MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_015966	TCG	2	6	2540403	2540408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304060
55002	NC_015966	GAA	2	6	2540435	2540440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304060
55003	NC_015966	A	6	6	2540439	2540444	100 %	0 %	0 %	0 %	345304060
55004	NC_015966	GCA	2	6	2540449	2540454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304060
55005	NC_015966	GCA	3	9	2540470	2540478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304060
55006	NC_015966	GCCGG	2	10	2540521	2540530	0 %	0 %	60 %	40 %	345304060
55007	NC_015966	CGG	2	6	2540681	2540686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304061
55008	NC_015966	GCC	2	6	2540700	2540705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304061
55009	NC_015966	GCT	2	6	2540735	2540740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304061
55010	NC_015966	CCA	2	6	2540767	2540772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304061
55011	NC_015966	ATC	2	6	2540820	2540825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304061
55012	NC_015966	CGTG	2	8	2540836	2540843	0 %	25 %	50 %	25 %	345304061
55013	NC_015966	CGC	2	6	2540868	2540873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304061
55014	NC_015966	TCG	2	6	2540901	2540906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304061
55015	NC_015966	GCC	2	6	2541047	2541052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304061
55016	NC_015966	TTC	2	6	2541078	2541083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304061
55017	NC_015966	CTG	2	6	2541091	2541096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304061
55018	NC_015966	GAT	2	6	2541146	2541151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304062
55019	NC_015966	GATC	2	8	2541241	2541248	25 %	25 %	25 %	25 %	345304062
55020	NC_015966	CGCT	2	8	2541279	2541286	0 %	25 %	25 %	50 %	345304062
55021	NC_015966	GCT	2	6	2541289	2541294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304062
55022	NC_015966	GTA	2	6	2541335	2541340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304062
55023	NC_015966	CAGC	2	8	2541353	2541360	25 %	0 %	25 %	50 %	345304062
55024	NC_015966	GGC	2	6	2541461	2541466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304062
55025	NC_015966	GC	3	6	2541550	2541555	0 %	0 %	50 %	50 %	345304062
55026	NC_015966	GC	3	6	2541667	2541672	0 %	0 %	50 %	50 %	345304063
55027	NC_015966	CTG	2	6	2541673	2541678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304063
55028	NC_015966	CG	3	6	2541719	2541724	0 %	0 %	50 %	50 %	345304063
55029	NC_015966	GCG	3	9	2541722	2541730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304063
55030	NC_015966	TCG	2	6	2541731	2541736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304063
55031	NC_015966	GCA	2	6	2541807	2541812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304063
55032	NC_015966	CGG	2	6	2541843	2541848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304063
55033	NC_015966	CGT	2	6	2541849	2541854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304063
55034	NC_015966	TTC	2	6	2541856	2541861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304063
55035	NC_015966	CG	4	8	2541918	2541925	0 %	0 %	50 %	50 %	345304063
55036	NC_015966	AGC	2	6	2541926	2541931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304063
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55041	NC_015966	GGC	2	6	2542092	2542097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304063
55042	NC_015966	GC	3	6	2542106	2542111	0 %	0 %	50 %	50 %	345304063
55043	NC_015966	GAC	2	6	2542144	2542149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304063
55044	NC_015966	CGA	2	6	2542221	2542226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304063
55045	NC_015966	CGCC	2	8	2542251	2542258	0 %	0 %	25 %	75 %	345304063
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55050	NC_015966	GC	3	6	2542936	2542941	0 %	0 %	50 %	50 %	345304064
55051	NC_015966	TTC	2	6	2543035	2543040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304064
55052	NC_015966	CTC	2	6	2543095	2543100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304064
55053	NC_015966	GCC	2	6	2543106	2543111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304064
55054	NC_015966	CTT	2	6	2543163	2543168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304064
55055	NC_015966	GCC	2	6	2543193	2543198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304064
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55058	NC_015966	A	6	6	2543377	2543382	100 %	0 %	0 %	0 %	345304064
55059	NC_015966	ATC	2	6	2543387	2543392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304064
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55062	NC_015966	AATCG	2	10	2543485	2543494	40 %	20 %	20 %	20 %	345304064
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55069	NC_015966	CGGG	2	8	2543792	2543799	0 %	0 %	75 %	25 %	345304064
55070	NC_015966	CGGCG	2	10	2543823	2543832	0 %	0 %	60 %	40 %	345304064
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55099	NC_015966	GGCTC	2	10	2545215	2545224	0 %	20 %	40 %	40 %	345304064
55100	NC_015966	GCC	2	6	2545229	2545234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304064
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55116	NC_015966	GTA	2	6	2546482	2546487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304066
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55232	NC_015966	TGA	2	6	2551223	2551228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304068
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55452	NC_015966	TCCC	2	8	2559276	2559283	0 %	25 %	0 %	75 %	345304071
55453	NC_015966	CCG	2	6	2559295	2559300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304071
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55457	NC_015966	CAG	3	9	2559436	2559444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304071
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55459	NC_015966	CGG	2	6	2559573	2559578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304071
55460	NC_015966	AGCCC	2	10	2559746	2559755	20 %	0 %	20 %	60 %	345304071
55461	NC_015966	CGA	2	6	2559768	2559773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304071
55462	NC_015966	CGC	2	6	2559782	2559787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304071
55463	NC_015966	CTG	2	6	2559820	2559825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304071
55464	NC_015966	TCA	2	6	2559857	2559862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304071
55465	NC_015966	GAA	2	6	2559955	2559960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304071
55466	NC_015966	GTA	2	6	2560129	2560134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304072
55467	NC_015966	GCA	2	6	2560215	2560220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304072
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55471	NC_015966	AGCTGC	2	12	2560577	2560588	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345304073
55472	NC_015966	TCG	2	6	2560649	2560654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304073
55473	NC_015966	GAA	2	6	2561091	2561096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304074
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55475	NC_015966	ACG	2	6	2561181	2561186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304074
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55477	NC_015966	GCG	2	6	2561282	2561287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304074
55478	NC_015966	CGT	2	6	2561294	2561299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304074
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55480	NC_015966	GTG	2	6	2561379	2561384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304074
55481	NC_015966	GGCT	2	8	2561487	2561494	0 %	25 %	50 %	25 %	345304074
55482	NC_015966	GGCG	2	8	2561558	2561565	0 %	0 %	75 %	25 %	345304074
55483	NC_015966	CCA	2	6	2561618	2561623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304074
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55485	NC_015966	CTG	3	9	2563037	2563045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304075
55486	NC_015966	T	6	6	2563060	2563065	0 %	100 %	0 %	0 %	345304075
55487	NC_015966	CTT	2	6	2563099	2563104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304075
55488	NC_015966	TGG	2	6	2563127	2563132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304075
55489	NC_015966	GCCG	2	8	2563135	2563142	0 %	0 %	50 %	50 %	345304075
55490	NC_015966	GCTC	2	8	2563290	2563297	0 %	25 %	25 %	50 %	345304075
55491	NC_015966	TGC	2	6	2563323	2563328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304075
55492	NC_015966	CGG	2	6	2563333	2563338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304075
55493	NC_015966	CTGGG	2	10	2563403	2563412	0 %	20 %	60 %	20 %	345304075
55494	NC_015966	TGGG	2	8	2563463	2563470	0 %	25 %	75 %	0 %	345304075
55495	NC_015966	GTC	2	6	2563475	2563480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304075
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