MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_015966	GCT	2	6	2563741	2563746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304075
55502	NC_015966	ACG	2	6	2563766	2563771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304075
55503	NC_015966	GC	3	6	2563808	2563813	0 %	0 %	50 %	50 %	345304075
55504	NC_015966	TGG	2	6	2563841	2563846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304075
55505	NC_015966	GC	3	6	2563851	2563856	0 %	0 %	50 %	50 %	345304075
55506	NC_015966	GCTGG	2	10	2563945	2563954	0 %	20 %	60 %	20 %	345304075
55507	NC_015966	CCGG	2	8	2563979	2563986	0 %	0 %	50 %	50 %	345304075
55508	NC_015966	TGC	2	6	2564005	2564010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304075
55509	NC_015966	CGA	2	6	2564031	2564036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304075
55510	NC_015966	GC	3	6	2564058	2564063	0 %	0 %	50 %	50 %	345304075
55511	NC_015966	CG	3	6	2564073	2564078	0 %	0 %	50 %	50 %	345304075
55512	NC_015966	GTGG	2	8	2564128	2564135	0 %	25 %	75 %	0 %	345304075
55513	NC_015966	GCTC	2	8	2564166	2564173	0 %	25 %	25 %	50 %	345304075
55514	NC_015966	TGA	2	6	2564184	2564189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304075
55515	NC_015966	GGT	2	6	2564266	2564271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304075
55516	NC_015966	TGG	2	6	2564273	2564278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304075
55517	NC_015966	TGC	2	6	2564349	2564354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304075
55518	NC_015966	CCG	2	6	2564372	2564377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304075
55519	NC_015966	GCT	2	6	2564401	2564406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304075
55520	NC_015966	GC	3	6	2564418	2564423	0 %	0 %	50 %	50 %	345304075
55521	NC_015966	GCT	2	6	2564443	2564448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304075
55522	NC_015966	CGC	2	6	2564451	2564456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304075
55523	NC_015966	TAC	2	6	2564483	2564488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304075
55524	NC_015966	CCGA	2	8	2564497	2564504	25 %	0 %	25 %	50 %	345304075
55525	NC_015966	TGG	2	6	2564510	2564515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304075
55526	NC_015966	TCG	2	6	2564577	2564582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304075
55527	NC_015966	CAGAC	2	10	2564591	2564600	40 %	0 %	20 %	40 %	345304075
55528	NC_015966	GCC	2	6	2564640	2564645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304076
55529	NC_015966	CGA	2	6	2564651	2564656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304076
55530	NC_015966	AGA	2	6	2564666	2564671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304076
55531	NC_015966	ATC	3	9	2564682	2564690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304076
55532	NC_015966	CGC	2	6	2564692	2564697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304076
55533	NC_015966	GGGATC	2	12	2564769	2564780	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345304076
55534	NC_015966	CTG	2	6	2564793	2564798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304076
55535	NC_015966	ATC	2	6	2564805	2564810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304076
55536	NC_015966	GAG	2	6	2564835	2564840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345304076
55537	NC_015966	GCA	2	6	2564867	2564872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304076
55538	NC_015966	A	6	6	2564878	2564883	100 %	0 %	0 %	0 %	345304076
55539	NC_015966	CTG	3	9	2564968	2564976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304077
55540	NC_015966	GC	3	6	2564982	2564987	0 %	0 %	50 %	50 %	345304077
55541	NC_015966	CGA	2	6	2565027	2565032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304077
55542	NC_015966	CTG	2	6	2565053	2565058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304078
55543	NC_015966	CTG	2	6	2565062	2565067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304078
55544	NC_015966	CAA	2	6	2565068	2565073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345304078
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55548	NC_015966	TCGTT	2	10	2565135	2565144	0 %	60 %	20 %	20 %	345304078
55549	NC_015966	TGG	2	6	2565147	2565152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304078
55550	NC_015966	GCG	2	6	2565221	2565226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304079
55551	NC_015966	GGC	2	6	2565227	2565232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304079
55552	NC_015966	GGC	2	6	2565236	2565241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304079
55553	NC_015966	AGCC	2	8	2565246	2565253	25 %	0 %	25 %	50 %	345304079
55554	NC_015966	ACG	2	6	2565258	2565263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304079
55555	NC_015966	GCC	2	6	2565278	2565283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304079
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55558	NC_015966	GCCG	2	8	2565368	2565375	0 %	0 %	50 %	50 %	345304079
55559	NC_015966	CAG	2	6	2565377	2565382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304079
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55571	NC_015966	GATCTC	2	12	2565893	2565904	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345304079
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55574	NC_015966	TCCC	2	8	2566046	2566053	0 %	25 %	0 %	75 %	345304079
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55582	NC_015966	GGGC	2	8	2566386	2566393	0 %	0 %	75 %	25 %	345304080
55583	NC_015966	GGC	2	6	2566466	2566471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304080
55584	NC_015966	CG	3	6	2566472	2566477	0 %	0 %	50 %	50 %	345304080
55585	NC_015966	GGC	2	6	2566490	2566495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304080
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55590	NC_015966	CAG	2	6	2566667	2566672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304080
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55598	NC_015966	GGCTCG	2	12	2567042	2567053	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345304081
55599	NC_015966	GAT	2	6	2567056	2567061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304081
55600	NC_015966	GGCCAC	2	12	2567089	2567100	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345304081
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55602	NC_015966	TGC	2	6	2567207	2567212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304081
55603	NC_015966	TTC	2	6	2567318	2567323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304081
55604	NC_015966	CCAGAT	2	12	2567340	2567351	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345304081
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55611	NC_015966	GT	3	6	2567819	2567824	0 %	50 %	50 %	0 %	345304081
55612	NC_015966	GGCG	2	8	2567856	2567863	0 %	0 %	75 %	25 %	345304081
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55722	NC_015966	CCTT	2	8	2572996	2573003	0 %	50 %	0 %	50 %	345304084
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55727	NC_015966	CTC	2	6	2573123	2573128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304084
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