MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_015966	GAC	2	6	2585538	2585543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304091
56002	NC_015966	ACG	2	6	2585593	2585598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304091
56003	NC_015966	CGG	2	6	2585675	2585680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304091
56004	NC_015966	TCG	2	6	2585706	2585711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304091
56005	NC_015966	CGG	3	9	2585726	2585734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304091
56006	NC_015966	GCT	2	6	2585762	2585767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304091
56007	NC_015966	CGCC	2	8	2585794	2585801	0 %	0 %	25 %	75 %	345304091
56008	NC_015966	CTA	2	6	2585897	2585902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304091
56009	NC_015966	GCC	2	6	2585906	2585911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304091
56010	NC_015966	GCT	2	6	2585960	2585965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304091
56011	NC_015966	ACCAGG	2	12	2585992	2586003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304091
56012	NC_015966	CGA	2	6	2586137	2586142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304091
56013	NC_015966	CGCC	2	8	2586206	2586213	0 %	0 %	25 %	75 %	345304091
56014	NC_015966	GCA	2	6	2586221	2586226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304091
56015	NC_015966	TGG	2	6	2586301	2586306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304091
56016	NC_015966	GGC	2	6	2586330	2586335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304091
56017	NC_015966	TCG	3	9	2586361	2586369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304091
56018	NC_015966	CAT	2	6	2586392	2586397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304091
56019	NC_015966	CCTA	2	8	2586406	2586413	25 %	25 %	0 %	50 %	345304091
56020	NC_015966	GCT	2	6	2586479	2586484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304091
56021	NC_015966	CCA	2	6	2586532	2586537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304091
56022	NC_015966	CGC	2	6	2586771	2586776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304091
56023	NC_015966	ACA	2	6	2586787	2586792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345304091
56024	NC_015966	CGA	2	6	2586809	2586814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304091
56025	NC_015966	CGA	2	6	2586836	2586841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304091
56026	NC_015966	GGC	2	6	2586889	2586894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304091
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56028	NC_015966	CCGG	2	8	2586927	2586934	0 %	0 %	50 %	50 %	345304091
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56031	NC_015966	TCAGC	2	10	2586995	2587004	20 %	20 %	20 %	40 %	345304091
56032	NC_015966	TGG	2	6	2587012	2587017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304091
56033	NC_015966	CGC	2	6	2587029	2587034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304091
56034	NC_015966	GC	3	6	2587033	2587038	0 %	0 %	50 %	50 %	345304091
56035	NC_015966	CCGT	2	8	2587057	2587064	0 %	25 %	25 %	50 %	345304091
56036	NC_015966	CCG	2	6	2587157	2587162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304091
56037	NC_015966	ATG	2	6	2587230	2587235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304091
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56042	NC_015966	CGA	2	6	2587691	2587696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304091
56043	NC_015966	GAT	3	9	2587710	2587718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304091
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56045	NC_015966	CCCG	2	8	2587745	2587752	0 %	0 %	25 %	75 %	345304091
56046	NC_015966	ACT	2	6	2587795	2587800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304091
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56050	NC_015966	GAC	2	6	2588001	2588006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304091
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56052	NC_015966	TGG	2	6	2588185	2588190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304091
56053	NC_015966	GAG	2	6	2588226	2588231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304091
56054	NC_015966	CG	3	6	2588263	2588268	0 %	0 %	50 %	50 %	345304091
56055	NC_015966	CAA	2	6	2588285	2588290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345304091
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56059	NC_015966	TGC	2	6	2588392	2588397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304091
56060	NC_015966	CCA	2	6	2588420	2588425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304091
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56066	NC_015966	CGA	2	6	2588669	2588674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304091
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56069	NC_015966	CGC	2	6	2588863	2588868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304091
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56099	NC_015966	TGC	3	9	2590423	2590431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304091
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56345	NC_015966	GTA	2	6	2600916	2600921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304102
56346	NC_015966	GAA	2	6	2600922	2600927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304102
56347	NC_015966	GCG	2	6	2600955	2600960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304102
56348	NC_015966	GTA	3	9	2600961	2600969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304102
56349	NC_015966	GTA	4	12	2600982	2600993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304102
56350	NC_015966	TGA	2	6	2600999	2601004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304102
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56460	NC_015966	C	6	6	2605454	2605459	0 %	0 %	0 %	100 %	345304104
56461	NC_015966	CCTCCG	2	12	2605470	2605481	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	345304104
56462	NC_015966	CAT	2	6	2605599	2605604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304105
56463	NC_015966	GCT	3	9	2605622	2605630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304105
56464	NC_015966	CGA	2	6	2605670	2605675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304105
56465	NC_015966	GCC	2	6	2605746	2605751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304105
56466	NC_015966	GC	3	6	2605845	2605850	0 %	0 %	50 %	50 %	345304105
56467	NC_015966	GCG	2	6	2605864	2605869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304105
56468	NC_015966	CTG	2	6	2605870	2605875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304105
56469	NC_015966	CCA	3	9	2605886	2605894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304105
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56472	NC_015966	GCCG	2	8	2606019	2606026	0 %	0 %	50 %	50 %	345304105
56473	NC_015966	CGT	2	6	2606039	2606044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304105
56474	NC_015966	GCGG	2	8	2606073	2606080	0 %	0 %	75 %	25 %	345304105
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56476	NC_015966	CGA	2	6	2606108	2606113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304105
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56484	NC_015966	AGC	2	6	2606413	2606418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304105
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