MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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61116	NC_015966	ATC	2	6	2809946	2809951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304282
61117	NC_015966	GC	3	6	2809962	2809967	0 %	0 %	50 %	50 %	345304282
61118	NC_015966	TGG	2	6	2809995	2810000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304282
61119	NC_015966	GGC	2	6	2810011	2810016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304282
61120	NC_015966	TCA	2	6	2810031	2810036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304282
61121	NC_015966	GGC	2	6	2810039	2810044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304282
61122	NC_015966	CAC	2	6	2810063	2810068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304282
61123	NC_015966	TGG	2	6	2810076	2810081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304282
61124	NC_015966	GGC	2	6	2810112	2810117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304282
61125	NC_015966	GC	3	6	2810126	2810131	0 %	0 %	50 %	50 %	345304282
61126	NC_015966	GGC	3	9	2810176	2810184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304282
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61130	NC_015966	C	6	6	2810258	2810263	0 %	0 %	0 %	100 %	345304282
61131	NC_015966	GGC	2	6	2810299	2810304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304282
61132	NC_015966	CGG	2	6	2810311	2810316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304282
61133	NC_015966	GGC	2	6	2810334	2810339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304282
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61135	NC_015966	GCTG	2	8	2810392	2810399	0 %	25 %	50 %	25 %	345304282
61136	NC_015966	GGT	2	6	2810413	2810418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304282
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61138	NC_015966	GCCG	2	8	2810440	2810447	0 %	0 %	50 %	50 %	345304282
61139	NC_015966	CTG	2	6	2810450	2810455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304282
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61144	NC_015966	CGA	2	6	2810587	2810592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304282
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61146	NC_015966	CGT	2	6	2810659	2810664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304282
61147	NC_015966	TGG	2	6	2810670	2810675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304282
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61150	NC_015966	CGT	2	6	2810797	2810802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304282
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61172	NC_015966	CTG	2	6	2811684	2811689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304284
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61183	NC_015966	CGTTC	2	10	2812264	2812273	0 %	40 %	20 %	40 %	345304285
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61200	NC_015966	ATG	2	6	2812808	2812813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304285
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61202	NC_015966	GAG	2	6	2812919	2812924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304285
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61207	NC_015966	GCCGAA	2	12	2813207	2813218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304285
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61214	NC_015966	GATC	2	8	2813575	2813582	25 %	25 %	25 %	25 %	345304286
61215	NC_015966	GTC	2	6	2813585	2813590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304286
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61218	NC_015966	CCGC	2	8	2813658	2813665	0 %	0 %	25 %	75 %	345304286
61219	NC_015966	AGC	3	9	2813679	2813687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304286
61220	NC_015966	GCT	2	6	2813773	2813778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304286
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61222	NC_015966	GCA	2	6	2813842	2813847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304286
61223	NC_015966	GCCG	2	8	2813860	2813867	0 %	0 %	50 %	50 %	345304286
61224	NC_015966	CCG	2	6	2813899	2813904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304286
61225	NC_015966	CGA	2	6	2813929	2813934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304286
61226	NC_015966	CAG	2	6	2814035	2814040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304286
61227	NC_015966	TC	3	6	2814076	2814081	0 %	50 %	0 %	50 %	345304286
61228	NC_015966	GTG	2	6	2814128	2814133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304286
61229	NC_015966	GAG	2	6	2814344	2814349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304286
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61461	NC_015966	GGC	2	6	2825151	2825156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304295
61462	NC_015966	GCTGC	2	10	2825200	2825209	0 %	20 %	40 %	40 %	345304295
61463	NC_015966	GCT	2	6	2825289	2825294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304295
61464	NC_015966	ATC	2	6	2825303	2825308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304295
61465	NC_015966	CG	3	6	2825311	2825316	0 %	0 %	50 %	50 %	345304295
61466	NC_015966	GAC	2	6	2825371	2825376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304295
61467	NC_015966	AC	3	6	2825412	2825417	50 %	0 %	0 %	50 %	345304295
61468	NC_015966	GTA	2	6	2825419	2825424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304295
61469	NC_015966	ATG	2	6	2825444	2825449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304295
61470	NC_015966	GCC	2	6	2825518	2825523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304295
61471	NC_015966	TGC	2	6	2825528	2825533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304295
61472	NC_015966	CGA	2	6	2825538	2825543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304295
61473	NC_015966	GCCC	2	8	2825556	2825563	0 %	0 %	25 %	75 %	345304295
61474	NC_015966	CGC	2	6	2825587	2825592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304295
61475	NC_015966	CGC	2	6	2825649	2825654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304295
61476	NC_015966	GGC	3	9	2825679	2825687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304295
61477	NC_015966	CCT	2	6	2825756	2825761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304295
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61479	NC_015966	GCG	2	6	2825943	2825948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304296
61480	NC_015966	AGA	2	6	2825950	2825955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304296
61481	NC_015966	GCC	2	6	2825972	2825977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304296
61482	NC_015966	GCT	2	6	2825993	2825998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304296
61483	NC_015966	GAGC	2	8	2825999	2826006	25 %	0 %	50 %	25 %	345304296
61484	NC_015966	CGG	2	6	2826016	2826021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304296
61485	NC_015966	ATCC	2	8	2826023	2826030	25 %	25 %	0 %	50 %	345304296
61486	NC_015966	GCT	2	6	2826056	2826061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304296
61487	NC_015966	A	6	6	2826147	2826152	100 %	0 %	0 %	0 %	345304296
61488	NC_015966	CG	3	6	2826162	2826167	0 %	0 %	50 %	50 %	345304296
61489	NC_015966	GGTC	2	8	2826248	2826255	0 %	25 %	50 %	25 %	345304296
61490	NC_015966	GC	3	6	2826319	2826324	0 %	0 %	50 %	50 %	345304296
61491	NC_015966	GAA	2	6	2826438	2826443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304296
61492	NC_015966	TGC	2	6	2826454	2826459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304296
61493	NC_015966	GAA	2	6	2826479	2826484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304296
61494	NC_015966	TCG	2	6	2826529	2826534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304296
61495	NC_015966	GAG	2	6	2826651	2826656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304296
61496	NC_015966	GTC	2	6	2826669	2826674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304296
61497	NC_015966	GGC	3	9	2826680	2826688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304296
61498	NC_015966	CGA	2	6	2826716	2826721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304296
61499	NC_015966	GGT	2	6	2826731	2826736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304296
61500	NC_015966	GTGCCG	2	12	2826739	2826750	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345304296

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