MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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56502	NC_015966	GCC	2	6	2606877	2606882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304106
56503	NC_015966	CCG	2	6	2606883	2606888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304106
56504	NC_015966	GTC	2	6	2606998	2607003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304106
56505	NC_015966	TCAG	2	8	2607013	2607020	25 %	25 %	25 %	25 %	345304106
56506	NC_015966	GCT	2	6	2607023	2607028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304106
56507	NC_015966	CCG	2	6	2607036	2607041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304106
56508	NC_015966	CGA	2	6	2607065	2607070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304106
56509	NC_015966	CAG	2	6	2607072	2607077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304106
56510	NC_015966	GTA	3	9	2607090	2607098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304106
56511	NC_015966	CAG	2	6	2607123	2607128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304106
56512	NC_015966	GAC	2	6	2607147	2607152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304106
56513	NC_015966	CG	3	6	2607282	2607287	0 %	0 %	50 %	50 %	345304107
56514	NC_015966	CCG	2	6	2607303	2607308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304107
56515	NC_015966	ACG	2	6	2607351	2607356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304107
56516	NC_015966	TCC	2	6	2607389	2607394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304107
56517	NC_015966	CAA	2	6	2607400	2607405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345304107
56518	NC_015966	AT	3	6	2607409	2607414	50 %	50 %	0 %	0 %	345304107
56519	NC_015966	C	6	6	2607419	2607424	0 %	0 %	0 %	100 %	345304107
56520	NC_015966	CCA	2	6	2607453	2607458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304107
56521	NC_015966	CCA	2	6	2607510	2607515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304107
56522	NC_015966	GCC	2	6	2607623	2607628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304107
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56524	NC_015966	TCC	2	6	2607692	2607697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304107
56525	NC_015966	CCT	2	6	2607753	2607758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304107
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56531	NC_015966	GCTG	2	8	2607993	2608000	0 %	25 %	50 %	25 %	345304107
56532	NC_015966	CCCCG	2	10	2608035	2608044	0 %	0 %	20 %	80 %	345304107
56533	NC_015966	TCCG	2	8	2608055	2608062	0 %	25 %	25 %	50 %	345304107
56534	NC_015966	GAT	2	6	2608080	2608085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304107
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56536	NC_015966	ACG	3	9	2608203	2608211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304107
56537	NC_015966	GC	3	6	2608339	2608344	0 %	0 %	50 %	50 %	345304108
56538	NC_015966	CGC	2	6	2608381	2608386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304108
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56541	NC_015966	CCCG	2	8	2608427	2608434	0 %	0 %	25 %	75 %	345304108
56542	NC_015966	A	6	6	2608517	2608522	100 %	0 %	0 %	0 %	345304108
56543	NC_015966	CAC	2	6	2608531	2608536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304108
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56550	NC_015966	CGC	2	6	2608833	2608838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304108
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56553	NC_015966	GC	3	6	2609000	2609005	0 %	0 %	50 %	50 %	345304109
56554	NC_015966	GC	3	6	2609017	2609022	0 %	0 %	50 %	50 %	345304109
56555	NC_015966	CTC	2	6	2609029	2609034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304109
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56583	NC_015966	CG	3	6	2610299	2610304	0 %	0 %	50 %	50 %	345304110
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56588	NC_015966	TGA	2	6	2610515	2610520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304110
56589	NC_015966	CAG	2	6	2610522	2610527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304110
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56613	NC_015966	CAG	2	6	2611302	2611307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304110
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56615	NC_015966	GGT	2	6	2611347	2611352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304110
56616	NC_015966	GCA	2	6	2611379	2611384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304110
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56844	NC_015966	GATGC	2	10	2620680	2620689	20 %	20 %	40 %	20 %	345304127
56845	NC_015966	CGC	2	6	2620706	2620711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304127
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56859	NC_015966	GCA	2	6	2621321	2621326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304127
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56949	NC_015966	GGCC	2	8	2625325	2625332	0 %	0 %	50 %	50 %	345304130
56950	NC_015966	TAC	2	6	2625408	2625413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304130
56951	NC_015966	GCC	2	6	2625448	2625453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304130
56952	NC_015966	GCCG	2	8	2625467	2625474	0 %	0 %	50 %	50 %	345304130
56953	NC_015966	ACG	2	6	2625493	2625498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304130
56954	NC_015966	CAG	2	6	2625528	2625533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304130
56955	NC_015966	TCC	2	6	2625547	2625552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304130
56956	NC_015966	CGG	2	6	2625562	2625567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304130
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56958	NC_015966	CGGGC	2	10	2625695	2625704	0 %	0 %	60 %	40 %	345304130
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56977	NC_015966	CCCG	2	8	2626506	2626513	0 %	0 %	25 %	75 %	345304131
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56988	NC_015966	CGT	2	6	2627076	2627081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304131
56989	NC_015966	GGT	2	6	2627104	2627109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304131
56990	NC_015966	GGC	3	9	2627147	2627155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304132
56991	NC_015966	GATC	2	8	2627167	2627174	25 %	25 %	25 %	25 %	345304132
56992	NC_015966	GC	4	8	2627208	2627215	0 %	0 %	50 %	50 %	345304132
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56994	NC_015966	GGCG	2	8	2627248	2627255	0 %	0 %	75 %	25 %	345304132
56995	NC_015966	CGG	2	6	2627286	2627291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304132
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