MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57501	NC_015966	GCC	2	6	2651503	2651508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304152
57502	NC_015966	GTA	2	6	2651531	2651536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304152
57503	NC_015966	CGG	2	6	2651555	2651560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304152
57504	NC_015966	CGA	2	6	2651581	2651586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304152
57505	NC_015966	GCG	2	6	2651659	2651664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304152
57506	NC_015966	CGG	2	6	2651732	2651737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304152
57507	NC_015966	CCA	2	6	2651806	2651811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304152
57508	NC_015966	CGA	2	6	2651845	2651850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304152
57509	NC_015966	GCT	2	6	2651905	2651910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304152
57510	NC_015966	CG	3	6	2651917	2651922	0 %	0 %	50 %	50 %	345304152
57511	NC_015966	TCG	2	6	2651928	2651933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304152
57512	NC_015966	TGG	2	6	2651947	2651952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304152
57513	NC_015966	CGT	2	6	2651992	2651997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304152
57514	NC_015966	CTG	2	6	2652002	2652007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304152
57515	NC_015966	CGC	2	6	2652052	2652057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304152
57516	NC_015966	GCC	3	9	2652119	2652127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304152
57517	NC_015966	GCA	2	6	2652199	2652204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304152
57518	NC_015966	CGA	2	6	2652346	2652351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304152
57519	NC_015966	CG	4	8	2652352	2652359	0 %	0 %	50 %	50 %	345304152
57520	NC_015966	GCA	2	6	2652367	2652372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304152
57521	NC_015966	GCC	2	6	2652532	2652537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304153
57522	NC_015966	GCA	3	9	2652555	2652563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304153
57523	NC_015966	CGGCC	2	10	2652585	2652594	0 %	0 %	40 %	60 %	345304153
57524	NC_015966	GCAC	2	8	2652617	2652624	25 %	0 %	25 %	50 %	345304153
57525	NC_015966	TCGG	2	8	2652629	2652636	0 %	25 %	50 %	25 %	345304153
57526	NC_015966	GCA	2	6	2652642	2652647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304153
57527	NC_015966	GGC	2	6	2652661	2652666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304153
57528	NC_015966	CGG	2	6	2652669	2652674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304153
57529	NC_015966	GCC	2	6	2652725	2652730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304153
57530	NC_015966	CCA	2	6	2652756	2652761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304153
57531	NC_015966	GGC	2	6	2652842	2652847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304153
57532	NC_015966	CGC	2	6	2652850	2652855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304153
57533	NC_015966	AGC	2	6	2652858	2652863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304153
57534	NC_015966	CCA	2	6	2652945	2652950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304153
57535	NC_015966	GCC	3	9	2652961	2652969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304153
57536	NC_015966	CAGG	2	8	2652982	2652989	25 %	0 %	50 %	25 %	345304153
57537	NC_015966	GC	3	6	2653017	2653022	0 %	0 %	50 %	50 %	345304153
57538	NC_015966	TCC	2	6	2653043	2653048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304153
57539	NC_015966	CGCA	2	8	2653084	2653091	25 %	0 %	25 %	50 %	345304153
57540	NC_015966	TGG	2	6	2653137	2653142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304153
57541	NC_015966	ACG	2	6	2653148	2653153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304153
57542	NC_015966	GCC	2	6	2653302	2653307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304153
57543	NC_015966	AGC	2	6	2653328	2653333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304153
57544	NC_015966	CCA	2	6	2653406	2653411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304154
57545	NC_015966	GCC	3	9	2653455	2653463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304154
57546	NC_015966	CTC	2	6	2653481	2653486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304154
57547	NC_015966	AGC	2	6	2653503	2653508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304154
57548	NC_015966	GCA	2	6	2653546	2653551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304154
57549	NC_015966	CAC	2	6	2653610	2653615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304154
57550	NC_015966	GCGA	2	8	2653661	2653668	25 %	0 %	50 %	25 %	345304154
57551	NC_015966	GCC	2	6	2653689	2653694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304154
57552	NC_015966	GCG	2	6	2653743	2653748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304154
57553	NC_015966	GCA	2	6	2653813	2653818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304154
57554	NC_015966	GCA	2	6	2653822	2653827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304154
57555	NC_015966	GATC	2	8	2653873	2653880	25 %	25 %	25 %	25 %	345304154
57556	NC_015966	TCG	2	6	2654022	2654027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304154
57557	NC_015966	GCA	2	6	2654044	2654049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304154
57558	NC_015966	GCC	2	6	2654073	2654078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304154
57559	NC_015966	TTC	2	6	2654120	2654125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304154
57560	NC_015966	CGGGCA	2	12	2654185	2654196	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345304154
57561	NC_015966	CAC	2	6	2654198	2654203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304154
57562	NC_015966	TCG	2	6	2654209	2654214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304154
57563	NC_015966	CAGCGT	2	12	2654340	2654351	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345304155
57564	NC_015966	GT	3	6	2654395	2654400	0 %	50 %	50 %	0 %	345304155
57565	NC_015966	GTT	2	6	2654547	2654552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345304155
57566	NC_015966	CGG	2	6	2654585	2654590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304155
57567	NC_015966	GCG	2	6	2654594	2654599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304155
57568	NC_015966	CGG	2	6	2654613	2654618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304155
57569	NC_015966	GCC	2	6	2654638	2654643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304155
57570	NC_015966	TCCGG	2	10	2654665	2654674	0 %	20 %	40 %	40 %	345304155
57571	NC_015966	GTC	2	6	2654754	2654759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304155
57572	NC_015966	GTT	2	6	2654820	2654825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345304155
57573	NC_015966	CCG	2	6	2654833	2654838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304155
57574	NC_015966	GCG	2	6	2654856	2654861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304155
57575	NC_015966	GCG	2	6	2654913	2654918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304155
57576	NC_015966	GTCG	2	8	2654967	2654974	0 %	25 %	50 %	25 %	345304155
57577	NC_015966	CGA	2	6	2654975	2654980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304155
57578	NC_015966	CGA	2	6	2654989	2654994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304155
57579	NC_015966	TCG	2	6	2654998	2655003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304155
57580	NC_015966	GGC	2	6	2655108	2655113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304155
57581	NC_015966	GCG	2	6	2655122	2655127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304155
57582	NC_015966	CGT	2	6	2655158	2655163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304155
57583	NC_015966	GT	3	6	2655206	2655211	0 %	50 %	50 %	0 %	345304155
57584	NC_015966	GCCA	2	8	2655233	2655240	25 %	0 %	25 %	50 %	345304155
57585	NC_015966	CCGG	2	8	2655241	2655248	0 %	0 %	50 %	50 %	345304155
57586	NC_015966	GCT	2	6	2655296	2655301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304155
57587	NC_015966	ATCC	2	8	2655304	2655311	25 %	25 %	0 %	50 %	345304155
57588	NC_015966	CGGC	2	8	2655317	2655324	0 %	0 %	50 %	50 %	345304155
57589	NC_015966	CG	3	6	2655359	2655364	0 %	0 %	50 %	50 %	345304155
57590	NC_015966	CAG	2	6	2655381	2655386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304155
57591	NC_015966	GCG	2	6	2655418	2655423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304155
57592	NC_015966	AGC	2	6	2655430	2655435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304155
57593	NC_015966	GGCC	2	8	2655457	2655464	0 %	0 %	50 %	50 %	345304155
57594	NC_015966	GGC	2	6	2655483	2655488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304155
57595	NC_015966	CGG	2	6	2655523	2655528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304155
57596	NC_015966	GC	3	6	2655531	2655536	0 %	0 %	50 %	50 %	345304155
57597	NC_015966	GCG	2	6	2655576	2655581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304155
57598	NC_015966	GTG	2	6	2655598	2655603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304155
57599	NC_015966	AAGCG	2	10	2655631	2655640	40 %	0 %	40 %	20 %	345304155
57600	NC_015966	GGTTGC	2	12	2655676	2655687	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	345304155
57601	NC_015966	GCA	2	6	2655719	2655724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304155
57602	NC_015966	GCCA	2	8	2655725	2655732	25 %	0 %	25 %	50 %	345304155
57603	NC_015966	GGC	2	6	2655735	2655740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304155
57604	NC_015966	CAG	3	9	2655774	2655782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304155
57605	NC_015966	CCGGA	2	10	2655783	2655792	20 %	0 %	40 %	40 %	345304155
57606	NC_015966	ACC	2	6	2655799	2655804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304155
57607	NC_015966	GGT	2	6	2655812	2655817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304155
57608	NC_015966	GC	3	6	2655821	2655826	0 %	0 %	50 %	50 %	345304155
57609	NC_015966	ACG	2	6	2655847	2655852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304155
57610	NC_015966	GGCA	2	8	2655881	2655888	25 %	0 %	50 %	25 %	345304155
57611	NC_015966	CCA	2	6	2655896	2655901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304155
57612	NC_015966	GCA	2	6	2656195	2656200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304156
57613	NC_015966	TGC	2	6	2656209	2656214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304156
57614	NC_015966	CTG	2	6	2656241	2656246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304156
57615	NC_015966	TTC	2	6	2656253	2656258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304156
57616	NC_015966	GTT	2	6	2656280	2656285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345304156
57617	NC_015966	CTG	2	6	2656292	2656297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304156
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57627	NC_015966	CTG	2	6	2656619	2656624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304156
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57653	NC_015966	GC	3	6	2657573	2657578	0 %	0 %	50 %	50 %	345304156
57654	NC_015966	CG	4	8	2657590	2657597	0 %	0 %	50 %	50 %	345304156
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57722	NC_015966	CGA	2	6	2660319	2660324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304160
57723	NC_015966	TCGTC	2	10	2660558	2660567	0 %	40 %	20 %	40 %	345304160
57724	NC_015966	CGA	2	6	2660606	2660611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304160
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57842	NC_015966	CTCG	2	8	2665037	2665044	0 %	25 %	25 %	50 %	345304166
57843	NC_015966	GGC	2	6	2665082	2665087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304166
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57845	NC_015966	GCT	2	6	2665109	2665114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304166
57846	NC_015966	CGA	2	6	2665124	2665129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304166
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57955	NC_015966	GC	4	8	2669301	2669308	0 %	0 %	50 %	50 %	345304170
57956	NC_015966	CAT	2	6	2669330	2669335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304170
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