321
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62225	NC_015966	GCC	3	9	2862722	2862730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304321
62226	NC_015966	GGC	2	6	2862797	2862802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304321
62227	NC_015966	TCCAGA	2	12	2862864	2862875	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345304321
62228	NC_015966	CAG	2	6	2862899	2862904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304321
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62230	NC_015966	GTT	2	6	2863006	2863011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345304322
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62337	NC_015966	GCC	2	6	2867025	2867030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304327
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62341	NC_015966	CG	3	6	2867193	2867198	0 %	0 %	50 %	50 %	345304327
62342	NC_015966	TAC	2	6	2867213	2867218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304327
62343	NC_015966	ACC	2	6	2867495	2867500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304328
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62460	NC_015966	GTA	2	6	2872611	2872616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304336
62461	NC_015966	CAC	2	6	2872659	2872664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304336
62462	NC_015966	ACCG	2	8	2872668	2872675	25 %	0 %	25 %	50 %	345304336
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62471	NC_015966	CCG	2	6	2873063	2873068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304336
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62487	NC_015966	GCG	2	6	2873658	2873663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304337
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62493	NC_015966	GCT	2	6	2874139	2874144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304338
62494	NC_015966	GCCG	2	8	2874181	2874188	0 %	0 %	50 %	50 %	345304338
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