MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
59001	NC_015966	GCA	2	6	2716641	2716646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304213
59002	NC_015966	GC	3	6	2716828	2716833	0 %	0 %	50 %	50 %	345304213
59003	NC_015966	C	6	6	2716840	2716845	0 %	0 %	0 %	100 %	345304213
59004	NC_015966	CG	3	6	2716901	2716906	0 %	0 %	50 %	50 %	345304213
59005	NC_015966	GT	3	6	2716985	2716990	0 %	50 %	50 %	0 %	345304213
59006	NC_015966	GCA	2	6	2716992	2716997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304213
59007	NC_015966	TTC	2	6	2717008	2717013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304213
59008	NC_015966	GAC	2	6	2717021	2717026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304213
59009	NC_015966	CAA	2	6	2717043	2717048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345304213
59010	NC_015966	GGT	2	6	2717436	2717441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304214
59011	NC_015966	CAG	2	6	2717487	2717492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304214
59012	NC_015966	CTG	2	6	2717595	2717600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304214
59013	NC_015966	GGT	3	9	2717661	2717669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304214
59014	NC_015966	GAA	2	6	2717733	2717738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304214
59015	NC_015966	CGCCAG	2	12	2717745	2717756	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345304214
59016	NC_015966	T	6	6	2717757	2717762	0 %	100 %	0 %	0 %	345304214
59017	NC_015966	CAC	2	6	2717820	2717825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304214
59018	NC_015966	GGTCA	2	10	2717835	2717844	20 %	20 %	40 %	20 %	345304214
59019	NC_015966	CGGC	2	8	2717894	2717901	0 %	0 %	50 %	50 %	345304214
59020	NC_015966	CGCC	2	8	2718038	2718045	0 %	0 %	25 %	75 %	345304214
59021	NC_015966	GTC	2	6	2718093	2718098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304214
59022	NC_015966	AAAT	2	8	2718121	2718128	75 %	25 %	0 %	0 %	345304214
59023	NC_015966	TCG	2	6	2718166	2718171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304214
59024	NC_015966	TGGC	2	8	2718175	2718182	0 %	25 %	50 %	25 %	345304214
59025	NC_015966	GTA	2	6	2718186	2718191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304214
59026	NC_015966	GAC	2	6	2718234	2718239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304214
59027	NC_015966	GATC	2	8	2718291	2718298	25 %	25 %	25 %	25 %	345304214
59028	NC_015966	GGCC	2	8	2718558	2718565	0 %	0 %	50 %	50 %	345304215
59029	NC_015966	GAA	2	6	2718586	2718591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304215
59030	NC_015966	CGGGCG	2	12	2718624	2718635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304215
59031	NC_015966	GCA	2	6	2718642	2718647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304215
59032	NC_015966	CAG	2	6	2718682	2718687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304215
59033	NC_015966	GGC	2	6	2718692	2718697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304215
59034	NC_015966	GCA	2	6	2718711	2718716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304215
59035	NC_015966	CGG	2	6	2718726	2718731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304215
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59037	NC_015966	CTG	2	6	2718742	2718747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304215
59038	NC_015966	CGGTC	2	10	2718760	2718769	0 %	20 %	40 %	40 %	345304215
59039	NC_015966	CGG	2	6	2718813	2718818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304215
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59042	NC_015966	AGA	2	6	2718873	2718878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304215
59043	NC_015966	CCA	2	6	2718882	2718887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304215
59044	NC_015966	CCA	2	6	2718897	2718902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304215
59045	NC_015966	CGG	2	6	2718904	2718909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304215
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59051	NC_015966	CCA	2	6	2719131	2719136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304215
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59054	NC_015966	GCC	2	6	2719214	2719219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304215
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59056	NC_015966	CAG	2	6	2719300	2719305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304215
59057	NC_015966	CG	4	8	2719344	2719351	0 %	0 %	50 %	50 %	345304215
59058	NC_015966	CAG	2	6	2719402	2719407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304215
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59084	NC_015966	CG	3	6	2720607	2720612	0 %	0 %	50 %	50 %	345304216
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59231	NC_015966	ACC	2	6	2727006	2727011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304220
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59233	NC_015966	CGT	2	6	2727084	2727089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304220
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59343	NC_015966	GAT	2	6	2732473	2732478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304223
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