MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_015966	CGCC	2	8	2519820	2519827	0 %	0 %	25 %	75 %	345304044
54502	NC_015966	CCA	2	6	2519841	2519846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304044
54503	NC_015966	GTCCG	2	10	2519850	2519859	0 %	20 %	40 %	40 %	345304044
54504	NC_015966	TTC	2	6	2519864	2519869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304044
54505	NC_015966	CGA	2	6	2519922	2519927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304044
54506	NC_015966	ACGGT	2	10	2520177	2520186	20 %	20 %	40 %	20 %	345304045
54507	NC_015966	GC	4	8	2520292	2520299	0 %	0 %	50 %	50 %	345304045
54508	NC_015966	CGGC	2	8	2520353	2520360	0 %	0 %	50 %	50 %	345304045
54509	NC_015966	CCA	2	6	2520437	2520442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304045
54510	NC_015966	GTG	2	6	2520486	2520491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345304045
54511	NC_015966	GGC	2	6	2520570	2520575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304045
54512	NC_015966	GGC	2	6	2520582	2520587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304045
54513	NC_015966	GGC	2	6	2520605	2520610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304045
54514	NC_015966	ACG	2	6	2520664	2520669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304045
54515	NC_015966	GCT	2	6	2520677	2520682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304045
54516	NC_015966	TCC	2	6	2520691	2520696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304045
54517	NC_015966	CGTC	2	8	2520700	2520707	0 %	25 %	25 %	50 %	345304045
54518	NC_015966	GAT	2	6	2520741	2520746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304045
54519	NC_015966	CGGC	2	8	2520748	2520755	0 %	0 %	50 %	50 %	345304045
54520	NC_015966	CCT	2	6	2520764	2520769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304045
54521	NC_015966	GGC	2	6	2520773	2520778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304045
54522	NC_015966	CG	3	6	2520791	2520796	0 %	0 %	50 %	50 %	345304045
54523	NC_015966	ACCC	2	8	2520828	2520835	25 %	0 %	0 %	75 %	345304045
54524	NC_015966	CAG	2	6	2520852	2520857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304045
54525	NC_015966	CCGC	2	8	2520868	2520875	0 %	0 %	25 %	75 %	345304045
54526	NC_015966	CGT	2	6	2520887	2520892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304045
54527	NC_015966	GCC	2	6	2520901	2520906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304045
54528	NC_015966	CGGC	2	8	2520924	2520931	0 %	0 %	50 %	50 %	345304045
54529	NC_015966	CAC	2	6	2520954	2520959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304045
54530	NC_015966	TGA	2	6	2521006	2521011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304046
54531	NC_015966	CCG	2	6	2521034	2521039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304046
54532	NC_015966	TCGGCC	2	12	2521110	2521121	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	345304046
54533	NC_015966	CTC	2	6	2521193	2521198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304046
54534	NC_015966	TTC	2	6	2521259	2521264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304046
54535	NC_015966	TGAGCA	2	12	2521288	2521299	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345304046
54536	NC_015966	CAT	2	6	2521361	2521366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345304046
54537	NC_015966	GGC	2	6	2521367	2521372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304046
54538	NC_015966	GTC	2	6	2521403	2521408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304046
54539	NC_015966	GCA	2	6	2521432	2521437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304046
54540	NC_015966	GCT	2	6	2521444	2521449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304046
54541	NC_015966	CGT	2	6	2521492	2521497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304046
54542	NC_015966	CGC	2	6	2521546	2521551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304046
54543	NC_015966	CGT	2	6	2521636	2521641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304046
54544	NC_015966	GAA	2	6	2521724	2521729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345304046
54545	NC_015966	CGT	2	6	2521804	2521809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304046
54546	NC_015966	GCA	2	6	2521975	2521980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304046
54547	NC_015966	CGA	2	6	2522044	2522049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304046
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54549	NC_015966	CAG	2	6	2522091	2522096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304046
54550	NC_015966	GCCC	2	8	2522099	2522106	0 %	0 %	25 %	75 %	345304046
54551	NC_015966	GCG	2	6	2522158	2522163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304046
54552	NC_015966	AGC	2	6	2522181	2522186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304046
54553	NC_015966	GCG	2	6	2522248	2522253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304046
54554	NC_015966	TCC	2	6	2522298	2522303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304046
54555	NC_015966	CTT	2	6	2522368	2522373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304046
54556	NC_015966	GGC	2	6	2522419	2522424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304046
54557	NC_015966	CGA	2	6	2522491	2522496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304046
54558	NC_015966	CCT	2	6	2522509	2522514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304046
54559	NC_015966	TCG	2	6	2522541	2522546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304046
54560	NC_015966	TCC	2	6	2522589	2522594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304046
54561	NC_015966	GCC	2	6	2522600	2522605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345304046
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54566	NC_015966	CTG	2	6	2522828	2522833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345304046
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54579	NC_015966	TCCCA	2	10	2523453	2523462	20 %	20 %	0 %	60 %	345304046
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54588	NC_015966	GCCG	2	8	2523995	2524002	0 %	0 %	50 %	50 %	345304047
54589	NC_015966	CGG	2	6	2524091	2524096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304047
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54601	NC_015966	GCGG	2	8	2524455	2524462	0 %	0 %	75 %	25 %	345304047
54602	NC_015966	CCA	2	6	2524481	2524486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304047
54603	NC_015966	CGTC	2	8	2524504	2524511	0 %	25 %	25 %	50 %	345304047
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54608	NC_015966	AC	3	6	2524648	2524653	50 %	0 %	0 %	50 %	345304048
54609	NC_015966	TTC	2	6	2524703	2524708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345304048
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54611	NC_015966	CGA	2	6	2524816	2524821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304048
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54614	NC_015966	CCGGT	2	10	2524925	2524934	0 %	20 %	40 %	40 %	345304048
54615	NC_015966	CCAG	2	8	2524972	2524979	25 %	0 %	25 %	50 %	345304048
54616	NC_015966	CCA	2	6	2524996	2525001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345304048
54617	NC_015966	TGAGC	2	10	2525065	2525074	20 %	20 %	40 %	20 %	345304048
54618	NC_015966	GCA	2	6	2525119	2525124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304048
54619	NC_015966	GCA	2	6	2525146	2525151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304048
54620	NC_015966	CCT	2	6	2525179	2525184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304048
54621	NC_015966	GCA	2	6	2525185	2525190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304048
54622	NC_015966	TCCG	2	8	2525243	2525250	0 %	25 %	25 %	50 %	345304048
54623	NC_015966	CAG	2	6	2525285	2525290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304048
54624	NC_015966	CTGCAC	2	12	2525312	2525323	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345304048
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54627	NC_015966	GCA	2	6	2525539	2525544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345304048
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54634	NC_015966	GCCA	2	8	2525748	2525755	25 %	0 %	25 %	50 %	345304048
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54643	NC_015966	GTGG	2	8	2525992	2525999	0 %	25 %	75 %	0 %	345304048
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54647	NC_015966	GGCG	2	8	2526298	2526305	0 %	0 %	75 %	25 %	345304049
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54726	NC_015966	GGC	2	6	2529583	2529588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345304052
54727	NC_015966	TCC	2	6	2529605	2529610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345304052
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54730	NC_015966	TGA	2	6	2529675	2529680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345304052
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