MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_015966	TGCG	2	8	2671451	2671458	0 %	25 %	50 %	25 %	345304172
58002	NC_015966	CAGGC	2	10	2671482	2671491	20 %	0 %	40 %	40 %	345304172
58003	NC_015966	CAG	2	6	2671558	2671563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304172
58004	NC_015966	GCC	2	6	2671661	2671666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304172
58005	NC_015966	GGTACG	2	12	2671675	2671686	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345304172
58006	NC_015966	CGC	2	6	2671721	2671726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304172
58007	NC_015966	CCCG	2	8	2671780	2671787	0 %	0 %	25 %	75 %	345304172
58008	NC_015966	GCA	2	6	2671794	2671799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304172
58009	NC_015966	CGC	2	6	2671800	2671805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304172
58010	NC_015966	TCA	2	6	2671839	2671844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304172
58011	NC_015966	GCT	2	6	2671863	2671868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304172
58012	NC_015966	GCATG	2	10	2671932	2671941	20 %	20 %	40 %	20 %	345304172
58013	NC_015966	GCC	2	6	2671942	2671947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304172
58014	NC_015966	AGC	2	6	2671958	2671963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304172
58015	NC_015966	GCC	2	6	2671995	2672000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304172
58016	NC_015966	ATG	2	6	2672021	2672026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304172
58017	NC_015966	A	8	8	2672158	2672165	100 %	0 %	0 %	0 %	345304172
58018	NC_015966	AGC	2	6	2672171	2672176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304172
58019	NC_015966	GGC	2	6	2672214	2672219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304172
58020	NC_015966	CCAGC	2	10	2672278	2672287	20 %	0 %	20 %	60 %	345304172
58021	NC_015966	CAG	2	6	2672326	2672331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304172
58022	NC_015966	GCA	2	6	2672343	2672348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304172
58023	NC_015966	CGGG	2	8	2672412	2672419	0 %	0 %	75 %	25 %	345304172
58024	NC_015966	CGGC	2	8	2672454	2672461	0 %	0 %	50 %	50 %	345304172
58025	NC_015966	AGC	2	6	2672471	2672476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304172
58026	NC_015966	TTCA	2	8	2672500	2672507	25 %	50 %	0 %	25 %	345304172
58027	NC_015966	ACG	2	6	2672540	2672545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304173
58028	NC_015966	CCG	2	6	2672555	2672560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304173
58029	NC_015966	TCC	2	6	2672565	2672570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304173
58030	NC_015966	GAT	2	6	2672600	2672605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304173
58031	NC_015966	GCC	2	6	2672698	2672703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304173
58032	NC_015966	CG	3	6	2672704	2672709	0 %	0 %	50 %	50 %	345304173
58033	NC_015966	CAG	2	6	2672756	2672761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304173
58034	NC_015966	GCG	2	6	2672764	2672769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304173
58035	NC_015966	CAC	2	6	2672897	2672902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304173
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58037	NC_015966	GCT	2	6	2672929	2672934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304173
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58039	NC_015966	GTC	2	6	2673020	2673025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304173
58040	NC_015966	GA	3	6	2673130	2673135	50 %	0 %	50 %	0 %	345304173
58041	NC_015966	TCG	2	6	2673309	2673314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304174
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58043	NC_015966	CTG	2	6	2673347	2673352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304174
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58046	NC_015966	GCCG	2	8	2673394	2673401	0 %	0 %	50 %	50 %	345304174
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58049	NC_015966	TGC	2	6	2673510	2673515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304174
58050	NC_015966	GCC	2	6	2673552	2673557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304174
58051	NC_015966	CGG	2	6	2673569	2673574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304174
58052	NC_015966	TGCC	2	8	2673650	2673657	0 %	25 %	25 %	50 %	345304175
58053	NC_015966	GC	4	8	2673704	2673711	0 %	0 %	50 %	50 %	345304175
58054	NC_015966	CCA	2	6	2673738	2673743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304175
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58056	NC_015966	GCA	2	6	2673804	2673809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304175
58057	NC_015966	CGC	2	6	2673819	2673824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304175
58058	NC_015966	GGC	2	6	2673877	2673882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304175
58059	NC_015966	G	6	6	2673919	2673924	0 %	0 %	100 %	0 %	345304175
58060	NC_015966	GCC	2	6	2674001	2674006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304175
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58064	NC_015966	GGCC	2	8	2674203	2674210	0 %	0 %	50 %	50 %	345304176
58065	NC_015966	CGGC	2	8	2674245	2674252	0 %	0 %	50 %	50 %	345304176
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58070	NC_015966	CGA	2	6	2674369	2674374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304176
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58107	NC_015966	CG	3	6	2675595	2675600	0 %	0 %	50 %	50 %	345304176
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58116	NC_015966	CTG	3	9	2676356	2676364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304177
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58228	NC_015966	CGGC	2	8	2682452	2682459	0 %	0 %	50 %	50 %	345304183
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58230	NC_015966	CGC	2	6	2682519	2682524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304183
58231	NC_015966	CGGC	2	8	2682528	2682535	0 %	0 %	50 %	50 %	345304183
58232	NC_015966	CGC	2	6	2682544	2682549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304183
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58243	NC_015966	GCCA	2	8	2683037	2683044	25 %	0 %	25 %	50 %	345304184
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58328	NC_015966	CCGGG	2	10	2686874	2686883	0 %	0 %	60 %	40 %	345304188
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58331	NC_015966	TCG	2	6	2686947	2686952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304188
58332	NC_015966	AACG	2	8	2686985	2686992	50 %	0 %	25 %	25 %	345304188
58333	NC_015966	TACGG	2	10	2686994	2687003	20 %	20 %	40 %	20 %	345304188
58334	NC_015966	TGG	2	6	2687070	2687075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304188
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58343	NC_015966	GCT	2	6	2687701	2687706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304188
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58457	NC_015966	CCAG	2	8	2693876	2693883	25 %	0 %	25 %	50 %	345304193
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